JMTV a été détecté dans les tiques R. microplus et D. nitens collectées sur des bovins, ainsi que dans A. dissimile collectées sur des iguanes dans les Caraïbes colombiennes (Tableau 1). Il s’agit de la troisième étude JMTV sur R. microplus et du premier signalement de virus sur D. nitens et A. dissimile en Colombie.
JMTV a été identifié pour la première fois chez des tiques R. microplus dans la région de Jingmen, province du Hubei, en Chine, en 2010. [5]puis en 2012 en Ouganda, JMTV a été détecté par NGS dans le plasma d’un singe colobe roux (Procolobus rufomitratus) [19]. Entre 2013 et 2015, 12 échantillons de sérum humain collectés au Kosovo ont été analysés et des patients atteints de CCHF co-infectés par JMTV ont été détectés. [21]. Entre 2014 et 2016, en France, aux Antilles françaises, en République démocratique populaire du Laos et au Cambodge, JMTV a été détecté chez Ixodes ricinus, R. microplus, Amblyomma testudinarium et des chauves-souris, respectivement. [9]. En 2017, JMTV a été isolé dans des cellules BME/CTVM23. NGS a séquencé l’intégralité du génome d’Amblyomma javanense collecté sur des pangolins chinois [4]. La même année, des patients humains positifs au JMV ont été signalés en Chine. L’infection a été confirmée par test RT-PCR dans le sang de 86 patients présentant de la fièvre, des maux de tête et des antécédents de morsures de tiques. Les tests sérologiques ont montré une séroconversion chez 19 patients [22]. Au Kenya, entre 2013 et 2019, des tiques des espèces Amblyomma et Rhipicephalus ont été collectées et JMTV a été détecté par PCR et NGS. [11].
Récemment, en 2023, en Chine, JMTV a été détecté chez les tiques R. microplus via NGS (MGISEQ-2000), ce que la PCR a confirmé, et le génome complet a été obtenu par séquençage de Sanger. [8]. En outre, ils ont détecté JMTV chez I. ricinus en Pologne et en Géorgie par NGS (nanopore) et PCR. [3].
En Amérique latine, il existe quelques reportages de JMTV. Au Brésil, entre 2015 et 2016, des génomes complets et partiels du JMTV ont été obtenus par séquençage à haut débit dans 67 % (4/6) des pools de tiques et 14 % (5/36) des sérums bovins. [10]. En Colombie, dans le département d’Antioquía, entre 2013 et 2018, plusieurs segments JMTV ont été détectés par NGS chez des tiques du genre Rhiphicephalus [16, 17]. De nombreux reportages JMTV avec NGS effectuent une confirmation avec PCR ; cependant, dans cette étude, des génomes complets ont été récupérés. Une confirmation n’était donc pas nécessaire.
JMTV a une distribution mondiale et a été détecté dans six genres de tiques : Rhipicephalus, Amblyomma, Dermacentor, Haemaphysalis, Hyalomma et Ixodes, et 26 espèces. [7, 37]. Ce travail fournit deux nouvelles espèces de tiques où JMTV a été détecté : D. nitens et A. dissimile. Cependant, R. linnaei s’est révélé négatif malgré de précédents rapports positifs pour cette espèce de tique. [5].
Il est intéressant de noter que dans le présent travail, JMTV a été détecté chez D. nitens parasitant les bovins, ce qui suggère une transmission aux bovins par ces espèces de tiques, étant donné qu’il existe des rapports faisant état de ce virus chez des bovins du Brésil. [10]. Cette constatation indique un risque probable de transmission à différentes espèces de tiques, d’animaux et d’humains.
Les analyses phylogénétiques de cinq protéines JMTV ont montré que, dans quatre des arbres obtenus (Fig. 2, arbre A, C – E), la plupart des virus étaient regroupés en deux groupes, l’un d’eux étant associé à différentes espèces de chauves-souris et de tiques et l’autre avec des humains et différentes espèces de tiques.
Fait intéressant, nos séquences des arbres NSP1, VP2 et VP3 ont été placées dans un clade étroitement lié aux JMTV détectés chez les humains du Kosovo. [21]. C’est un constat qui devrait alerter la communauté médicale des régions tropicales de Colombie.
Compte tenu du lien étroit entre la seule séquence de JMTV identifiée chez A. albopictus en Italie et la souche caractérisée dans la présente étude (Fig. 2, arbre A), il est nécessaire d’effectuer une surveillance épidémiologique du JMTV chez les moustiques des zones tropicales de Colombie. .
Malheureusement, pour les analyses phylogénétiques, seul le VP1 de JMTV signalé précédemment en Colombie a pu être inclus compte tenu de la disponibilité limitée des données ; cependant, il présente une relation phylogénétique élevée avec le JMTV détecté chez D. nitens de Cesar, rapporté dans la présente étude.
Il est nécessaire de développer des tests sérologiques avec les segments exclusifs du JMTV circulant pour éviter les réactions croisées avec d’autres flavivirus endémiques et générer des outils pour contribuer au diagnostic du syndrome fébrile sans foyer apparent.
2024-06-25 16:31:29
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