« Histoire des contacts » : les généticiens réécrivent l’histoire des Néandertaliens et d’autres humains anciens | Agents BRILink et BRI

Depuis la découverte des premiers ossements de Néandertal en 1856, les gens s’interrogent sur ces anciens hominidés. En quoi sont-ils différents de nous ? Dans quelle mesure nous ressemblent-ils ? Nos ancêtres s’entendaient-ils avec eux ? Combattez-les? les aime? La découverte récente des Dénisoviens, un groupe de type Néandertalien qui habitait l’Asie et l’Asie du Sud, soulève ses propres questions.

Aujourd’hui, une équipe internationale de généticiens et d’experts en IA ajoute un nouveau chapitre à notre histoire commune des hominidés. Dirigés par Joshua Eke, professeur à l’Institut Lewis-Sigler de génomique intégrative à Princeton, les chercheurs ont découvert une histoire de métissage et d’échange génétique qui suggère une relation plus étroite qu’on ne le pensait auparavant entre ces anciens groupes humains.

“C’est la première fois que des généticiens identifient plusieurs vagues de mélange humain-néandertalien moderne”, a déclaré Liming Li, professeur au département de génétique médicale et de biologie du développement de l’Université du Sud-Est de Nanjing, en Chine, co-auteur de l’étude. Travaille comme chercheur au laboratoire AK.

“Nous savons maintenant que pendant la majeure partie de l’histoire de l’humanité, nous avons eu des contacts entre les humains modernes et les Néandertaliens”, a déclaré Eke. Les hominidés, nos ancêtres les plus directs, ont divergé de l’arbre généalogique des Néandertaliens il y a environ 600 000 ans, puis ont développé nos caractéristiques physiques modernes il y a environ 250 000 ans.

« Depuis lors et jusqu’à la disparition des Néandertaliens – soit environ 200 000 ans – les humains modernes ont interagi avec les populations néandertaliennes », a-t-il déclaré.

Les résultats de leurs travaux paraîtront dans le numéro actuel du magazine Science.

Les Néandertaliens, autrefois connus pour être des animaux lents et stupides, sont désormais considérés comme des chasseurs et des fabricants d’outils habiles, qui soignaient les blessures avec des techniques sophistiquées et étaient bien adaptés au climat froid européen.

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(Remarque : tous ces groupes d’hominidés étaient des humains, mais pour éviter d’être appelés « Néandertaliens », « Dénisoviens » et « versions anciennes de notre espèce humaine », la plupart des archéologues et anthropologues utilisent les abréviations Néandertaliens, Dénisoviens et humains modernes. )

En utilisant les génomes de 2 000 humains vivants, ainsi que de trois Néandertaliens et d’un Denisovan, Eke et son équipe ont cartographié le flux génétique entre les groupes d’hominidés au cours du dernier quart de million d’années.

Les chercheurs ont utilisé un outil génétique qu’ils ont conçu il y a plusieurs années, appelé iBDMix, qui utilise des techniques d’apprentissage automatique pour décoder le génome. Des chercheurs précédents se sont appuyés sur la comparaison du génome humain avec une « population de référence » d’humains modernes, dont on pense qu’ils ont peu ou pas d’ADN de Néandertal ou de Dénisovien.

L’équipe d’Eke a déterminé que même dans le groupe mentionné, qui vivait à des milliers de kilomètres au sud des grottes de Néandertal, il y avait une petite quantité d’ADN de Néandertal, probablement amené vers le sud par des voyageurs (ou leurs descendants).

Avec IBDemics, l’équipe d’Aki a identifié la première vague de contact il y a environ 200 à 250 000 ans, la deuxième vague il y a environ 100 à 120 000 ans et la plus grande vague il y a environ 50 à 60 000 ans.

Cela contraste fortement avec les données génétiques précédentes. « À ce jour, la plupart des données génétiques suggèrent que les humains modernes ont évolué en Afrique il y a environ 250 000 ans et y sont restés pendant les 200 000 années suivantes. Alors “Il y a 50 000 ans, ils ont décidé de quitter l’Afrique et de rejoindre les peuples du monde entier”, a déclaré Eke.

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« Notre modèle montre qu’il n’y a pas eu une longue période de stagnation, mais plutôt que peu de temps après l’émergence de l’homme moderne, nous avons connu une migration hors d’Afrique et également vers l’Afrique », a-t-il déclaré. “Pour moi, cette histoire parle de dispersion, selon laquelle les humains modernes se sont déplacés et ont rencontré les Néandertaliens et les Dénisoviens bien plus tôt que nous ne le savions auparavant.”

Cette vision de l’humanité est cohérente avec les recherches archéologiques et paléoanthropologiques montrant l’échange de culture et d’outils entre groupes d’hominidés.

L’idée principale de Lee et Ake était de rechercher l’ADN humain moderne dans le génome de Néandertal, et non l’inverse. “La plupart des recherches génétiques de la dernière décennie se sont concentrées sur la façon dont l’accouplement avec les Néandertaliens a affecté le phénotype des humains modernes et notre histoire évolutive – mais ces questions sont également pertinentes et intéressantes dans le cas contraire”, a déclaré Ake.

Ils ont réalisé que les descendants de la première vague d’accouplements néandertaliens-modernes devaient provenir des Néandertaliens, ne laissant aucune trace d’êtres humains vivants. “Comme nous pouvons désormais inclure une composante néandertalienne dans nos études génétiques, nous assistons à cette dispersion précoce d’une manière jamais vue auparavant”, a déclaré Eke.

La dernière pièce du puzzle consistait à découvrir que la population néandertalienne était encore plus petite qu’on ne le pensait auparavant.

La modélisation génétique traditionnelle utilise la variation – la diversité – pour tenir compte de la taille de la population. Plus les gènes sont diversifiés, plus la population est nombreuse. Mais en utilisant IBDomics, l’équipe d’Eke a montré que la majeure partie de cette diversité provient de séquences d’ADN prélevées sur les humains modernes, leur vaste population.

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En conséquence, la population effective des Néandertaliens a été réduite d’environ 3 400 individus reproducteurs à environ 2 400.

Dans l’ensemble, ces nouvelles découvertes donnent une idée de la façon dont les Néandertaliens ont disparu des archives il y a environ 30 000 ans.

“Je n’aime pas parler d’extinction, car je pense que la plupart des Néandertaliens ont été absorbés”, a déclaré Ake. Leur idée est que la population néandertalienne a progressivement décliné jusqu’à ce que les derniers survivants se transforment en une communauté d’humains modernes.

Ce « modèle d’assimilation » a été exprimé pour la première fois en 1989 par Fred Smith, professeur d’anthropologie à l’Université d’État de l’Illinois. “Nos résultats fournissent des données génétiques solides cohérentes avec l’hypothèse de Fred, et je trouve cela très intéressant”, a déclaré Ake.

“Les Néandertaliens étaient probablement au bord de l’extinction depuis très longtemps”, a-t-il déclaré. « Si vous réduisez leur nombre de 10 ou 20 %, comme nous l’estimons, cela représente une réduction énorme dans une population déjà à risque.

« Les humains modernes sont fondamentalement comme des vagues qui s’écrasent sur le rivage, détruisant lentement mais sûrement le littoral. Finalement, nous avons dépassé démographiquement les Néandertaliens et les avons assimilés à la population humaine moderne.

,Le flux génétique est récurrent entre les Néandertaliens et les humains modernes au cours des 200 000 dernières années”, par Liming Li, Troy J. Comey, Rob F. Bierma et Joshua M. Akey sont apparus dans le numéro du 13 juillet de la revue Science (DOI : ). 10.1126/science.etc1768Cette recherche a été soutenue par les National Institutes of Health (subvention R01GM110068 à JMA).

2024-07-13 17:19:19
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