Certaines caractéristiques protéogénomiques des tumeurs malignes de la prostate chez les hommes d’origine européenne et africaine sont associées à un risque élevé de métastases ou de récidive de la maladie, selon une étude. étude présentée lors de la réunion de cette année de l’American Association for Cancer Research (RCAA24). Ces résultats pourraient expliquer pourquoi le cancer de la prostate entraîne une mortalité plus élevée chez les hommes d’ascendance africaine.
Des signatures mutationnelles somatiques, notamment des variantes mononucléotidiques, des variantes structurelles, des insertions-délétions, ainsi que des altérations récurrentes du nombre de copies d’ADN, ainsi que des augmentations de l’expression des protéines, ont été identifiées chez les patients d’ascendance africaine et d’origine européenne, en corrélation avec la risque élevé de progression biochimiquement définie ou de métastases après résection chirurgicale.
“Les différences dans notre lignée génétique et les variations dans les signatures mutationnelles génétiques peuvent expliquer en partie pourquoi certains cancers sont plus agressifs que d’autres et peuvent révéler des faiblesses dans les cellules cancéreuses qui peuvent être utilisées comme cibles thérapeutiques. De plus, il est important de comprendre que même si nous pouvons trouver une mutation plus fréquemment dans un groupe ou un autre, tant que le patient présente une mutation identifiable, son cancer peut se prêter à un traitement ciblé. a affirmé Shyh-Han Tan, PhDqui a présenté l’étude à l’AACR24.
L’étude a utilisé des méthodes protéogénomiques, notamment le séquençage du génome entier, la spectrométrie de masse quantitative et la phosphoprotéomique. Des échantillons de cancer de la prostate à un stade précoce ont été analysés. Ceux-ci provenaient de 57 personnes d’ascendance africaine et de 55 personnes d’ascendance européenne, qui ont participé à programme CPDR (Center for Prostate Disease Research)dédié aux militaires.
Les niveaux d’expression des protéines étaient modifiés différemment chez les patients d’origine africaine par rapport aux Européens. Les protéines NDUFS8 et NDUFV3 (sous-unités de la NADH réductase : ubiquinone), impliquées dans les voies de phosphorylation oxydative, présentaient une expression accrue dans les tumeurs de patients d’origine africaine. Ces voies pourraient être inhibées par l’administration de metformine. Les échantillons provenant de personnes d’origine européenne ont indiqué une expression accrue de certaines apolipoprotéines, telles que APOB ou APOC1, impliquées dans les voies du métabolisme du cholestérol.
« L’ADN de chaque cellule est comme un manuel d’instructions dans lequel les gènes sont les sections spécifiques qui contiennent les instructions pour fabriquer des protéines – les éléments constitutifs nécessaires au bon fonctionnement de la cellule. Mais des erreurs dans les instructions ou des mutations de l’ADN peuvent conduire à la génération de protéines dysfonctionnelles. L’avantage d’une étude protéogénomique est qu’elle peut examiner à la fois l’ADN et les protéines pour aider à comprendre où se produisent les erreurs..»a ajouté Shyh-Han Tan.
Les signatures mutationnelles liées au vieillissement étaient plus nombreuses dans les tumeurs provenant d’hommes d’origine européenne et concordent avec l’âge plus avancé des patients au moment du diagnostic. Chez les hommes africains, les signatures mutationnelles associées à des déficits de réparation de l’ADN se sont révélées plus courantes, ce qui pourrait contribuer à l’efficacité accrue de la radiothérapie ou des médicaments ciblant les voies de réparation de l’ADN, tels que les inhibiteurs de PARP.
Photo d’Alexander Luengo sur Unsplash
Les mutations étaient le plus souvent présentes sur les chromosomes 3p, 17p et 18q chez les hommes européens, tandis que les patients d’ascendance africaine présentaient souvent des modifications sur les chromosomes 1p, 1q, 3q, 13q et 19p. Le locus 17p13 présentait un taux de délétion plus élevé dans la cohorte d’origine européenne. Ce locus couvre une région relativement vaste du chromosome, avec environ 70 gènes, dont TP53, un gène suppresseur de tumeur. Le locus 1p36, précédemment associé à la susceptibilité au cancer de la prostate, était plus fréquemment amplifié chez les patients de la cohorte d’ascendance africaine.
L’étude se poursuivra en comparant les résultats obtenus avec l’analyse des données provenant de patients atteints d’un cancer de la prostate provenant de sources accessibles au public. Si elles sont similaires suite à l’étude d’un plus grand nombre d’échantillons de patients, les associations trouvées pourront être confirmées. On testera également sur des animaux de laboratoire si les tumeurs de la prostate présentant certaines altérations génétiques sont sensibles aux thérapies disponibles.
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2024-04-18 15:49:37
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