En Afrique, des taux d’infection élevés entraînent des décès dus à la résistance aux antimicrobiens

Les agents pathogènes bactériens résistants aux antibiotiques étaient responsables d’un quart de million de décès en Afrique en 2019, a rapporté la semaine dernière une équipe internationale de chercheurs dans The Lancet Santé mondiale.

Ces 250 000 décès faisaient partie des plus d’un million associés à la résistance aux antimicrobiens (RAM) dans la région africaine de l’Organisation mondiale de la santé (OMS) en 2019, selon l’étude, la première à présenter des estimations de la RAM aux niveaux régional et national pour le continent. . Le nombre de décès associés à la RAM dépasse celui de deux des principales maladies infectieuses mortelles en Afrique : le VIH (639 544 décès en 2019) et le paludisme (594 348).

Bien que l’analyse ait révélé que la fraction des décès dus à des maladies infectieuses bactériennes en Afrique, associés à et attribuables à la RAM, était la plus faible de toutes les régions de l’OMS, les taux de mortalité liés à l’infection étaient les plus élevés, ce qui, selon les auteurs de l’étude, reflète le taux d’infection élevé du continent. taux.

“Malgré la prévalence relativement faible de la résistance dans la région, le grand nombre d’infections entraîne une mortalité élevée par RAM”, ont-ils écrit.

Calculer le fardeau de la RAM

La modélisation étudemenée par une équipe dirigée par des chercheurs de l’Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME) de l’Université de Washington et du Centre de médecine tropicale et de santé mondiale de l’Université d’Oxford, a utilisé des données provenant de diverses sources pour estimer les décès et la durée de vie ajustée en fonction de l’incapacité. -années (DALY) attribuables et associés à 12 syndromes infectieux majeurs, 23 pathogènes bactériens et 88 combinaisons médicament-pathogène dans les 47 pays de la région africaine de l’OMS en 2019.

La méthodologie de l’étude était similaire à l’approche utilisée dans le cadre de la recherche mondiale sur la résistance aux antimicrobiens (GRAM) de janvier 2022. rapport, qui estime que 1,27 million de décès dans le monde étaient directement imputables à la RAM en 2019 (sur 4,95 millions associés à des agents pathogènes résistants aux médicaments). Des études antérieures de la série ont analysé les décès associés et attribuables à la RAM dans le Région des Amériques et L’Europe .

Les données incluses dans l’analyse comprenaient 343 millions d’enregistrements individuels ou d’isolats bactériens collectés auprès des systèmes de surveillance mondiaux, régionaux et nationaux ; systèmes hospitaliers; revues systématiques de la littérature; et d’autres sources. Les chercheurs ont également examiné les facteurs sociodémographiques, la consommation d’antibiotiques, l’état des plans d’action nationaux contre la RAM des pays et l’accès à l’eau potable, à l’assainissement et à l’hygiène (WaSH).

Les chercheurs ont utilisé ces données pour estimer le nombre de décès dans lesquels l’infection a joué un rôle, la proportion de décès attribuables à un syndrome infectieux donné, la proportion de décès par syndrome infectieux imputables à un agent pathogène donné, le pourcentage d’agents pathogènes résistants à un antibiotique, et le risque excessif de mortalité associé à une infection résistante aux médicaments.

Comme dans les études précédentes, les chercheurs ont calculé le fardeau de la RAM (décès et DALY) en utilisant une approche basée sur deux scénarios contrefactuels. Pour estimer les décès directement attribuables à une infection bactérienne résistante aux médicaments, ils ont envisagé un scénario dans lequel ces infections étaient remplacées par des infections sensibles aux antibiotiques. Pour estimer les décès associés – c’est-à-dire les décès dans lesquels la RAM a pu jouer un rôle, mais une maladie sous-jacente en était également responsable – ils ont envisagé un scénario dans lequel les infections résistantes étaient remplacées par aucune infection.

Plus de 3,8 millions de décès dus à l’infection

Dans l’ensemble, l’analyse estime que 3,83 millions de décès dans la région africaine de l’OMS en 2019 étaient liés à une infection, et 1,86 million de ces décès impliquaient à la fois des bactéries résistantes et sensibles. Parmi ceux-ci, 1,05 millions étaient associés à la RAM et 250 000 étaient attribuables à la RAM.

Les quatre syndromes infectieux présentant la plus grande charge mortelle de RAM étaient les infections des voies respiratoires inférieures et du thorax (521 000 décès associés à la RAM et 119 000 décès imputables à la RAM), les infections du sang (236 000 décès associés à la RAM et 56 000 décès imputables à la RAM), les infections intra-abdominales ( 106 000 décès associés à la RAM et 26 000 décès imputables à la RAM) et à la tuberculose (42 000 décès associés à la RAM et 18 000 décès imputables à la RAM).

Collectivement, sept agents pathogènes ont été responsables de 821 000 décès associés à la RAM dans la région, quatre pathogènes dépassant chacun 100 000 décès : Streptococcus pneumoniae (195 000 décès), Klebsiella pneumoniae (184 000 décès), Escherichia coli (147 000 décès), et Staphylococcus aureus (136 000 décès).

Malgré la prévalence relativement faible de la résistance dans la région, le grand nombre d’infections entraîne une mortalité élevée par RAM.

Les trois combinaisons médicament-agent pathogène responsables de la plus grande proportion de décès attribuables à la RAM étaient résistantes aux céphalosporines de troisième génération. K pneumonie (19 000 décès), résistant au triméthoprime-sulfaméthoxazole Pneumonies (16 500 décès) et résistant à la méthicilline S. aureus (15 300 décès)

Le pays ayant le taux de mortalité global standardisé selon l’âge le plus élevé associé à et imputable à la RAM était la République centrafricaine, avec environ 251,3 décès associés à la RAM et 60,2 décès imputables à la RAM pour 100 000 habitants. Notamment, les deux autres pays qui ont dépassé 200 décès associés à la RAM pour 100 000 habitants – le Lesotho et l’Érythrée – disposent d’un plan d’action national contre la RAM qui est actuellement en cours de mise en œuvre.

L’analyse a également révélé que pour la plupart des pays africains, le nombre de décès associés et imputables à la RAM était plus élevé chez les nouveau-nés (28 jours et moins) que chez les groupes d’âge plus âgés, en particulier dans les pays d’Afrique centrale et occidentale.

Des vaccins, de l’eau potable et des antibiotiques efficaces pourraient aider

Dans l’ensemble, les chercheurs ont constaté que les pays qui ont un score de développement plus élevé et un meilleur accès à l’eau potable et à l’hygiène et qui utilisent plus d’antibiotiques par habitant avaient un fardeau de mortalité lié à la RAM inférieur. Les auteurs affirment que cela suggère qu’en Afrique, les décès dus à la RAM sont dus à des facteurs autres que l’utilisation élevée d’antibiotiques.

« Les taux d’infection élevés sont depuis longtemps reconnus comme responsables d’une mortalité et d’une morbidité immenses dans toute l’Afrique, et étant donné que la prévalence de la résistance est relativement faible dans cette région, nos résultats impliquent ces taux disproportionnés, en particulier pour des agents pathogènes spécifiques, comme principaux facteurs du fardeau de la RAM. ” ils ont écrit.

Afin de réduire le fardeau des maladies infectieuses et de la RAM sur le continent, ils appellent à un investissement renouvelé dans le développement et la distribution de vaccins susceptibles de prévenir certaines de ces infections, en particulier ceux ciblant S pneumoniae, K pneumoniae, E coli, et S. aureus– et pour un meilleur accès aux soins de santé primaires, aux antibiotiques efficaces et aux infrastructures WaSH.

Et bien qu’ils reconnaissent que l’analyse est limitée par le manque de données fiables de surveillance de la RAM dans de nombreux pays africains, ils affirment que les résultats pourraient être utilisés par les gouvernements locaux pour développer des programmes de gestion des antimicrobiens sur mesure et des politiques de prévention et de contrôle des infections qui atténuent le principal agent pathogène. combinaisons de médicaments.