Dans une récente étude publiée sur Place de la recherche*, les chercheurs ont caractérisé les isolats cliniques du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) Omicron BA.4 et BA.5.
Arrière plan
Le SRAS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529) s’est rapidement propagé à l’échelle mondiale depuis son émergence en novembre 2021. Cinq sous-lignées d’Omicron (BA.1 à BA.5) ont été identifiées. BA.2 aurait été la variante la plus répandue dans de nombreuses régions; Pourtant, BA.4 et BA.5 sont répandus au Botswana, en Afrique du Sud et au Portugal.
Les variantes BA.4 et BA.5 hébergent des mutations supplémentaires (L452R, F486V, R493Q et 69-70del) dans la protéine de pointe par rapport à BA.1/BA.2. Des études ont démontré que la substitution L452R améliorait l’infectivité virale et la fusogénicité dans Omicron et les variantes précédentes. Des rapports suggèrent que la pathogénicité et l’infectiosité des variants de BA.4/5 pourraient être supérieures à celles de BA.1/2.
L’étude et les conclusions
Dans la présente étude, les chercheurs ont étudié la pathogénicité et la capacité de réplication des authentiques BA.4 et BA.5 dans des modèles animaux. Des variantes d’Omicron ont été isolées chez des patients atteints de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Tout d’abord, ils ont testé la pathogénicité chez des hamsters syriens de type sauvage (WT). Les animaux ont été infectés par 105 unités formant plaque (PFU) de BA.4 ou BA.5. Les animaux ont été inoculés séparément avec des isolats cliniques des variants Delta (B.1.617.2) et BA.2.
L’infection delta a provoqué une perte de poids significative sept jours après l’infection (dpi). En revanche, presque tous ceux infectés par BA.4/5 ont pris du poids au cours de la période d’étude, comme les hamsters infectés par BA.2. Ensuite, des hamsters ont été infectés individuellement avec les quatre isolats pour examiner les niveaux d’infection dans leurs voies respiratoires. Les animaux ont été euthanasiés à 3 et 6 dpi pour récolter les cornets nasaux et les poumons. Les titres viraux ont été quantifiés à l’aide d’essais sur plaque sur des cellules Vero E6.
La réplication de BA.2, BA.4 ou BA.5 a été observée dans les poumons et les cornets nasaux à 3 dpi sans différences significatives dans les titres viraux des variants d’Omicron. Cependant, les titres viraux dans les poumons/cornets nasaux des animaux infectés par Delta étaient significativement plus élevés que ceux infectés par des variantes d’Omicron. Les titres viraux dans les poumons des animaux infectés par BA.4 étaient significativement inférieurs à ceux des hamsters infectés par Delta à 6 dpi.
En outre, les auteurs ont répété les enquêtes antérieures en utilisant des hamsters transgéniques exprimant l’enzyme de conversion de l’angiotensine humaine 2 (hACE2). L’infection delta a entraîné une perte de poids importante; tous les animaux ont succombé à 5 dpi. Au contraire, tous les animaux inoculés avec BA.4/5 ont survécu. Les titres viraux dans les poumons et les cornets nasaux des hamsters infectés par BA.4/5 étaient significativement inférieurs à ceux du groupe infecté par Delta.
Les évaluations histopathologiques ont révélé que les animaux infectés par des variantes d’Omicron ne présentaient aucune inflammation dans la région alvéolaire ou les voies respiratoires périphériques à 3 dpi. À 6 dpi, des cellules inflammatoires telles que des neutrophiles et des cellules mononucléaires se sont infiltrées dans les régions péribronchiolaire et péribronchique de hamsters infectés par BA.2/4/5. De plus, la pneumonie n’était pas évidente à aucun moment. D’autre part, les animaux infectés par Delta présentaient une inflammation péribronchiolaire/péribronchique de 3 dpi.
L’infiltration de cellules inflammatoires dans les régions alvéolaires était importante à 6 dpi chez les animaux infectés par Delta. La distribution de l’ARN viral chez les animaux infectés par Omicron était comparable. De plus, 10 hamsters WT ont été inoculés avec un mélange 1:1 de BA.2 et BA.4 à 2 x 105 PFU. Les poumons et les cornets nasaux ont été prélevés à 2 et 4 dpi. Un séquençage de nouvelle génération a été effectué et la proportion de chaque variante a été estimée en fonction des différences entre les deux variantes dans cinq régions de pointe.
La proportion de BA.4 était légèrement plus élevée dans les cornets nasaux et les poumons à 2 dpi que dans l’inoculum. À 4 dpi, la proportion de BA.4 a augmenté dans les cornets nasaux chez tous les animaux infectés, mais l’augmentation proportionnelle dans les poumons n’était évidente que chez deux animaux. Des expériences similaires ont été réalisées en utilisant BA.2 et BA.5. Les auteurs ont noté que la proportion du variant BA.5 dans les cornets nasaux était plus élevée à 2 et 4 dpi. Des résultats comparables ont été obtenus avec des échantillons pulmonaires chez tous les hamsters à l’exception d’un animal à 2 dpi.
conclusion
L’étude a révélé que les variantes SARS-CoV-2 Omicron BA.4 et BA.5 étaient moins pathogènes que la variante Delta mais comparables à Omicron BA.2 chez les hamsters WT et transgéniques. Ces résultats contredisaient les conclusions d’une étude antérieure qui rapportait une pathogénicité plus élevée de BA.4/5 que de BA.2. Notamment, étant donné le manque apparent de données cliniques, il convient d’étudier si la pathogénicité atténuée de BA.4/5 chez les hamsters se refléterait également chez les humains.
*Avis important
Research Square publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
