Nouvelles révélations sur l’influence des gènes sur le risque de cancer

La plupart des études génétiques en oncologie ont concentré leurs efforts sur l’étude des altérations qui ont un effet direct sur les gènes codant pour les protéines. Cependant, on estime qu’environ 90 % des variantes génétiques liées au cancer se trouvent dans des régions non codantes, qui peuvent réguler et affecter indirectement l’activité des gènes. Ceux-ci n’ont pas été autant étudiés car, comme ils ne codent pas pour les protéines, il est très difficile de déterminer comment ils influencent et affectent l’évolution de la maladie. En ce sens, ils restent un mystère pour la communauté scientifique.

Cependant, maintenant, une équipe de chercheurs du SZBL (Shenzhen Bay Laboratory) en Chine dirigée par Lei Li, en collaboration avec le groupe IDIBELL sur la régulation des gènes de l’identité cellulaire dirigé par le Dr Mireya Plass, est allée plus loin pour tenter de le faire. comprendre l’impact de ces régions sur le risque et le développement du cancer. Cette collaboration a donné lieu à une publication dans la revue académique Nature Communications, dont le premier auteur est Hui Chen, doctorant issu du programme commun entre les deux institutions.

L’IDIBELL (Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge) est situé à Hospitalet de Llobregat et est l’une des institutions CERCA de la Generalitat de Catalunya.

Les auteurs de l’étude ont analysé le rôle crucial des variants trouvés dans les régions non codantes, en se concentrant particulièrement sur ceux qui participent à un processus biochimique appelé polyadénylation alternative (APA). Dans l’étude, ils ont identifié des centaines de ces variantes impliquées dans les processus de croissance tumorale et de mort cellulaire, ce qui impliquerait un rôle déterminant dans le développement du cancer. La plupart d’entre eux ont été associés aux cancers du sein et de la prostate et 62 % n’avaient pas été retrouvés dans des études antérieures. Le fait qu’un pourcentage aussi élevé corresponde à des découvertes complètement nouvelles démontre le grand potentiel de l’analyse de ces variantes pour découvrir de nouveaux facteurs de risque de cancer, révélant de nouveaux mécanismes par lesquels la génétique peut contribuer à l’apparition du cancer et à son développement.

Deux membres de l’équipe de recherche. (Photo : IDIBELL)

Pour orienter l’étude et valider son utilité avec un cas précis, l’équipe de chercheurs s’est concentrée sur l’analyse des variants qui affectent le gène CRLS1, notamment liés au cancer du sein. Comme prévu, ils ont corroboré que les variantes qui modifient le processus APA ont un impact sur l’abondance de la protéine dérivée de CRLS1, augmentant considérablement sa quantité, ce qui a été associé à un risque accru de cancer du sein.

L’étude a pour titre « Une classe distincte de gènes de susceptibilité pan-cancer révélée par une étude d’association alternative à l’échelle du transcriptome de polyadénylation ». (Source : IDIBELL)