Des chercheurs découvrent 3 nouveaux loci pour mieux comprendre les facteurs génétiques de l’apnée du sommeil

Une meilleure compréhension de la façon dont la génétique joue dans l’apnée obstructive du sommeil (AOS) pourrait permettre une meilleure prise en charge de la somnolence diurne excessive.¹

Une équipe, dirigée par Pavithra Nagrajan, Brigham and Women’s Hospital, a étudié l’analyse de l’interaction gène par somnolence par OSA.

Il existe une gamme de symptômes impliqués dans l’OSA, y compris une somnolence diurne excessive, qui est supposée représenter un sous-type plus grave. Il existe une héritabilité importante et des GWAS passés, mais les mécanismes génétiques ne sont toujours pas clairs.

Parce que la somnolence diurne excessive reflète une insuffisance de sommeil chronique et un état pro-inflammatoire, elle pourrait interagir avec des variants génétiques pour modifier le risque d’AOS.

Les données ont été présentées lors de la réunion annuelle SLEEP 2023 à Indianapolis.

Dans l’étude, les enquêteurs ont utilisé des données de séquençage du génome entier pour 11 619 personnes de diverses races et origines ethniques. Les patients ont été identifiés à partir du programme NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine.

Les enquêteurs ont recherché les résultats de l’indice d’apnée-hypopnée (IAH) et de l’échelle de somnolence d’Epworth (>10 : EDS, <=10 : non-EDS).

Les enquêteurs ont utilisé le package GENESIS R pour effectuer une normalisation des rangs en 2 étapes, en ajustant l’âge, le sexe, l’indice de masse corporelle (IMC), les PC ancestraux, la cohorte et la parenté génétique, et en redimensionnant les résidus à une variance unitaire, séparément dans chaque étude ou ascendance. groupe.

Ils ont également utilisé le logiciel GEM pour effectuer des analyses d’interaction gène-EDS, y compris des tests 1 df d’effet SNP marginal et d’effet d’interaction de SNPxEDS sur l’IAH, respectivement, et un test 2 df de signification conjointe des deux.

Enfin, ils ont utilisé des erreurs types robustes avec un seuil de signification de P <5x10-8.

Les résultats montrent qu’un nouveau locus (rs35370454) a été identifié par le test 1 df de l’effet SNP marginal, qui a été cartographié sur IFRD1, dont la surexpression a été liée à la restriction du sommeil et à l’hypométhylation avec narcolepsie.

Ils ont également trouvé 2 nouveaux loci (rs13118183, rs281851) qui correspondaient aux gènes MARCHF1 et CCDC3 dans le test 1 df de l’effet d’interaction.

Cependant, le test conjoint 2 df n’a montré aucun nouveau loci supplémentaire.

Enfin, CCDC3 a montré qu’il réprimait l’activité inflammatoire du TNF-alpha, une cytokine postulée impliquée dans la régulation du sommeil et que MARCHF1 inhibait la sensibilité cellulaire à l’insuline et favorisait le NF-KB, le degré d’activation étant positivement corrélé à la gravité de l’AOS.

“En modélisant l’effet de modification de l’EDS sur l’OSA, nous avons identifié 3 nouveaux loci”, ont écrit les auteurs. « Cette approche peut être utile pour comprendre les facteurs génétiques qui varient selon les sous-types d’AOS. Pour les prochaines étapes, nous cherchons à effectuer une analyse de réplication à l’aide d’échantillons imputés indépendants.

Pavithra Nagarajan et autres, 0034 Variantes génétiques pour l’apnée obstructive du sommeil identifiées après modélisation des interactions avec la somnolence diurne, Dormirvolume 46, numéro Supplément_1, mai 2023, pages A15–A16,