Commentaire : La danse virale

Les virus sont comme des partenaires de danse furtifs, changeant constamment leurs mouvements pour déjouer notre système immunitaire. Tout comme un organisme vivant, les virus évoluent avec le temps. Même lorsque notre système immunitaire apprend la routine de danse et crée des anticorps pour les combattre, certains virus parviennent à changer les choses. Cette capacité les aide à continuer à infecter les organismes vivants. Mais comment font-ils ?

Grâce à la puissance de l’intelligence artificielle et de la modélisation mathématique, un groupe de chercheurs de l’université de Nagoya a décrypté les pas de danse du virus SARS-CoV-2, responsable du Covid-19. Leurs découvertes, récemment publiées dans Nature Communications, ont révélé un lien fascinant entre le comportement humain et l’évolution des souches de Covid-19.

L’équipe de recherche, dirigée par le professeur Shingo Iwami, s’est penchée sur l’impact des confinements et des mesures d’isolement sur l’évolution du virus. À mesure que nous adaptions notre comportement pour contrôler les épidémies, le virus a réagi en devenant plus transmissible plus tôt dans son cycle de vie. L’étude a identifié une multiplication par cinq de la charge virale maximale à mesure que le virus évoluait de la souche Wuhan à la souche Delta, soulignant la relation complexe entre les actions humaines et l’évolution du virus.

Comprendre ce tango évolutif est crucial pour développer des traitements et des interventions adaptatifs. Les virus, comme les danseurs talentueux, doivent équilibrer leurs mouvements. Augmenter la charge virale maximale peut être avantageux pour la transmission, mais une augmentation excessive pourrait rendre les individus trop malades pour continuer la danse.

De plus, les chercheurs ont découvert des tendances intrigantes en utilisant la modélisation mathématique avec une composante d’intelligence artificielle pour étudier les données cliniques précédemment publiées. Les variantes du SRAS-CoV-2 qui ont le plus réussi à se propager ont présenté un pic de charge virale plus précoce et plus élevé. Cependant, à mesure que le virus évoluait des variantes pré-Alpha aux variantes Delta, sa durée d’infection était plus courte. La diminution de la période d’incubation et la proportion accrue d’infections asymptomatiques enregistrées lors de la mutation du virus ont également affecté l’évolution du virus.

Les résultats ont montré une nette différence. À mesure que le virus évoluait de la souche Wuhan à la souche Delta, ils ont constaté une multiplication par cinq de la charge virale maximale et une multiplication par 1,5 du nombre de jours avant que la charge virale culmine.

Iwami et ses collègues suggèrent que les changements de comportement humain en réponse au virus, conçus pour limiter la transmission, augmentaient la pression de sélection sur le virus. Cela a entraîné la transmission du SRAS-CoV-2 principalement pendant les périodes asymptomatiques et pré-symptomatiques, qui surviennent plus tôt dans son cycle infectieux.

Dans le dernier acte de cette histoire de virus, il s’avère que nous avons involontairement influencé la façon dont le virus Covid-19 fait sa danse. Imaginez-le comme une routine de danse unique chorégraphiée par nous, les humains. Nous avons essayé de déjouer le virus avec des mesures comme le confinement, mais devinez quoi ? Le virus avait ses propres plans. Il a modifié ses mouvements, préférant se propager lorsque les gens ne présentaient aucun symptôme ou commençaient tout juste à se sentir mal.

Ainsi, dans notre tentative de contrôler la piste de danse, nous avons en quelque sorte fait changer de pas le virus. C’est comme si nous lui avions accidentellement donné un coup de pouce pour qu’il fasse une routine de danse différente. Qui aurait cru que les virus pouvaient être si imprévisibles ? La prochaine fois que vous réfléchirez à la façon dont nous faisons tous partie de cette danse mondiale, n’oubliez pas : nos mouvements pourraient avoir plus d’influence que nous ne le pensons !