Cienciaes.com : Bio in silico. | Balados scientifiques

L’informatisation de la biologie et la génération de vie artificielle au sein d’un ordinateur ont déjà une longue histoire. Jorge Laborda a écrit sur ce sujet il y a vingt ans et il a alors déclaré que la biologie et les mathématiques ne semblent pas faire bon ménage. Du moins, pas aussi bien que la chimie et la physique. Cependant, les progrès des connaissances en informatique et en biologie ont conduit à une interaction plus intense entre la biologie, les mathématiques et l’informatique, grâce à laquelle de nombreuses propriétés intéressantes des systèmes ont été simulées, comme l’origine de la vie, le fonctionnement des réseaux neuronaux, aspects de l’embryogenèse, etc. Cependant, les progrès dans l’interaction entre la biologie et l’informatique, même s’ils ont ouvert des connaissances approfondies dans de nombreux domaines, dans d’autres, les attentes sont encore loin d’être satisfaites et la preuve en est dans les difficultés que nous avons face à des situations comme la pandémie. .actuel.

Voici un petit échantillon de ce que Jorge Laborda a écrit il y a vingt ans :

« Au-delà de la fascination de pouvoir simuler certains aspects de la complexité du vivant sur un ordinateur, l’importance de cette discipline réside dans sa capacité d’expérimentation virtuelle mais aussi dans son pouvoir de prédiction. Nous ne pouvons pas concevoir une véritable expérience sur l’évolution des espèces, car cela durerait des millions d’années, mais nous pouvons le faire sur un ordinateur. Les résultats de ces expériences de simulation permettent de tirer des conclusions ou de formuler des hypothèses sur le fonctionnement des systèmes vivants qui auraient autrement été impossibles. Ce sujet est si fascinant qu’il a été démontré il y a des années que, dans un univers de vie artificielle, formé de soi-disant automates cellulaires, il était possible de construire des ordinateurs capables, à leur tour, de simuler le système même qui les avait créés.

Là où l’informatique et les mathématiques doivent prêter main-forte aux biologistes moléculaires, c’est sans aucun doute dans la compréhension des réseaux génétiques. En utilisant l’analogie avec un moteur, les pièces interagissent les unes avec les autres, générant ce que l’on pourrait appeler des réseaux mécaniques ou électromécaniques. De la même manière qu’un moteur est constitué de dispositifs qui fonctionnent indépendamment les uns des autres, mais qui s’intègrent pour former un tout, les biologistes pensent qu’il en va de même avec les gènes. On pense que ceux-ci interagissent en sous-groupes, créant ainsi les différents mécanismes qui forment la cellule et l’organisme. Nous espérons que ces mécanismes individuels pourront être étudiés séparément les uns des autres, ce qui facilitera grandement la compréhension du fonctionnement des êtres vivants, ce qui serait autrement impossible.

Cela suggère qu’en effet, ces réseaux génétiques intégrant des mécanismes biologiques individuels existent et peuvent être découverts, analysés et simulés à l’avenir. En revanche, cela ajoute un facteur très important : le pouvoir prédictif. La physique a été caractérisée par cette particularité, mais pas la biologie. De nombreux modèles physiques prédisaient l’existence de phénomènes ou de particules qui furent ensuite vérifiés expérimentalement. La biologie s’engage désormais également dans cette voie.

Ahora, dos décadas después, es cierto que ha habido desarrollos importantes para la comprensión de las redes genéticas y de lo que se viene a llamar el “interactoma” es decir las interacciones entre las proteínas que están producidas por los genes y se sigue avanzando en ce thème. Cependant, si les progrès de la bioinformatique avaient été aussi intenses qu’on le pensait auparavant, il est clair que les réseaux génétiques qui constituent tous les systèmes cellulaires vivants auraient été disséqués et, peut-être, compris aujourd’hui. Ce sont les mêmes réseaux et mécanismes génétiques que les virus utilisent pour se reproduire. Il aurait donc été souhaitable que la bioinformatique ait acquis suffisamment de connaissances pour intervenir efficacement dans les réseaux génétiques que les virus, comme le nouveau coronavirus, SRAS-Cov-2, utilisé pour causer la mort, la douleur et la pauvreté. Il aurait ainsi été possible d’intervenir dans ces réseaux et d’empêcher leur reproduction ou leur transmission ou, du moins, grâce à des médicaments ou d’autres méthodes rapidement conçus.

Œuvres de Jorge Laborda.

Vos défenses contre le coronavirus

Vos défenses contre le coronavirus

Kilo de volume scientifique XII eBook
Kilo de volume scientifique XII Papier
Quilo de Ciencia Tome I. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome II. Jorge Laborda
Kilo de volume scientifique III. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome IV. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome V. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome VI. Jorge Laborda
Kilo de volume scientifique VII. Jorge Laborda
Kilo de volume scientifique VIII. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome IX. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome X. Jorge Laborda
Quilo de Ciencia Tome XI. Jorge Laborda

Matrice de l’homéopathie

Circonstances enchaînées. Éd. Lulu

Circonstances enchaînées. amazone

Une Lune, une civilisation. Pourquoi la Lune nous dit que nous sommes seuls dans l’Univers

Une Lune, une civilisation : pourquoi la Lune nous dit que nous sommes seuls dans l’univers

Adénius Fidèle

L’entonnoir du renseignement et autres essais