L’un des plus grands avantages du SRAS-CoV-2, le virus qui a déclenché la pandémie de Covid-19, était la vitesse intense à laquelle il muterait en de nouvelles variantes faisant des ravages à l’échelle mondiale, tuant des millions de personnes à travers le monde.
Les scientifiques ont maintenant développé une nouvelle technologie qui a découvert le mécanisme sous-jacent qui leur a permis de calculer le taux de mutation du SRAS-CoV-2.
Dans une étude publiée dans Nature Microbiology, des chercheurs du Baylor College of Medicine ont détaillé le développement d’une nouvelle technologie appelée tARC-seq, qui a révélé un mécanisme génétique affectant la divergence du SRAS-CoV-2.
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Grâce à la nouvelle technologie, l’équipe a également capturé de nouvelles mutations du SRAS-CoV-2 dans des cellules infectées en laboratoire, récapitulant les observations révélées par les données de séquençage viral pandémique mondiales.
« Le virus SARS-CoV-2 utilise l’ARN, au lieu de l’ADN, pour stocker ses informations génétiques. Notre laboratoire s’intéresse depuis longtemps à l’étude de la biologie de l’ARN, et lorsque le SRAS-CoV-2 est apparu, nous avons décidé d’étudier son processus de réplication de l’ARN, qui est généralement sujet aux erreurs dans les virus à ARN », a déclaré l’auteur correspondant, le Dr Christophe Herman.
Ils ont identifié des points chauds de mutation, notamment dans l’ARN de la protéine Spike. (Photo : AP)
Les chercheurs visaient à suivre les erreurs de réplication de l’ARN dans le SRAS-CoV-2 afin de comprendre son évolution et son adaptation dans les populations humaines. Les méthodes existantes avaient du mal à détecter des mutations rares dans des échantillons présentant un faible nombre de virus.
Herman, du Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center, a présenté le séquençage ciblé et précis du consensus d’ARN (tARC-seq). Cette technique identifie avec précision les erreurs de réplication de l’ARN dans les échantillons en faible abondance.
Au départ, on pensait que le SRAS-CoV-2 ne muterait pas rapidement en raison de son mécanisme d’auto-réparation. Cependant, de nombreuses variantes sont apparues dans le monde, notamment Alpha, Beta, Delta et Omicron. L’équipe d’Herman, armée du tARC-seq, a déterminé des taux de mutation plus élevés que prévu, expliquant l’émergence de variantes.
Ils ont identifié des points chauds de mutation, notamment dans l’ARN de la protéine Spike, cruciale pour l’entrée du virus et la composition du vaccin. tARC-seq a dévoilé la commutation de modèles, où le virus saute entre les modèles d’ARN pendant la réplication, conduisant à des mutations complexes et à une variabilité accrue.
Herman a noté la capacité de tARC-seq à surveiller les mutations dans les cultures de laboratoire et les échantillons cliniques, ce qui est essentiel pour comprendre l’évolution virale. Cette technologie fournit un aperçu de la dynamique des mutations, contribuant ainsi à la surveillance des pandémies et au développement de vaccins.
Publié par:
Sibu Kumar Tripathi
Publié sur :
23 avril 2024
2024-04-23 12:33:57
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