Détection de translocations dans des cellules génétiquement modifiées

La technologie d’édition génétique recèle un grand potentiel pour faire progresser le traitement d’un large éventail de maladies, mais elle comporte également le risque de provoquer des translocations hors cible. Ces translocations peuvent toutefois être difficiles à détecter avec les méthodes traditionnelles de séquençage en masse.

Mission Bio cherche actuellement à améliorer la détection des translocations grâce à sa solution d’édition du génome Tapestri, que la société a récemment mise à jour avec une nouvelle fonctionnalité d’analyse des translocations. Lors de la 27e réunion annuelle de l’American Society of Gene & Cell Therapy (ASGCT), qui s’est tenue du 7 au 10 mai 2024 à Baltimore, dans le Maryland, CGTLive® s’est entretenu avec Vanee Pho, PhD, directrice principale de la gestion des produits, thérapie cellulaire et génique, chez Mission Bio, pour en savoir plus sur ce que l’entreprise a présenté sur ce sujet lors de la conférence.

CGTLive : Pouvez-vous nous donner quelques informations sur ce que l’entreprise a présenté à l’ASGCT cette année ?

Ensuite, nous approfondissons la compréhension de ce que nous appelons la stabilité génomique. Lorsque ces cassures double brin se produisent, il peut y avoir une perte de parties du chromosome, ce qui, encore une fois, est assez préjudiciable pour les patients. Nous mettons donc ici en évidence notre cellule unique [analysis]. Nous pouvons désormais le faire à une résolution de cellule unique, à la fois pour les translocations, avec une sensibilité vraiment plus élevée par rapport à d’autres mesures globales, et comprendre la stabilité génomique globale. C’est donc la seule affiche que nous avons.

Deuxièmement, je voulais juste souligner que nous avons le Dr Ayal Hendel, PhD, [the principal investigator at the Bar-Ilan University in Israel] Il nous parlera aujourd’hui de l’importance de comprendre les cibles hors cible dans les thérapies immunitaires. Son laboratoire s’intéresse spécifiquement à la compréhension des thérapies immunitaires autour de la drépanocytose. Nous avons collaboré avec lui pour mieux comprendre et caractériser ces cibles hors cible. Il a utilisé ses mesures en vrac d’un pipeline prospectif et nous avons également travaillé avec lui sur notre pipeline d’édition du génome avec des translocations, montrant ainsi que nous sommes capables de détecter, avec une sensibilité très élevée, certains de ces effets hors cible qu’il observe dans des lignées cellulaires particulières.

Quels ont été les points clés présentés ?

L’un des points clés serait l’importance de comprendre ces cibles hors cible et d’en avoir la sensibilité, en particulier au niveau de la cellule unique. Les techniques de masse peuvent montrer tellement de choses… Mais cette cellule unique [analysis] Cela nous fait faire un pas supplémentaire dans la compréhension du nombre réel de cellules qui présentent ces translocations, ce que les techniques de masse ne peuvent pas montrer.

Comment résumeriez-vous les grandes implications que les médecins et la communauté médicale devraient tirer de cette situation ?

La norme consiste à utiliser ces technologies massives, qu’il s’agisse de rhAmpSeq, du séquençage de nouvelle génération ou de la réaction en chaîne par polymérase numérique. Mais même si elles sont assez complètes, elles ne vous mènent pas très loin en termes de compréhension des cibles hors cible et des véritables implications de ce qu’une cible hors cible pourrait faire si elle n’est pas détectée chez le patient. Je pense que c’est là que notre présence ici à l’ASGCT a un impact assez important en termes de diffusion de l’information et de compréhension de la nécessité de comprendre ces choses, qu’il s’agisse de réarrangements chromosomiques ou de pertes chromosomiques qui pourraient survenir à la suite de l’édition génétique. L’objectif ultime est de créer des thérapies efficaces.

Y a-t-il eu des défis majeurs dans cette recherche jusqu’à présent ?

Je dirais que nous avons parfois l’impression que la cellule unique est un peu prématurée, ce qui signifie qu’il y a beaucoup d’informations. Il y a des défis à relever pour savoir quoi faire de toutes ces informations. Nous travaillons donc activement à affiner notre solution et à la rendre plus digeste pour les scientifiques afin qu’ils adoptent davantage notre technologie. Ensuite, il y a toujours cette inertie du type « c’est une nouvelle technologie, je suis habitué à ce que je fais » ; faire quelque chose de nouveau a sa propre inertie d’adoption.

Cette transcription a été modifiée pour plus de clarté.

Cliquez ici pour voir plus de couverture de la réunion annuelle 2024 de l’ASGCT.

RÉFÉRENCES
1. La nouvelle analyse de translocation de Mission Bio offre un aperçu de l’évaluation critique de la sécurité des produits cellulaires génétiquement modifiés. Mission Bio. 25 avril 2020. Consulté le 6 juin 2024. https://missionbio.com/press/translocation-analysis/
2. Hendel A. Mesure précise des résultats de l’édition du génome par CRISPR grâce au séquençage de l’ADN monocellulaire. Présenté à : Réunion annuelle de l’ASGCT 2024, du 7 au 10 mai ; Baltimore, Maryland. Résumé n° 254
2024-08-20 14:11:44
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