Cienciaes.com : Carte mondiale des bactéries qui dominent la terre. Nous avons parlé avec Manuel Delgado Baquerizo.

Peu importe où nous sommes, dans une forêt, au bord d’une rivière ou dans le désert, si nous prenons une poignée de terre, elle sera sûrement chargée de vie. Nous essayons de classer les êtres vivants qui nous entourent depuis des centaines d’années. Nous avons regardé les êtres vivants, grands et petits, nous les avons classés en espèces, identifiés par des noms latins, et nous les avons observés pour déterminer à quoi ils ressemblent, quelles sont leurs habitudes, l’environnement qu’ils occupent, etc. Mais, presque toutes ces connaissances se concentrent sur des créatures dont le corps est composé de nombreuses cellules : mammifères, oiseaux, poissons, insectes… Cependant, cette volonté de classer et de connaître les êtres vivants a à peine permis d’effleurer les aspects les plus superficiels et les plus évidents. biosphère. Les êtres les plus petits et les plus abondants, les bactéries, restent largement méconnus.

Nous connaissons de nombreuses bactéries, mais par rapport à l’immensité de celles qui existent, nous nous sommes concentrés uniquement sur la petite proportion qui nous est le plus liée, c’est-à-dire celles qui nous causent des maladies, celles qui peuplent notre propre corps et dépassent dans un rapport de 10 pour 1 nos propres cellules, celles qui peuvent être cultivées en laboratoire ou celles qui remplissent des fonctions qui nous profitent, soit parce qu’elles facilitent la fermentation des aliments, soit parce qu’elles profitent aux animaux et aux plantes que nous utilisons.

Malgré ces connaissances, la grande majorité des espèces bactériennes qui peuplent chaque poignée de terre nous restent inconnues. Aujourd’hui, cela commence à changer, grâce à l’étude récemment publiée dans Science par un groupe international de scientifiques dirigé par notre invité, le chercheur espagnol. Manuel Delgado Baquerizo Baquerizo, actuellement à l’Université du Colorado à Boulder, Etats-Unis.

Manuel et ses collègues ont collecté des échantillons de sol provenant de 237 sites répartis sur différents continents et les ont analysés pour découvrir les bactéries qu’ils contiennent. En conséquence, ils ont obtenu la première carte du monde qui reflète la répartition des communautés bactériennes des terres émergées de notre planète.

La recherche révèle que, bien que le nombre de bactéries existant dans tous les endroits étudiés soit important, il existe très peu de taxons bactériens qui parviennent à occuper une grande surface et se retrouvent de manière persistante dans une multitude de sols à travers le monde. Manuel Delgado Baquerizo et leurs collègues ont détecté un total de 25 224 phylotypes bactériens, dont seulement 511 étaient répétés dans près de la moitié des échantillons de sol collectés. En d’autres termes, malgré l’écrasante diversité des communautés bactériennes du sol, seule une petite proportion (2 %) d’entre elles sont abondantes et peuvent être trouvées dans un large éventail de types de sols.

Les chercheurs ont ensuite analysé un ensemble de facteurs environnementaux et ont découvert que les types de bactéries pouvaient être classés en fonction des propriétés du sol, telles que l’acidité ou l’alcalinité, selon que les régions étaient humides, boisées, arides et sèches.

Les bactéries du sol jouent un rôle clé dans la régulation de la dynamique du carbone terrestre, des cycles des nutriments, de la productivité des plantes et de la vie des créatures multicellulaires qui peuplent la planète. Pour cette raison, les connaître peut permettre aux scientifiques de construire de meilleurs modèles qui nous permettent de comprendre la manière dont les communautés bactériennes du sol varient dans l’espace et dans le temps, ainsi que les changements qu’elles subissent en réponse aux changements environnementaux et qu’ils soient induits ou non. par les activités humaines.

Manuel Delgado Vaquerizo nous parle depuis les États-Unis, plus précisément depuis l’Université du Colorado à Boulder, où il est chercheur Marie Curie, un programme de l’Union européenne qui soutient le séjour de chercheurs postdoctoraux dans des pays autres que le leur. En effet, il est originaire d’Utrera (Séville) et, dans le cadre du programme Maríe Curíe, ses recherches sont liées en Espagne avec le Université Roi Juan Carlosune université publique de la communauté de Madrid.

Référence:

Delgado-Baquerizo et al, « Un atlas mondial des bactéries dominantes trouvées dans le sol » Science, 19 janvier 2018, Vol 359 Numéro 6373.