L’étude la plus détaillée à ce jour sur les mécanismes par lesquels un type commun de bactérie, Staphylocoque dorés’adapte à la vie sur le corps humain pourrait contribuer à améliorer la prévention, le diagnostic et le traitement de certaines infections.
L’étude, menée par le Wellcome Sanger Institute, l’Université de Cambridge, l’Institut de biomédecine de Valence (IBV) du Conseil national espagnol de la recherche (CSIC) et leurs collaborateurs, a impliqué l’utilisation des génomes de milliers de S. aureus des isolats cultivés à partir du nez humain et sur la peau pour étudier quels gènes sont importants pour que les bactéries s’adaptent et persistent.
Publié aujourd’hui (13 janvier) dans Communications naturellesils ont utilisé une nouvelle approche d’analyse du génome des bactéries provenant de porteurs humains, pour mettre en évidence exactement comment ces bactéries s’adaptent dans leur habitat naturel. Cela a révélé des mutations clés qui permettent à certaines souches d’échapper au système immunitaire humain et de devenir résistantes aux antibiotiques.
Des recherches plus approfondies sont désormais nécessaires pour comprendre pleinement le rôle qu’elles jouent dans la colonisation humaine et s’il existe un moyen de cibler ces voies à l’avenir pour aider à prévenir, diagnostiquer ou traiter les infections causées par S. aureus.
Les bactéries se trouvent généralement dans ou sur le corps sans causer de dommages, ce que l’on appelle la colonisation. L’un d’eux est S. aureus, un type courant de bactérie que l’on retrouve dans le nez de jusqu’à 30 pour cent de la population mondiale ainsi que sur la peau ou dans l’intestin1.
Cependant, chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli, S. aureus peut pénétrer dans la circulation sanguine et provoquer des infections. Celles-ci peuvent aller d’infections bénignes de la peau et des tissus mous à des infections plus graves, notamment la septicémie et la pneumonie1.
Cette nouvelle étude est la première fois que des chercheurs effectuent une analyse génétique à grande échelle de S. aureus à partir d’échantillons de porteurs humains, au lieu d’observer les bactéries en laboratoire.
Les chercheurs ont identifié des changements dans les gènes associés au métabolisme de l’azote, ce qui suggère qu’il s’agit d’un processus métabolique clé nécessaire à la colonisation des humains par S. aureus. Ils ont également identifié des mutations dans les gènes qui pourraient influencer la façon dont les bactéries interagissent avec les cellules humaines et le système immunitaire.
Les chercheurs ont découvert que certains S. aureus Les souches présentent des mutations dans les gènes impliqués dans la régulation des facteurs utilisés par les bactéries pour échapper au système immunitaire humain, mettant peut-être en évidence une stratégie d’évasion du système immunitaire. Les chercheurs suggèrent également que ces souches bactériennes pourraient utiliser des facteurs sécrétés par d’autres souches bactériennes pour coloniser les humains sans les produire elles-mêmes – ce qu’ils appellent des cellules « tricheuses ».
De plus, cette étude a confirmé que S. aureus acquiert des mutations de résistance aux antibiotiques tels que l’acide fusidique, la mupirocine et le triméthoprime.
Dans l’ensemble, cette nouvelle recherche révèle des processus biologiques clés qui S. aureus emploie pour survivre chez les humains. L’étude de l’évolution et de l’adaptation génétique des bactéries dans leur environnement naturel, que ce soit lors de la colonisation asymptomatique de leurs porteurs ou lors de l’établissement et de l’évolution d’infections, peut contribuer à améliorer la prévention, le diagnostic et le traitement des maladies.
Le Dr Francesc Coll, premier auteur de l’Institut de biomédecine de Valence au Conseil national espagnol de la recherche (CSIC), a déclaré : « Comprendre comment les bactéries réagissent aux traitements antibiotiques a permis d’identifier les changements génétiques qui leur permettent de survivre à l’attaque de antibiotiques. Ces mutations peuvent être utilisées comme marqueurs de diagnostic, ainsi que pour concevoir de nouvelles stratégies thérapeutiques et une utilisation plus rationnelle et efficace des antibiotiques. Des études sur l’adaptation bactérienne comme celle-ci pourraient également révéler des mécanismes d’évasion immunitaire – comment les bactéries s’adaptent pour échapper à la reconnaissance. et attaque par notre système immunitaire. Cela pourrait aider à identifier de nouveaux antigènes, composants des bactéries que le système immunitaire reconnaît comme étrangers ou dangereux, et à concevoir de nouveaux vaccins.
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