Cas groupés
La patiente 1 était une femme de 60 ans qui travaillait dans une ferme de visons dans le comté de Wendeng. Le 17 octobre, elle a développé des vomissements, des étourdissements et de la fatigue et s’est auto-médicamentée avec de la poudre de Montmorillonite à la maison. Ses symptômes se sont aggravés et on lui a diagnostiqué une « perte de conscience devant être examinée » à l’hôpital A le 19 octobre. Les résultats de laboratoire ont révélé un nombre de globules blancs (WBC) et de plaquettes de 2,47 × 109/L et 61 × 109/L, respectivement. La créatine kinase, la lactique déshydrogénase, l’AST, l’ALT, la créatinine et les protéines urinaires étaient respectivement de 1 873 U/L, 1 427 U/L, 790 U/L, 169 U/L, 303 U/L et 3+ (Tableau 1). . Les résultats des tests ont montré une possible altération des organes de son cœur, de son foie et de ses reins et elle a été transférée à l’unité de soins intensifs. Sur la base de la prévalence du SFTS dans le comté de Wendeng et des résultats de laboratoire du patient, le médecin a soupçonné que le patient était infecté par le SFTSV. Le 21 octobre, le patient a été testé pour le SFTSV et le nombre de copies du SFTSV était de 3,7 × 104 TCID50/mL. Le même jour, sa collègue a également reçu un diagnostic de SFTS. Par la suite, sa numération plaquettaire est tombée en dessous des niveaux d’admission (35 × 109/L). Compte tenu de son mauvais état, ses proches ont décidé de la ramener chez elle le 25 octobre après avoir reçu un diagnostic d’encéphalite grave et de SFTS, et elle est décédée le même jour.
Le patient 2 était un collègue du patient 1 mais ils ne vivaient pas dans le même village. Elle est devenue fiévreuse le 15 octobre accompagnée de frissons, de fatigue et de courbatures. Le patient avait une température corporelle maximale de 38 ℃ et des granules d’ibuprofène auto-administrés et des granules de Lianhua Qingwen à la maison. Le 18 octobre, elle s’est rendue à l’hôpital municipal où on lui a diagnostiqué une « granulocytopénie ». Le 20 octobre, elle a été transférée à l’hôpital A où on lui a diagnostiqué une « fièvre d’origine inconnue ». Les résultats de laboratoire ont révélé un nombre de globules blancs (WBC) et de plaquettes de 1,98 × 109/L et 96 × 109/L respectivement. Les valeurs de créatine kinase, lactique déshydrogénase, AST, ALT, créatinine et protéines urinaires étaient respectivement de 316 U/L, 366 U/L, 62 U/L, 37 U/L, 82 U/L et négatives le 21 octobre. a reçu un diagnostic de SFTS le même jour que le patient 1 et le nombre de copies du SFTSV était de 1,2 × 104 TCID50/mL (Tableau 1). Elle a reçu de la Ribavirine et un traitement de soutien, après quoi son état s’est amélioré de plus en plus. Elle a été libérée le 6 novembre.
Tableau 1 Informations de laboratoire sérique des 2 patients atteints de SFTS
Enquêtes épidémiologiques
Selon les spécifications techniques pour la surveillance en Chine, les cas groupés sont définis comme 2 cas ou plus survenant au même endroit dans un délai de 2 semaines. Les deux patients travaillaient dans la même ferme et ont reçu un diagnostic de SFTS le même jour. Ils ont donc été définis comme des cas groupés et des enquêtes épidémiologiques ont été menées pour trouver la voie de transmission potentielle des deux patients. L’enquête épidémiologique a montré que les deux patients n’avaient pas d’antécédents de morsures de tiques ni de cicatrices de morsures de tiques avant l’apparition du SFTS. Leur travail régulier dans la ferme de visons consistait à nourrir les animaux de la ferme avec des chariots d’alimentation dédiés et parfois ils écorchaient également les animaux mourants. Ils peuvent être griffés par des animaux ou entrer en contact direct avec du sang animal pendant le travail, mais ils n’ont qu’une faible conscience des moyens de se protéger pendant le travail. La ferme a ensuite été inspectée.
La ferme de visons était située à 1 km au nord-est du village de Houjia, ville de Houjia, comté de Wendeng, où étaient élevés plus de 6 000 visons, 10 000 renards et 500 chiens viverrins. Divers animaux étaient élevés dans différentes zones et l’ensemble du champ était divisé en 6 zones. Les zones A, B, E et F étaient situées du côté sud de la porte, avec 11 rangées dans chaque zone. Parmi celles-ci, les zones A et B étaient destinées à l’élevage des visons et les zones E et F à l’élevage des renards ; La zone G était située du côté nord de la porte, avec un total de 18 rangées, pour l’élevage des renards ; La zone H était située du côté nord de la zone G, avec un total de 4 rangées, pour l’élevage de chiens viverrins (Fig. 1). Il y avait plus de 20 employés sur la ferme, chacun étant chargé d’élever, de nettoyer et de désinfecter les animaux dans une certaine zone, ainsi que d’écorcher les animaux mourants.
La zone de travail du Patient 1 était A3 et celle du Patient 2 était E5. Les ouvriers nourrissaient les animaux automatiquement sur des chariots électriques, avec un minimum de contact avec les animaux. Pendant le processus d’écorchage des animaux, il peut y avoir un contact avec les animaux, entraînant la possibilité d’être griffé ou mordu. 22 ouvriers qui travaillaient dans l’élevage de visons pendant de nombreuses années ont fait l’objet d’une enquête. 17 d’entre eux avaient été griffés ou mordus par des renards ou des visons alors qu’ils écorchaient les animaux mourants. La zone d’écorchage était un espace ouvert devant la porte à l’extérieur du lieu, pour l’écorchage des animaux dans tout le lieu (Fig. 2). Les travailleurs portaient des équipements de protection tels que des tabliers, des gants et des masques lors de l’écorchage des animaux, mais la protection n’était pas standardisée, ce qui présentait un risque d’infection.
Fig. 1
Le plan de la ferme de visons. Les zones A et B étaient destinées à l’élevage des visons ; Les zones E, F et G étaient destinées à l’élevage des renards ; La zone H était destinée à l’élevage de chiens viverrins. La zone de travail du Patient 1 était A3 et celle du Patient 2 était E5. Les espaces verts étaient des prairies
Figure 2
maison-cage (A, B); chariot d’alimentation automatique (C) ; l’aire d’abattage (D)
Collecte de tiques
Une surveillance antérieure des tiques a montré la répartition de Haemaphysalis Longicornis dans la ville de Houjia. Une tentative de collecte de tiques a été faite dans l’élevage de visons et dans les champs proches du domicile des patients du 24 au 31 octobre, mais aucune tique n’a été capturée. Aucune tique n’a non plus été trouvée sur les corps des animaux.
Détection de virus
Une PCR en temps réel a été réalisée sur 22 travailleurs, dont les résultats ont montré qu’aucun d’entre eux n’était positif au SFTSV, mais 54,55 % (12/22) d’entre eux étaient positifs aux anticorps du SFTSV. À l’exception d’un travailleur testé positif aux IgM spécifiques du SFTSV, tous les autres ont été testés positifs aux IgG spécifiques du SFTSV, ce qui a été considéré comme une infection antérieure. 2 membres de la famille ont été testés négatifs pour le SFTSV. Deux renards étaient positifs au SFTSV mais négatifs aux IgM et IgG, ce qui était considéré comme une infection récente. Cinq échantillons environnementaux de dépouillement d’animaux ont été prélevés pour la PCR en temps réel, dont les résultats ont montré que tous les échantillons environnementaux étaient positifs pour le SFTSV, tandis que sept autres échantillons environnementaux des zones A, B, F et F étaient négatifs pour le SFTSV (Tableau 2).
Tableau 2 Résultats des tests PCR en temps réel des patients, des renards et des environnements
Analyses phylogénétiques
Au total, 8 échantillons de séquences génomiques entières du SFTSV ont été obtenus, dont 2 échantillons de patients, 2 échantillons de renards et 4 échantillons environnementaux provenant d’un élevage de visons. En analysant les séquences des segments L, M et S de 8 échantillons, il a été constaté que 6 échantillons sur 8, dont Patient1, Patient2, fox1, E1, E2 et E5, présentaient une homologie élevée. Des analyses de distance par paires ont montré que les diversités de mutations de nucléotides uniques entre ces 6 séquences ne dépassaient pas 4 sites (plage : 0 à 4 SNP). L’homologie des nucléotides entre ces 6 échantillons s’élevait à 99,9 %. De plus, l’analyse phylogénétique des segments L, M et S a également montré que les 6 échantillons appartenaient à la même branche. Ces résultats ont indiqué que le SFTSV dans les 6 échantillons appartenait à la même source (Fig. 3).
Figure 3
Le pourcentage d’homologie et la distance par paire de 8 séquences SFTSV dans cette épidémie pour les segments L(A), M(B), S(C). HB29 (NC_018136.1,NC_018138.1,NC_018137.1 pour les segments L, M,S) a été utilisé comme référence
En raison de l’absence actuelle d’une méthode de classification unifiée pour les sous-types du gène SFTSV, ces 8 échantillons ont été classés selon la méthode de classification de Tomoki Yoshikawa. [15]. L’analyse phylogénétique a montré que 6 séquences, dont Patient1, Patient2, fox1, E1, E2 et E5, appartenaient aux sous-types du gène C1 et formaient un cluster dans l’arbre phylogénétique. La séquence de fox2 appartenait également aux sous-types du gène C1, mais il existait des différences significatives dans les sites de mutation par rapport aux six échantillons. Ils n’appartenaient donc pas au même cluster. Ces 7 séquences appartenaient au même sous-type de gène que celles téléchargées du Shandong en 2010 (HM802202, HM802203, HM802204) et du Jiangsu en 2010 (HQ141604, HQ141605, HQ141606). Selon les résultats du typage génétique, la séquence E3 appartenait aux sous-types du gène C3. Les segments L et S de E3 appartenaient à la même branche que les séquences téléchargées depuis la province du Liaoning en 2012 (KF887443, KF887433) (Fig. 4).
Figure 4
Les arbres phylogénétiques du génome du SFTSV pour les segments L(A), M(B), S(C). Les noms de taxons marqués de triangles rouges sont les séquences de cette épidémie. Les séquences du virus Heartland utilisées comme sous-groupes n’étaient pas représentées dans les figures. Certains sous-arbres qui n’affectent pas le typage ont été compressés avec des triangles noirs.
Facteurs de risque de transmission du SFTSV
Pour évaluer les facteurs de risque de transmission du SFTSV, une étude cas-témoins a été menée auprès de 22 travailleurs. 12 travailleurs positifs aux anticorps SFTSV ont été classés dans le groupe des cas, et 10 travailleurs négatifs aux anticorps SFTSV ont été classés dans le groupe témoin. Comme le montre le tableau 3, le contact direct avec le sang animal et les morsures d’animaux ne sont pas associés au SFTS.
Tableau 3 Évaluation des facteurs de risque de transmission du SFTSV
2024-05-17 13:43:00
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