Les bactéries intestinales “liées à l’autisme”

Les microbes dans l’intestin humain sont liés à l’autisme, a montré une nouvelle étude.

En réanalysant les études existantes, les chercheurs ont pu identifier une signature microbienne qui marque personnes autistes issues de personnes neurotypiques.

Les chercheurs disent que la recherche met en évidence la nécessité de nouvelles études à long terme pour comprendre les causes sous-jacentes de l’autisme.

Des études antérieures ont montré que le microbiome, la collection de microbes qui habitent l’intestin humain, joue un rôle dans l’autisme, mais les mécanismes de ce lien sont restés confus.

Adoptant une nouvelle approche du problème, une étude publiée aujourd’hui dans Nature Neuroscience jette un nouvel éclairage sur la relation entre le microbiome et l’autisme.

Cette recherche menée par l’Initiative de recherche sur l’autisme (SFARI) de la Fondation Simons a impliqué une nouvelle analyse de dizaines d’ensembles de données précédemment publiés.

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Les résultats concordent avec une récente étude à long terme sur des personnes autistes centrée sur une intervention de traitement axée sur le microbiome.

Jamie Morton, l’un des auteurs correspondants de l’étude, qui a commencé ce travail alors qu’il était chercheur postdoctoral à la Fondation Simons, a déclaré : « Nous avons pu harmoniser des données apparemment disparates provenant de différentes études et trouver un langage commun avec lequel les unir.

«Avec cela, nous avons pu identifier une signature microbienne qui distingue les personnes autistes des personnes neurotypiques dans de nombreuses études.

“Mais le plus gros point est qu’à l’avenir, nous avons besoin d’études à long terme solides qui examinent autant d’ensembles de données que possible et comprennent comment ils changent lorsqu’il y a un [therapeutic] intervention.”

Avec 43 auteurs, cette étude a réuni des leaders de la biologie computationnelle, de l’ingénierie, de la médecine, de l’autisme et du microbiome.

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Le co-auteur Rob Knight, directeur du Center for Microbiome Innovation de l’Université de Californie à San Diego, a déclaré: «Le nombre considérable de domaines et de domaines d’expertise dans cette collaboration à grande échelle est remarquable et nécessaire pour obtenir un nouveau et cohérent image de l’autisme.

L’histoire continue

“Nous voulions aborder la question en constante évolution de la façon dont le microbiome est associé à l’autisme, et nous nous sommes dit : ‘revenons aux ensembles de données existants et voyons combien d’informations nous pourrions en tirer'”.

Dans la nouvelle étude, l’équipe de recherche a développé un algorithme pour réanalyser 25 ensembles de données précédemment publiés contenant le microbiome et d’autres informations «omiques» – telles que l’expression des gènes, la réponse du système immunitaire et le régime alimentaire – des cohortes autistes et neurotypiques.

Dans chaque ensemble de données, l’algorithme a trouvé les meilleures paires d’individus autistes et neurotypiques en termes d’âge et de sexe, deux facteurs qui peuvent généralement confondre les études sur l’autisme.

À la surprise des chercheurs, leur analyse a identifié des voies métaboliques spécifiques à l’autisme associées à des microbes intestinaux humains particuliers.

Il est important de noter que ces voies ont également été observées ailleurs chez les personnes autistes, de leurs profils d’expression génique associés au cerveau à leur régime alimentaire.

Surtout, les chercheurs disent que ces découvertes vont au-delà de l’autisme.

L’approche présentée ici pourrait également être utilisée dans d’autres domaines de la biomédecine qui se sont longtemps avérés difficiles.

“Avant cela, nous avions de la fumée indiquant que le microbiome était impliqué dans l’autisme, et maintenant nous avons le feu. Nous pouvons appliquer cette approche à de nombreux autres domaines, de la dépression à la maladie de Parkinson en passant par le cancer, où nous pensons que le microbiome joue un rôle, mais où nous ne savons pas encore exactement quel est ce rôle », déclare Knight.

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