Des chercheurs révèlent un mécanisme de régulation par lequel la vie se contrôle et s’organise

Des chercheurs révèlent un mécanisme de régulation par lequel la vie se contrôle et s’organise

<div data-thumb="https://scx1.b-cdn.net/csz/news/tmb/2022/sticking-together-with.jpg" data-src="https://scx2.b-cdn.net/gfx/news/2022/sticking-together-with.jpg" data-sub-html="Processes leading to CIPS. (a) Enzymes convert substrate into product by a fueled catalytic reaction, while product turns into substrate spontaneously. (b) The catalyzed reaction creates gradients of substrate and product around enzyme-rich regions, which attract more enzymes when the off diagonal transport coefficients coupling enzyme fluxes to product and substrate thermodynamic forces satisfy pe>avec. Le crédit: Lettres d’examen physique (2022). DOI : 10.1103/PhysRevLett.129.158101″>

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Processus menant au CIPS. (a) Les enzymes convertissent le substrat en produit par une réaction catalytique alimentée, tandis que le produit se transforme spontanément en substrat. (b) La réaction catalysée crée des gradients de substrat et de produit autour des régions riches en enzymes, qui attirent plus d’enzymes lorsque les coefficients de transport hors diagonale couplant les flux d’enzymes aux forces thermodynamiques du produit et du substrat satisfont pe>avec. Le crédit: Lettres d’examen physique (2022). DOI : 10.1103/PhysRevLett.129.158101

À l’intérieur des cellules, les gouttelettes moléculaires forment des compartiments définis pour les réactions chimiques. Non seulement les interactions collantes entre les molécules, mais aussi les réactions dynamiques peuvent former de telles gouttelettes, comme l’ont découvert des chercheurs de l’Institut Max Planck pour la dynamique et l’auto-organisation (MPI-DS) et de l’Université d’Oxford. Ils ont révélé un nouveau mécanisme de régulation par lequel la vie se contrôle et s’organise.

Traditionnellement, les organites cellulaires définis par une membrane ont été considérés comme les unités fonctionnelles d’une cellule. Ces dernières années, il a également été démontré que les molécules gouttelettes formés à l’intérieur de la cellule fournissent un micro-environnement pour des réactions importantes. Ces gouttelettes ne sont pas entourées d’un membrane, et résultent d’une séparation de phase. Par conséquent, ils se forment dynamiquement et peuvent être régulés en fonction des besoins de la cellule.

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Les entraînements hors d’équilibre peuvent induire la formation de gouttelettes

Dans le département de physique de la matière vivante, le directeur général Ramin Golestanian et ses collègues visent à révéler les principes d’organisation de la matière vivante. “Jusqu’à présent, la formation de gouttelettes dans les cellules était attribuée à des interactions attractives et collantes entre les molécules, similaires à la formation de gouttelettes dans des systèmes d’équilibre non vivants, tels que des gouttelettes d’huile dans une vinaigrette”, explique Jaime Agudo-Canalejo, chef de groupe au MPI-DS.

“Nous avons maintenant découvert que l’entraînement hors d’équilibre fourni par réactions enzymatiques peut provoquer la formation de gouttelettes riches en enzymes, même sans aucun effet collant. Au lieu de cela, les enzymes sont poussées les unes contre les autres par les flux chimiques qu’elles créent », poursuit-il.

Les chercheurs ont exploré ce nouveau mécanisme en formulant un modèle dans lequel l’effet d’une réaction enzymatique à plusieurs composants sur le micro-environnement est décrit. Ils ont également pris en compte le mécanisme de rétroaction sous-jacent grâce auquel la séparation de phase induite peut à son tour affecter la réaction enzymatique initiale.

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“Quand le activité enzymatique devient trop intense, Séparation de phases se produit et agit pour le réduire, fournissant une nouvelle forme d’autorégulation », explique Matthew Cotton, premier auteur de l’étude. Cette interaction complexe d’interactions moléculaires peut fournir un environnement dynamique pour processus cellulaires. Par conséquent, le modèle ajoute une autre pièce au puzzle complexe de la façon dont la vie est capable de s’organiser.

La recherche a été publiée dans Lettres d’examen physique.


Le modèle évolutif prédit la partition des molécules dans les cellules


Plus d’information:
Matthew W. Cotton et al, Séparation de phase induite par catalyse et autorégulation de l’activité enzymatique, Lettres d’examen physique (2022). DOI : 10.1103/PhysRevLett.129.158101

Citation: Réactions enzymatiques : des chercheurs révèlent un mécanisme de régulation par lequel la vie se contrôle et s’organise (2022, 27 octobre) récupéré le 27 octobre 2022 sur https://phys.org/news/2022-10-enzymatic-reactions-reveal-regulatory-mechanism .html

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