Covid et variant de Noël, tout savoir sur XEC

Il sera probablement « l’invité de pierre » des dîners, des apéritifs et des célébrations de Noël et du Nouvel An. Même si les projecteurs semblent désormais s’être éteints, le Covid continue de circuler sous des versions toujours nouvelles. Le dernier est XEC. Dans un focus publié dans ‘Jama’, nous faisons le point sur les origines et la montée de ce variant qui, pour les experts, est désormais “destiné à dominer la vague hivernale” du Covid.

L’efficacité du vaccin

“Heureusement, des descendants d’Omicron recombinants”, souligne l’analyse, XEC il ne semble pas trop différent des variants ciblés par les derniers vaccins Covid (JN.1 et KP.2), disent les scientifiques. «Ils sont très similaires», explique Nicole Doria-Rose, chef de la section d’immunité aux anticorps au Centre de recherche sur les vaccins de l’Institut national des allergies et des maladies infectieuses. XEC n’a que 4 changements d’acides aminés par rapport à JN.1 et KP.2, explique-t-il.

Championnats d’Europe et JO : la genèse du XEC

Comment est-il né ? On pense que la recombinaison se produit généralement chez une personne immunodéprimée, infectée simultanément par plusieurs variantes du Sars-CoV-2, explique l’épidémiologiste Bill Hanage, directeur associé du Center for Communicable Disease Dynamics à la Harvard TH Chan School of Public Health. L’hypothèse, étant donné que XEC a été détecté pour la première fois en Allemagne le 7 août, est que – compte tenu du moment et du lieu de l’identification initiale – il pourrait être apparu chez un supporter ayant assisté au tournoi de football Euro 2024, organisé entre la mi-juin et la mi-juin. -Juillet dans les stades de toute l’Allemagne, explique Hanage. Alors que “On ne saura jamais exactement où cela s’est passé”a-t-il déclaré, « des événements comme celui-ci offrent certainement des opportunités à de nouvelles variantes de s’établir ». Ou alors, XEC aurait pu naître aux Jeux olympiques de Paris, qui ont débuté fin juillet, intervient Doria-Rose, faisant écho à Hanage : “Nous ne le saurons jamais.”

Répandu dans le monde entier

Cependant, peu importe où il est né, soulignent les experts. Le XEC s’est imposé dans le monde entier : dès la deuxième semaine d’octobre, il représentait environ 17 % des séquences du Sars-CoV-2 dans le monde, contre environ 9 % la semaine se terminant le 22 septembre, selon l’Organisation mondiale de la santé (OMS). ). Entre ces 2 périodes, XEC s’est développé dans les Amériques, en Europe et dans le Pacifique occidental. Il est considéré comme un variant sous surveillance par l’OMS depuis fin septembre, ce qui signifie que les autorités de santé publique devraient le surveiller au cas où il deviendrait une menace plus grande que les autres variants en circulation. Aux États-Unis, le National Genomic Surveillance System l’a séquencé pour la première fois dans la seconde quinzaine du mois d’août. Au 9 novembre, les Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC) estimaient ce chiffre à 28 %, contre 17 % les deux semaines précédentes.

Sera-ce la variante dominante ?

Même si le XEC n’augmentera peut-être pas aussi rapidement que le suggèrent les estimations du CDC, “il sera responsable d’une partie substantielle de la transmission que nous verrons dans les semaines à venir”, prédit Hanage. “Je pense qu’il y a de fortes chances qu’il devienne la variante dominante.” Mais les experts ne s’attendent pas à ce qu’il provoque des symptômes plus graves que les autres variantes actuelles ou qu’il compromette la capacité des derniers vaccins Covid à prévenir une maladie grave. « Rien ne prouve que cela rend les gens plus malades », souligne Hanage. Les années précédentes, le Covid a connu un pic après les vacances de décembre. Il est toutefois difficile de dire cette fois comment cela va se passer, estiment certains experts. XEC n’est pas la première variante recombinante et il est peu probable qu’elle soit la dernière.

La stratégie antivirus

La recombinaison “aide le virus à muter plus rapidement”, explique Doria-Rose. Et cela pourrait s’avérer avantageux, car cela augmente la transmissibilité et l’évasion immunitaire, souligne dans un courrier électronique le virologue Kei Sato, professeur à l’Institut des sciences médicales de l’Université de Tokyo. Fin 2022, 60 variantes recombinantes du Sars-CoV-2 avaient été désignées ; certains ont parcouru le monde, tandis que d’autres sont restés des clusters locaux. Cependant, préviennent les scientifiques, détecter, surveiller et réagir aux nouveaux variants recombinants est devenu plus difficile, en partie à cause du déclin du séquençage dans le monde après la fin des urgences de santé publique. « Nous ne dépensons plus d’argent là-dessus », note Doria-Rose à propos de la surveillance génomique.

Alors aujourd’hui que sait-on du XEC, quel est son profil ? Selon Sato, un événement majeur se produit pratiquement chaque année dans l’évolution du variant Omicron. « Je ne suis pas encore sûr que le grand événement de 2024 soit le XEC », précise-t-il cependant dans son mail. Le 6 novembre, Sato et d’autres co-auteurs ont publié une lettre de recherche dans The Lancet décrivant les caractéristiques virologiques du XEC. Les auteurs ont estimé le nombre effectif de reproduction (combien de personnes sensibles peuvent être infectées par un seul individu) : aux États-Unis, il semble être 13 % plus élevé que celui du KP.3.1.1, la variante prédominante dans le monde au début de l’année. Novembre. « Je pense que le niveau d’activité de neutralisation via une infection naturelle diminue », a déclaré Sato à Jama Medical News, expliquant que lui et ses collaborateurs étudient actuellement les anticorps neutralisants dans les sérums de ceux qui ont reçu les vaccins Covid 2024-2025. Si de toute façon le Covid est désormais devenu une maladie bénigne pour la majorité des personnes en bonne santé, il continue de provoquer plus d’hospitalisations que la grippe, souligne le focus, soulignant la nécessité de continuer à prêter attention aux plus fragiles.