Les principaux responsables des infections postopératoires pourraient être les bactéries déjà présentes sur la peau du patient, selon une étude menée à l’Université de Washington à Seattle et publiée dans Médecine translationnelle scientifique. Les souches bactériennes et les types de résistance aux antibiotiques impliqués dans les infections sont déjà présents chez le patient avant l’opération et ne sont pas acquis lors de l’hospitalisation.
Étudier le design
L’étude a analysé une cohorte de 204 patients subissant une chirurgie de la colonne vertébrale au Harborview Medical Center de Seattle entre septembre 2019 et novembre 2020. Il s’agit d’un type d’opération dans lequel l’incision est « propre » et n’implique pas d’entrée dans les voies génito-urinaire, digestive ou voies respiratoires. L’opération a un taux d’infection postopératoire de 3 à 5 %. Les chercheurs ont effectué des prélèvements préopératoires sur le nez, le rectum et la peau sur le site opératoire, déterminant les souches bactériennes grâce au séquençage génomique des échantillons (métagénomique). Ils ont ensuite comparé ces données avec le génome de populations bactériennes isolées de toute infection postopératoire.
Dans 86 % des cas (19 souches sur 22 isolées sur 14 cas d’infection), les bactéries responsables des infections postopératoires sont tout à fait similaires, génétiquement, à celles présentes avant l’opération sur le corps du patient. Un résultat similaire a été trouvé pour les résistances aux antibiotiques, qui ressemblaient à celles présentes dans la communauté bactérienne des patients. Une analyse ultérieure de 59 infections postopératoires, provenant d’un échantillon de 1 610 patients opérés, a révélé qu’aucune de ces infections ne provenait de souches bactériennes partagées entre les patients. Autrement dit, ils ne semblent pas provenir d’une source commune comme le milieu hospitalier.
Les données indiquent que la plupart des agents pathogènes responsables des infections postopératoires proviennent de la flore bactérienne du patient plutôt que de contaminations environnementales lors de l’intervention chirurgicale. Cette observation concorde avec les études antérieures sur les infections des voies urinaires et les souches de Staphylococcus aureus. L’étude récente de Seattle est cependant parmi les premières à démontrer une corrélation directe entre la composition globale du microbiome cutané, les infections postopératoires et la résistance aux antibiotiques.
Une découverte inattendue
Les chercheurs ont également noté que le microbiome du dos n’est pas homogène mais varie selon un gradient ; pathogènes opportunistes à Gram positif tels que Staphylocoque et Cutibactérie sont plus répandues dans les régions cervicales et thoraciques, tandis que les bactéries Gram-négatives et anaérobies telles que Escherichia, Entérobactérieet Bactéroides sont prédominantes dans la région lombo-sacrée. La seule différence significative constatée entre les patients hommes et femmes était une prévalence plus élevée de Lactobacilles dans ce dernier.
Les résultats ont des implications importantes pour la gestion de la prophylaxie chirurgicale et des infections postopératoires. Le fait que les infections chirurgicales provenaient principalement d’un environnement opératoire loin d’être parfaitement stérile était presque tenu pour acquis. Si, au contraire, les bactéries endogènes sont les véritables coupables, alors les efforts visant à réduire l’incidence des infections devraient se concentrer sur le patient. Les auteurs de l’étude ont proposé d’analyser le microbiome du patient pour personnaliser la prophylaxie antibiotique préopératoire. Cette approche permettrait de prendre en compte les multiples résistances spécifiques du patient, réduisant ainsi l’utilisation inappropriée d’antibiotiques. Une autre recommandation est l’utilisation d’antiseptiques tels que l’iodopovidone, à la place ou en association avec la chlorhexidine, contre laquelle se développent des souches bactériennes résistantes.
Dans un commentaire d’accompagnement, Jack A. Gilbert, PhD, chercheur principal à l’École de médecine de l’UC San Diego, et John Alverdy, MD, professeur de chirurgie à l’Université de Chicago, Chicago, ont émis l’hypothèse qu’à l’avenir, les patients pourraient recevoir des kits automatiques pour obtenir des données métagénomiques et identifier à l’avance les facteurs de risque d’infection. Des études plus détaillées sont toutefois nécessaires pour examiner de manière approfondie les communautés microbiennes présentes dans l’environnement hospitalier et établir les voies de contamination. Néanmoins, concluent-ils, l’étude démontre que proposer des stratégies génériques et des niveaux supplémentaires de stérilité basés sur la notion que les infections postopératoires résultent d’une certaine forme de contamination externe peut être un concept nécessitant une révision.
Cette histoire a été traduite de Univadis Italie, qui fait partie du réseau professionnel Medscape, utilise plusieurs outils éditoriaux, dont l’IA, dans le cadre de la démarche. Des éditeurs humains ont examiné ce contenu avant sa publication.
2024-05-03 10:18:30
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