(CNN) — Les maux d’oreilles de Cynthia Horton sont de véritables cauchemars.
«Je peux me réveiller avec une douleur horrible, comme si j’avais un canal radiculaire sans anesthésie», a-t-elle déclaré. “Quand je m’assois, mon oreille pleure souvent à cause d’une infection, voire même du sang suintant.”
Déjà affaibli par une bataille de toute une vie contre le lupus, le système immunitaire de Horton a été dévasté par des séries de radiothérapie et de chimiothérapie après une opération chirurgicale en 2003 pour une tumeur cancéreuse à l’oreille.
Les otites sont devenues la norme, généralement soulagées par une série d’antibiotiques. Mais au fil des années, les bactéries présentes dans l’oreille de Horton, 61 ans, sont devenues résistantes aux antibiotiques, ne lui laissant souvent que peu ou pas de soulagement.
« Ces superbactéries multirésistantes peuvent provoquer des infections chroniques chez les individus pendant des mois, des années, voire des décennies. C’est ridicule à quel point certaines de ces bactéries deviennent virulentes avec le temps », a déclaré Dwayne Roach, professeur adjoint de bactériophages, de maladies infectieuses et d’immunologie à l’Université d’État de San Diego.
L’année dernière, les médecins ont proposé de traiter l’infection de Horton avec l’un des plus anciens prédateurs naturels : de minuscules virus ressemblant à des trépieds, appelés phages, conçus pour trouver, attaquer et engloutir les bactéries.
Ces créatures microscopiques ont sauvé la vie de patients mourant d’infections par des superbactéries et sont utilisées dans des essais cliniques comme solution potentielle au problème croissant de la résistance aux antibiotiques. Aux États-Unis seulement, plus de 2,8 millions d’infections résistantes aux antimicrobiens surviennent chaque année.
De telles infections constituent une « menace urgente pour la santé publique mondiale », tuant 5 millions de personnes dans le monde, selon les statistiques de 2019 des Centers for Disease Control and Prevention des États-Unis.
“On estime que d’ici 2050, 10 millions de personnes par an – soit une personne toutes les trois secondes – mourront d’une infection par un superbactérie”, a déclaré l’épidémiologiste des maladies infectieuses Steffanie Strathdee, codirectrice du premier centre dédié à la phagothérapie en Amérique du Nord. le Center for Innovative Phage Applications and Therapeutics, ou IPATH, de la faculté de médecine de l’UC San Diego.
Désireuse de trouver une solution différente à ses otites récurrentes, Horton était partante. Des échantillons de ses bactéries résistantes aux médicaments ont été expédiés du cabinet de son médecin en Pennsylvanie à l’IPATH de l’UC San Diego dans l’espoir que les chasseurs de phages pourraient y trouver une correspondance. Ce que les scientifiques ont découvert ensuite était cependant inattendu.
Les bactéries cultivées dans l’oreille de Horton correspondaient parfaitement à une superbactérie rare trouvée dans certaines marques de gouttes oculaires en vente libre qui privaient les gens de leur vision et de leur vie.
Soudain, la recherche d’une solution au problème de Horton prit un nouveau sens. Les bactéries de son oreille aideraient-elles les scientifiques à trouver des phages qui traiteraient également les infections oculaires ?
Durable et contagieux
Des cas graves d’infections oculaires résistantes aux antibiotiques ont commencé à apparaître en mai 2022. En janvier suivant, le CDC a déclaré qu’au moins 50 patients dans 11 États avaient développé des infections par des superbactéries après avoir utilisé des larmes artificielles sans conservateur. En mai 2023, l’épidémie s’était étendue à 18 États : quatre personnes sont mortes, quatre autres ont perdu leurs yeux, 14 ont souffert d’une perte de vision et des dizaines d’autres ont développé des infections dans d’autres parties du corps.
« Seule une fraction des patients souffraient d’infections oculaires, ce qui a rendu l’épidémie incroyablement difficile à résoudre », a déclaré l’épidémiologiste Dr Maroya Walters, qui a dirigé l’enquête sur les larmes artificielles du CDC.
“Nous avons vu des personnes colonisées par cet organisme développer des infections des voies urinaires ou respiratoires des mois plus tard, même si elles n’utilisaient plus ces gouttes”, a déclaré Walters. « Un patient a transmis l’infection à d’autres personnes dans l’établissement de santé. »
Le coupable était une souche rare de Pseudomonas aeruginosa résistante aux médicaments qui n’avait jamais été identifiée aux États-Unis avant l’épidémie, ont indiqué les CDC.
Horton n’avait jamais utilisé de gouttes pour les yeux, mais les bactéries cultivées dans son oreille étaient de la même souche rare. En utilisant ces bactéries et d’autres échantillons envoyés par le CDC, les scientifiques de l’IPATH se sont immédiatement mis au travail et ont identifié plus d’une douzaine de phages qui ont réussi à attaquer l’agent pathogène mortel.
Les scientifiques du CDC ont été intrigués par cette découverte, à tel point qu’ils ont mentionné la disponibilité du traitement phagique contre la superbactérie sur le site Web du CDC.
“Cela a soulevé cette idée : lorsque nous avons une épidémie causée par des bactéries avec des options de traitement si limitées, devrions-nous penser à ces thérapies alternatives ?” » dit Walters.
Quelle est cette petite créature capable de renverser des bactéries capables de résister à tous les médicaments que la science moderne peut rassembler ? Et plus important encore, le traitement par les phages pourrait-il devenir un acteur majeur dans la lutte pour mettre fin à la crise des superbactéries ?
La guerre microscopique en nous
Grâce à l’évolution, les milliards de bactéries présentes dans le monde ont aujourd’hui un ennemi naturel : de minuscules virus appelés bactériophages, génétiquement programmés pour des missions de recherche et de destruction. Dans ce jeu microscopique de « The Terminator », chaque ensemble de phages est spécialement conçu pour trouver, attaquer et dévorer un type spécifique d’agent pathogène.
“Chaque espèce bactérienne, ou même les génotypes qu’elle contient, peuvent avoir tout un répertoire de phages qui l’attaquent, en utilisant une grande variété de méthodes pour pénétrer et affaiblir la cellule bactérienne”, a déclaré Paul Turner, professeur d’écologie et de biologie évolutive à l’Université de New York. Université de Yale et membre du corps professoral de microbiologie à la Yale School of Medicine de New Haven, Connecticut.
Pour contrer l’attaque, les bactéries emploient diverses manœuvres d’évitement, telles que la perte de leur enveloppe extérieure pour éliminer les ports d’accueil que le phage utilise pour pénétrer, ravager et finalement faire exploser l’agent pathogène en morceaux de substance bactérienne.
C’est une bonne nouvelle, car les bactéries nouvellement nues pourraient perdre leur résistance aux antibiotiques et redevenir vulnérables à l’élimination. Le phage, cependant, est mis hors de combat, ne pouvant plus se battre.
Pour maximiser le succès, les spécialistes recherchent une variété de phages pour lutter contre une superbactérie particulièrement méchante – créant parfois un cocktail de guerriers microscopiques qui, espérons-le, pourront poursuivre l’attaque une fois l’un d’entre eux neutralisé.
C’est ce qui est arrivé en 2016 au mari de Strathdee, Tom Patterson, professeur de psychiatrie à la retraite à l’UC San Diego. En raison d’une infection par « Iraqibacter », une bactérie résistante aux médicaments trouvée dans les sables irakiens, Patterson était en défaillance multiviscérale et dangereusement proche de la mort. Dans une course contre la montre, Strathdee a surmonté d’incroyables obstacles pour trouver et livrer plusieurs cocktails de phages purifiés aux médecins de Patterson.
L’un de ces cocktails contenait un phage qui “a tellement effrayé la bactérie qu’il a laissé tomber sa capsule externe”, a déclaré Strathdee, doyen associé des sciences de la santé mondiale à l’UC San Diego et co-auteur de “The Perfect Predator: A Scientist’s Race to Save Her”. Mari issu d’une superbactérie mortelle.
« Il avait plus peur du phage, si vous voulez, que de l’antibiotique, et cela a permis à l’antibiotique de fonctionner à nouveau. C’était le coup de poing dont Tom avait besoin », a déclaré Strathdee. «Trois jours plus tard, Tom a levé la tête de l’oreiller pour sortir d’un profond coma et a embrassé la main de sa fille. C’était tout simplement miraculeux.
Phagothérapie 3.0
Dans les laboratoires de tout le pays, les scientifiques spécialisés dans les phages font passer la recherche et la découverte à un niveau supérieur, ou ce que Strathdee appelle le « phage 3.0 ». Les scientifiques du laboratoire Turner de Yale sont en train de cartographier quels phages et antibiotiques sont les plus symbiotiques dans la lutte contre un agent pathogène. Le laboratoire de l’État de San Diego de Roach étudie la réponse immunitaire du corps aux phages tout en développant de nouvelles techniques de purification des phages pour préparer des échantillons destinés à une utilisation intraveineuse chez les patients.
Actuellement, des essais cliniques sont en cours pour tester l’efficacité des phages contre les infections rebelles des voies urinaires, la constipation chronique, les infections articulaires, les ulcères du pied diabétique, l’amygdalite et les infections persistantes et récurrentes qui surviennent chez les patients atteints de mucoviscidose. Les infections chroniques courantes dans la mucoviscidose sont généralement dues à diverses souches de Pseudomonas aeruginosa résistantes aux médicaments – le même agent pathogène responsable de l’infection de l’oreille de Horton et de l’épidémie de larmes artificielles.
Un certain nombre de laboratoires développent des bibliothèques de phages, constituées de souches trouvées dans la nature et connues pour être efficaces contre un agent pathogène particulier. Au Texas, une nouvelle installation va encore plus loin : accélère l’évolution en créant des phages en laboratoire.
“Plutôt que de simplement extraire de nouveaux phages de l’environnement, nous disposons d’un bioréacteur qui crée en temps réel des milliards et des milliards de phages”, a déclaré Anthony Maresso, professeur agrégé au Baylor College of Medicine de Houston.
« La plupart de ces phages ne seront pas actifs contre les bactéries résistantes aux médicaments, mais à un moment donné, il y aura une variante rare qui aura été entraînée, pour ainsi dire, à attaquer les bactéries résistantes, et nous l’ajouterons à notre programme. arsenal », a déclaré Maresso. “Il s’agit d’une approche de nouvelle génération en matière de bibliothèques de phages.”
Le laboratoire de Maresso a publié l’année dernière une étude sur le traitement de 12 patients avec des phages adaptés au profil bactérien unique de chaque patient. Ce fut un succès mitigé : les bactéries résistantes aux antibiotiques chez cinq patients ont été éradiquées, tandis que plusieurs autres patients ont montré des améliorations.
« De nombreuses approches sont actuellement mises en œuvre en parallèle », a déclaré Roach. « Est-ce que nous concevons des phages ? Faisons-nous un cocktail de phages, et quelle est la taille du cocktail ? Est-ce que c’est deux phages ou 12 phages ? Les phages doivent-ils être inhalés, appliqués localement ou injectés par voie intraveineuse ? Il y a beaucoup de travail en cours sur la meilleure façon de procéder.
À ce jour, la manipulation génétique des phages a été difficile en raison de la nature rationalisée de la créature : « Les phages normaux sont optimisés par l’évolution pour devenir des machines à tuer maigres et méchantes. Il y a très peu de place là-dedans pour que nous puissions intervenir et changer les choses », a déclaré Elizabeth Villa, professeur de biologie moléculaire à l’UC San Diego qui étudie une nouvelle forme de phage appelée phages « géants ».
“Les phages géants ont un génome très volumineux et sont proches d’avoir un noyau qui encapsule le matériel génétique, ce qui les protège de certains des mécanismes que les bactéries utilisent contre les phages pour les désactiver”, a déclaré le Dr Robert “Chip” Schooley, spécialiste des maladies infectieuses. spécialiste à l’UC San Diego qui est codirecteur de l’IPATH.
“Cela leur donne également la possibilité d’être modifiés pour devenir plus puissants, ce sont donc des phages très prometteurs pour une utilisation thérapeutique”, a déclaré Schooley.
Les phages génétiquement modifiés permettraient aux scientifiques de cibler le mélange unique d’agents pathogènes résistants aux antibiotiques de chaque personne au lieu de fouiller les eaux usées, les tourbières, les étangs, les cales des bateaux et autres terrains de reproduction privilégiés pour les bactéries afin de trouver le phage idéal pour le travail.
Outre les bibliothèques de phages, le génie génétique est également essentiel pour produire des phages en masse et les distribuer à une plus grande échelle. En Russie et en Géorgie, où la phagothérapie est utilisée depuis des décennies, les patients peuvent acheter des cocktails de phages dans les pharmacies.
Tous ces travaux ont attiré l’attention du CDC. En plus d’utiliser un cocktail de phages pour traiter une épidémie de superbactérie en temps réel, les phages pourraient également aider à lutter contre un problème plus large : la recolonisation de la personne infectée par la même superbactérie, a déclaré Walters du CDC.
“Le problème est que lorsque les patients ont des infections par ces bactéries résistantes aux médicaments, ils peuvent toujours transporter cet organisme dans ou sur leur corps même après le traitement”, a déclaré Walters. “Ils ne présentent aucun signe ou symptôme de maladie, mais ils peuvent à nouveau contracter des infections et transmettre la bactérie à d’autres personnes.”
Cependant, si les phages pouvaient être utilisés pour « décoloniser » une population bactérienne chez une personne à haut risque, « les patients pourraient vraiment réduire le risque de développer une infection et de la transmettre à d’autres, ce qui constitue une grande partie du problème », a déclaré Walters.
“Nous envisageons d’essayer de développer une collection de phages sélectionnés qui seraient actifs contre un grand nombre de certains organismes résistants”, a-t-elle ajouté. « Pseudomonas est un bon point de départ : il existe plus de 140 espèces différentes. Mais il existe de nombreux autres organismes qui nous menacent et auxquels nous devons également nous attaquer.
2024-01-22 04:46:21
1705895437
#crise #des #superbactéries #menace #tuer #millions #personnes #par #dici #Les #scientifiques #pourraient #avoir #une #solution