Covid, nouvelle variante hypermutée isolée en Afrique du Sud – Corriere.it

été isolé en Afrique du Sud une nouvelle variante hyper-mutée du SARS-CoV-2. de la souche Omicron et présente au-delà 100 mutations particularités dont plus de 30 dans la protéine de pointe (la partie que le coronavirus utilise pour se fixer aux cellules humaines).

C’est ce qu’a rapporté Tulio de Oliveira, directeur du Centre de réponse et d’innovation aux épidémies de l’Université de Stellenbosch en Afrique du Sud, déjà chef de l’équipe qui a identifié Omicron pour la première fois. Oliveira a publié sur les portails publics qui collectent le séquençage du SRAS-CoV-2 huit nouveaux génomes qu’il a défini comme probablement la lignée la plus divergente identifiée cette année et qu’il a appelé : BA.2.X (également BA.2.87.1). La nouvelle sous-variante a été détectée dans 8 échantillons provenant de trois districts des provinces de Limpopo et de Gauteng. entre le 20 septembre et le 29 novembre 2023. Selon le chercheur (qui propose une carte génétique mise à jour d’Omicron, voir figure à la page) peut avoir émergé de BA.2 ou du nœud basal d’Omicron. Outre les mutations, le variant présente 7 suppressionsen simplifiant, 7 parties manquantes du virus par rapport aux lignées précédentes.

Le degré de transmissibilité et de pathogénicité est encore inconnu – précise de Oliveira sur X -. L’Afrique du Sud a accru la surveillance génomique, avec très peu de signes indiquant que cette nouvelle lignée se propage largement et remplace la BA.2/JN.1 actuellement dominante. La protection contre les vaccins et les infections antérieures ne devrait pas être compromise plus gravement affectés par ces mutations de pointe que les mutations de pointe trouvées dans d’autres lignées en circulation, telles que XBB et JN.1 (on en a parlé ICI, ndlr
), conclut le chercheur.

Le Covid continuera à nous déranger et progressivement, différentes variantes passeront le relais de manière cyclique tous les 4-6 moisobserve le virologue de l’Université de Milan à Adnkronos Salute, Fabrizio Pregliasco. Le caractère cyclique, contrairement à ce qui se passe avec la grippe – souligne-t-il – ne sera pas nécessairement lié à l’hiver. Le coronavirus va continuer à muter, mais l’espèce humaine sait se défendre contre les anciens et les nouveaux variants : nous avons des vaccins sûrs et efficaces. Utilisons notre cerveau et vaccinons-nous, déclare-t-il Pier Luigi Lopalco, professeur d’hygiène à l’Université du Salento. Cela ne semble pas inquiétant pour le moment, ajoute-t-il à propos de la nouvelle variante Giovanni Rezzaancien directeur de la Prévention au Ministère de la Santé et aujourd’hui professeur extraordinaire d’hygiène à l’Université Vita-Salute San Raffaele de Milan.

Sur la base des données de séquençage disponibles dans la plateforme nationale I-Co-Gen, en Italie au cours des cinq dernières semaines d’échantillonnage (données du 22 janvier 2024), une augmentation de la proportion de séquences attribuables au variant d’intérêt continue d’être observée JN.1, dérivé de Pirola
avec une valeur égale à 70,5% au cours de la dernière semaine consolidée (01-07 janvier 2024). Cependant, les infections au Covid sont en baisse : dans la semaine du 25 au 31 janvier 2024, 3.859 nouveaux cas positifs au Covid-19 ont été enregistrés, soit une baisse de 33,6% par rapport à la semaine précédente (5.810 cas) et 115 décès (-43,3 %, 203). Le taux de positivité à 2,6% est en baisse de 1% par rapport à il y a sept jours (3,6%). Le taux d’emploi dans le domaine médical au 31 janvier était de 3,5% (2.169 hospitalisés) contre 4,3% le 24 janvier (2.691) et en soins intensifs de 1,2% (106 hospitalisés) contre 1,4% précédemment (121).

Ces derniers mois – commente le directeur de la Prévention du Ministère de la Santé, Francesco Vaïa — ont désormais souligné définitivement et sans équivoque que nous sommes confrontés à la endémique du SRAS-CoV-2 (lorsqu’un virus devient présent de manière permanente dans la population, comme la grippe, ndlr).

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