Des chercheurs ont créé une base de données contenant les gènes humains les plus mystérieux

Des chercheurs britanniques ont compilé un recueil contenant des milliers de protéines sous-étudiées codées par des gènes du génome humain, dont le rôle est largement inconnu. Cette base de données d’accès public a été appelée “unknome” ou le génome inconnu.

Dans un effort pour en savoir plus sur le code génétique humain, une équipe de scientifiques a créé une base de données contenant des informations sur les gènes dont les connaissances sont actuellement limitées. Bien que l’on sache que ces gènes existent et codent pour des protéines, leurs fonctions sont encore largement énigmatiques.

“Il est clair que la recherche scientifique s’est concentrée sur des protéines bien étudiées, ce qui a fait craindre que des gènes moins étudiés soient négligés de manière injustifiée”expliquent des experts du Laboratoire de biologie moléculaire MRC au Royaume-Uni.

Le laboratoire a créé une base de données appelée “Unknome” qui est publique et personnalisable pour résoudre ce problème.

Deux décennies après la publication de la première version de la séquence du génome humain, qui comprenait des dizaines de milliers de gènes, les connaissances ont considérablement progressé grâce à des techniques avancées telles que CRISPR. Cependant, il existe encore des dizaines de milliers de gènes qui restent largement un mystère.

Il y a plusieurs raisons pour lesquelles ces gènes ont été négligés par la communauté scientifique jusqu’à présent, explique l’expert en biologie moléculaire João Rocha. Il s’agit notamment des limites de financement et du système d’examen par les pairs, qui s’est davantage concentré sur le soutien à la recherche sur des gènes d’importance clinique déjà prouvée ou sur des gènes plus abondants ou communs chez les espèces utilisées dans les expériences de laboratoire.

Cette base de données classe les gènes de protéines en fonction du faible niveau de connaissances chez les humains et les autres espèces de laboratoire courantes.

Pour démontrer l’utilité de cette base de données, les chercheurs ont sélectionné 260 gènes humains avec des niveaux élevés d’inconnu et ont effectué des expériences similaires dans le génome de la mouche de laboratoire, Drosophila.

En supprimant systématiquement les gènes communs des mouches au cours du développement, il a été constaté que de nombreuses mouches ne survivaient pas, démontrant que les protéines codées par ces gènes jouent un rôle crucial dans la biologie animale.

“Les gènes inexplorés ne doivent pas être ignorés”États Sean Munrospécialiste de biologie moléculaire.

En limitant l’expression des gènes à certains tissus des drosophiles, les chercheurs ont pu révéler certaines de leurs fonctions, associant certains gènes à la fertilité, au développement et aux réponses au stress des mâles.

L’équipe conclut que l’identification et la classification de ces gènes pourraient accélérer les progrès scientifiques et que la base de données Unknome fournit une plate-forme puissante, polyvalente et efficace pour étudier les gènes de fonction inconnue et combler les lacunes biologiques actuelles. Cette recherche a été publiée mardi dans la revue PLoS Biology.

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