Une étude sur le microbiome fournit de nouveaux indices sur la pathologie courante des affections inflammatoires

Une altération de la diversité du microbiome intestinal s’est produite chez des patients atteints de trois affections inflammatoires différentes, suggérant une pathologie commune, a montré le séquençage prospectif de l’ARNr des échantillons de selles des patients.

Les patients atteints de spondyloarthrite axiale (SpA), d’uvéite antérieure aiguë (AAU) et de la maladie de Crohn présentaient une faible concentration de Lachnospiraceae par rapport à un groupe témoin de patients souffrant de douleurs dorsales et sans troubles inflammatoires. La différence la plus frappante était une faible abondance de Fusicatenibacter chez les utilisateurs d’anti-inflammatoires non stéroïdiens (AINS) du groupe témoin par rapport aux patients atteints de maladies inflammatoires. L’analyse a également révélé des différences spécifiques à la maladie dans la diversité du microbiome.

Des proportions substantielles de patients atteints d’AUA et de la maladie de Crohn ont reçu des diagnostics concomitants de SpA, soutenant le concept de pathologie inflammatoire partagée, ont rapporté Sofia K. Forslund, PhD, du Max Delbrück Center for Molecular Medicine à Berlin, et coauteurs de Arthrite et rhumatologie.

“Pris ensemble, nos résultats suggèrent qu’il reste encore beaucoup à découvrir sur les propriétés immunomodulatrices de certaines bactéries dans ces pathologies épidémiologiquement liées, en particulier au niveau moléculaire, afin de tirer éventuellement parti du potentiel diagnostique et thérapeutique du microbiome”, les auteurs déclaré. “Des travaux expérimentaux sont nécessaires pour valider nos découvertes, en particulier celles qui ont identifié des médiateurs potentiels de l’inflammation ou de l’activité de la maladie.”

L’étude a ajouté à la discussion scientifique sur la relation entre les conditions inflammatoires, mais est allée au-delà de nombreuses enquêtes précédentes en examinant le microbiome intestinal à la recherche d’indices potentiels sur la pathologie commune. L’association entre SpA et AAU est bien établie. Des études antérieures ont montré que jusqu’à un tiers des patients atteints de SpA ont une AAU concomitante, ce qui en fait la manifestation extra-musculo-squelettique la plus courante de la SpA.

Un étude récenteaussi dans Arthrite et rhumatologie, ont montré qu’une majorité de 189 patients atteints d’AUA avaient une SpA concomitante, qui n’avait pas été diagnostiquée dans 70 % des cas. L’étude a également montré une précédemment documenté lien entre l’uvéite, la SpA et la positivité HLA-B27. “Sur la base de ces résultats, il peut être recommandé que tous les patients atteints d’AUA qui déclarent éprouver des symptômes musculo-squelettiques soient référés à un rhumatologue pour une évaluation plus approfondie”, ont conclu les chercheurs de cet article.

Forslund et ses collègues ont noté que la SpA, l’AUA et la maladie de Crohn ont “une association bien documentée, mais les mécanismes physiopathologiques sous-jacents ne sont pas encore entièrement compris, malgré des décennies de recherche”. Il y a plus de 30 ans les chercheurs ont émis l’hypothèse que l’arthrite réactive (partageant le lien génétique avec HLA-B27) pourrait être déclenchée par une infection gastro-intestinale.

Le microbiome intestinal offre une voie prometteuse pour mieux comprendre la physiopathologie partagée et distincte de la SpA, de l’AUA et de la maladie de Crohn, ont poursuivi les auteurs. La composition persistante du microbiote dysbiotique réduit la résistance et la résilience du microbiome intestinal et peut altérer l’intégrité de la barrière épithéliale et augmenter la perméabilité intestinale, entraînant une phénomène de “fuite intestinale” qui peuvent provoquer une inflammation associée à des maladies à médiation immunitaire.

Pour examiner le microbiome intestinal à la recherche de signaux de maladies microbiennes, les chercheurs ont effectué un séquençage d’ARNr sur des échantillons de selles de 72 patients atteints de la maladie de Crohn, 103 d’AAU et 102 de SpA, ainsi qu’un groupe témoin de 62 patients souffrant de maux de dos sans aucun trouble inflammatoire. Les données cliniques ont montré que 53,4 % des patients atteints d’AUA avaient une SpA concomitante (principalement axiale), de même que 16,7 % des patients atteints de la maladie de Crohn. De plus, 15,3 % des patients atteints de la maladie de Crohn et 21,6 % des patients atteints de SpA avaient des antécédents d’AUA.

Le séquençage de l’ARNr a montré que les quatre groupes de patients avaient un microbiote similaire, dominé par les Firmicutes, suivi des Bacteroidota, Actinobacteriota et Proteobacteria. Les enquêteurs ont noté une plus grande diversité interindividuelle au niveau du genre dans les quatre cohortes. Le groupe témoin, la cohorte AAU et la cohorte SpA avaient plus Prévotelle-individus dominants, alors que les patients atteints de la maladie de Crohn avaient la plus forte proportion de Bacteroides-individus dominants.

Afin d’identifier les médiateurs potentiels de la concomitance entre la SpA, l’AUA et la maladie de Crohn, les chercheurs ont effectué une analyse d’abondance différentielle. Ils ont trouvé des abondances plus faibles de plusieurs Firmicutes dans tous les groupes de maladies, principalement des variants de séquence d’amplicon (ASV) appartenant à la famille des Lachnospiraceae.

Le groupe SpA avait des abondances plus élevées de Collinselle et plusieurs ASV de Lachnospiraceae. La cohorte de Crohn s’est enrichie d’un Ruminocoque ASV et fortement appauvri dans un humide ASV. Aucun ASV ou taxon de niveau supérieur n’avait d’association significative avec le phénotype AAU.

“Bien que nous n’ayons pas observé de signal fort de microbiote chez nos patients AAU uniquement, nos résultats suggèrent que les patients AAU avec SpA concomitante … sont plus similaires aux patients SpA uniquement que les témoins négatifs pour la maladie”, ont déclaré les auteurs. “Les études d’association cherchant à lier le microbiote HLA-B27+ à une compréhension clinique existante de ces maladies devraient donner la priorité à l’inclusion de groupes non-SpA HLA-B27+ pour des comparaisons plus précises.”