La surveillance environnementale des eaux usées menée à Jérusalem, en Israël, a détecté une population croissante de poliovirus de type 2. De plus, ces isolats viraux sont associés à des souches virales dérivées de vaccins. Un rapport détaillé vient d’être publié dans Eurosurveillancela revue européenne sur la surveillance, l’épidémiologie, la prévention et le contrôle des maladies infectieuses.
Communication rapide : Émergence du poliovirus génétiquement lié de type 2 d’origine vaccinale en l’absence de vaccin antipoliomyélitique oral, Jérusalem, avril à juillet 2022. Crédit d’image : Kateryna Kon/Shutterstock
Arrière plan
Les programmes de surveillance environnementale visent à détecter les agents pathogènes circulants dans différentes sources impliquées dans la transmission des agents pathogènes. Les sources les plus couramment utilisées sont les eaux usées, les eaux usées, l’eau potable, l’air et les fomites. Ces programmes sont particulièrement nécessaires pour surveiller l’abondance d’agents pathogènes cliniquement non détectés et leur capacité à causer des risques pour la santé publique.
Le programme de surveillance environnementale d’Israël couvre 15 régions à travers le pays, dont 50% de la population générale. De plus, Jérusalem compte quatre régions de surveillance qui ne se chevauchent pas.
Détection et analyse génomique du poliovirus de type 2
Des programmes supplémentaires de surveillance des eaux usées ont accru la surveillance de la paralysie flasque aiguë liée au poliovirus en Israël depuis 1989. La présence du poliovirus de type 2 a été détectée dans deux régions de Jérusalem et une région du centre d’Israël en avril 2022.
D’ici juillet 2022, le nombre de détections de poliovirus de type 2 dans les eaux usées a considérablement augmenté dans les régions de Jérusalem. De plus, le séquençage génomique des isolats viraux a montré l’accumulation de mutations au fil du temps.
Dans trois régions différentes de Jérusalem, deux isolats de poliovirus de type 2 ont été détectés sur une période de 100 jours. L’analyse de séquençage a révélé que ces isolats sont associés au poliovirus dérivé du vaccin.
Cinq isolats supplémentaires de poliovirus de type 2 ont été détectés au cours de la même période ; cependant, ces isolats ne sont pas liés à la souche virale dérivée du vaccin. Les séquences de poliovirus de type 2 isolées en 2022 se sont avérées partager une signature à 2 nucléotides dans le gène VP1. Ce gène code pour la principale protéine de capside virale VP1.
Pour mieux identifier le lien génétique entre les isolats, un séquençage du génome entier a été réalisé pour les isolats collectés entre 2020 et 2022. Les résultats ont montré la présence de mutations supplémentaires dans la région génomique P1 sur toutes les séquences isolées en 2022. La région P1 comprend VP1 , VP2, VP3 et VP4. Cependant, ces mutations partagées n’étaient pas présentes dans les séquences isolées en 2020 et 2021.
En ce qui concerne la région génomique P2/3, une recombinaison avec un entérovirus non poliomyélitique a été détectée dans le gène 3A. Cependant, cette recombinaison était absente dans toutes les séquences de poliovirus isolées en 2020 et 2021.
Dans l’ensemble, ces observations identifient fortement la liaison génétique entre toutes les séquences de poliovirus de type 2 isolées en 2022.
Importance de l’étude
La surveillance environnementale en Israël a détecté une fréquence croissante d’isolats de poliovirus de type 2 dans différentes régions de Jérusalem. Ces isolats sont génétiquement associés à la souche de poliovirus de type 2 dérivée du vaccin.
Les poliovirus dérivés de vaccins proviennent principalement de souches vaccinales de poliovirus oraux génétiquement mutées qui accumulent des mutations au fil du temps. Un taux élevé de transmission virale dans les populations à faible immunité, ou un taux élevé de réplication virale chez les patients immunodéprimés, est responsable de l’origine des poliovirus dérivés de vaccins.
La vaccination orale contre le poliovirus de type 2 a été interrompue dans le monde en avril 2016 en raison de l’émergence d’épidémies induites par le poliovirus de type 2 d’origine vaccinale. Par conséquent, la vaccination orale monovalente contre le poliovirus de type 2 a été introduite comme mesure préventive pour contrôler ces épidémies.
En juillet 2022. Seule une transmission localisée du poliovirus de type 2 a été détectée à Jérusalem. Aucune incidence de paralysie flasque aiguë induite par le virus n’a été observée jusqu’à présent. Pour contrôler ces épidémies, le ministère israélien de la Santé a décidé de vacciner les enfants avec des vaccins antipoliomyélitiques inactivés.
Dans l’ensemble, l’étude souligne l’importance de la surveillance environnementale de routine pour identifier rapidement les épidémies causées par des poliovirus dérivés de vaccins et contrôler les épidémies grâce à des campagnes de vaccination rapides.
