La plus grande analyse génétique du cancer colorectal révèle des dommages à l’ADN causés par le tabac et les bactéries intestinales | Science

La vie peut dépendre d’une seule lettre. Une personne est composée d’environ 30 000 milliards de cellules, qui agissent comme une équipe avec une synchronisation inconcevable. Chaque type de cellule – neurone dans le cerveau, globule rouge, entérocytes dans l’intestin – exécute sa fonction grâce à un manuel d’ADN à l’intérieur, écrit avec environ 3 000 millions de lettres (ATGGCGAGT…). Chaque lettre est simplement l’initiale d’un composé chimique contenant différentes quantités de carbone, d’hydrogène, d’oxygène et d’azote. Le T est la thymine (C₅H₆N₂O₂). Le G est la guanine (C₅H₅N₅O). Il suffit d’un changement dans l’une de ces lettres pour que la cellule devienne cancéreuse, se multipliant de manière folle et invasive. Seul le cancer colorectal, souvent dû à un entérocyte incontrôlé, entraîne la mort. près d’un million de personnes chaque année dans le monde. Ce mercredi, le étude génétique plus approfondie jamais réalisée sur cette tumeur révèle ses erreurs fatales dans l’ADN.

Les auteurs ont analysé le génome complet, lettre par lettre, de plus de 2 000 cancers du côlon et du rectum, provenant de patients du Projet 100 000 génomes, une initiative britannique visant à lire l’ADN des cellules cancéreuses ou atteintes de maladies rares. Le biologiste computationnel Claudia Arnédo, né il y a 30 ans à Castellón de la Plana, a participé aux travaux. « Nous avons pu décrire à ce jour l’ensemble le plus complet de signatures mutationnelles du cancer colorectal », se félicite-t-il. Les signatures mutationnelles sont des altérations de la séquence de lettres, dues à un mécanisme spécifique. Par exemple, le soi-disant SBS4 (de l’anglais substitution d’une seule basela substitution d’une seule lettre) est causée par la consommation de tabac.

Arnedo, auparavant à l’Institut de Recherche Biomédicale de Barcelone et maintenant à l’Université de Cambridge, rappelons qu’environ 100 signatures mutationnelles ont été identifiées, la plupart d’origine inconnue. La nouvelle étude a révélé l’importance du SBS93, caractérisé par des changements d’un T (C₅H₆N₂O₂) à un C (C₄H₅N₃O) et d’un T à un G (C₅H₅N₅O). « Le SBS93 a déjà été associé à des cancers de l’œsophage et de l’estomac, mais sa cause est inconnue. Dans notre étude, nous avons constaté que SBS93 est l’une des signatures mutationnelles les plus courantes dans le cancer du côlon, en particulier dans les tumeurs présentant une stabilité microsatellite, qui sont les plus courantes », explique Arnedo.

SBS93 est apparu dans une tumeur analysée sur trois, en particulier chez celles diagnostiquées à un âge plus jeune. “Nous ne connaissons pas encore le mécanisme qui le provoque, mais nous avons identifié qu’il a tendance à se produire avec d’autres signatures mutationnelles, y compris certaines de celles qui ont été associées à la consommation d’alcool et de tabac, ce qui suggère que SBS93 pourrait avoir une origine similaire. “, souligne le scientifique.

Le généticien Ian Tomlinson a dirigé la recherche depuis l’Université d’Oxford, au Royaume-Uni. Les auteurs ont identifié plus de 250 gènes porteurs de mutations responsables du cancer colorectal, grâce à l’utilisation de diverses méthodes informatiques, dont certaines développées par le groupe de la biologiste Núria López Bigas de l’Institut de recherche biomédicale de Barcelone. Jusqu’à présent, cinquante de ces gènes n’étaient pas liés au cancer. Les résultats sont publiés ce mercredi dans le magazine Naturevitrine du meilleur de la science mondiale.

Les bactéries qui vivent dans le système digestif humain sont liées aux altérations génétiques qui causent le cancer. Le biotechnologue espagnol l’a démontré Cayetano Pleguezuelos et ses collègues de l’Institut Hubrecht (Pays-Bas), à étude publié en février 2020. Les chercheurs ont observé qu’une souche spécifique de la bactérie Escherichia coli Il produit une molécule toxique, appelée colibactine, qui endommage l’ADN des cellules humaines. Les nouveaux travaux ont révélé des mutations provoquées par ce microbe dans 13 % des cancers analysés. Une alimentation riche en fibre — fruits, légumes, légumineuses, céréales — et faible en viandes transformées contribuent à avoir une communauté saine de bactéries intestinales.

Le biologiste José Tubío, de l’Université de Saint-Jacques-de-Compostelle, applaudit l’étude à laquelle il n’a pas participé. « Un nombre aussi élevé de tumeurs n’a jamais été traité. Cela a permis de détecter des gènes mutés qui semblent associés à la maladie et qui n’étaient pas apparus dans les études précédentes car beaucoup moins fréquents », souligne-t-il. “Il s’agit d’une oncologie de précision : identifier toutes les mutations, même si elles sont très rares, pour essayer à l’avenir de concevoir des médicaments spécifiques ou de renforcer le système immunitaire pour pouvoir faire face à ces tumeurs”, ajoute Tubío, qui a collaboré en 2020 au projet analyse historique de plus de 2 600 génomes de 38 types de cancer différents, publiée par un consortium International.

Les nouveaux résultats confirment que l’industrie du tabac est l’ennemi numéro un de la santé publique mondiale, comme l’a prévenu le médecin. Col Elisabete Weider, directeur du Centre international de recherche sur le cancer, dans une interview avec EL PAÍS. «C’est l’industrie de la mort. La mort est son produit. La moitié des personnes qui paient pour leurs produits meurent. « Ils vendent la mort », a-t-il déclaré. José Tubío exhorte les autorités à « appliquer des mesures préventives beaucoup plus drastiques, comme l’interdiction du tabac pour les nouvelles générations d’enfants ». En avril, le Royaume-Uni a approuvé une loi qui interdira, à compter de 2027, la vente de tabac à toute personne née après 2008. 13% de la population. En Espagne, le pourcentage atteint à 22%.

Le cancer colorectal est le troisième type de cancer le plus répandu et la deuxième cause de décès dans le monde, après le cancer du poumon. Grâce à progrès médical, le taux de survie à cinq ans atteint déjà 65 %. Ces dernières années, l’incidence du cancer colorectal a augmenté de façon énigmatique chez les moins de 50 ans, à un rythme alarmant de 3 % chaque année dans de nombreux pays. Les principaux suspects sont l’obésité, la sédentarité et les boissons sucrées.

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