Arrière plan:
La pathogenèse moléculaire de la leucémie lymphocytaire à grandes cellules T (T-LGLL), une leucémie à cellules T matures résultant généralement du récepteur des cellules T αβ-CD8 positif+ lymphocytes T cytotoxiques à mémoire, n’est que partiellement compris. Le rôle de la méthylation dérégulée dans T-LGLL n’est pas bien connu. Nous avons analysé le profil épigénétique des cellules T-LGLL de 11 patients par rapport à leurs homologues normaux par profilage de la méthylation de l’ADN basé sur la matrice. Pour l’identification des événements moléculaires à l’origine de la pathogenèse de la T-LGLL, nous avons comparé les loci différentiellement méthylés entre les cas de T-LGLL et les cellules T normales avec les données de segmentation de la chromatine des cellules T bénignes du projet BLUEPRINT. De plus, nous avons analysé les données d’expression génique des cellules T-LGLL et T bénignes et validé les résultats par pyroséquençage dans une cohorte étendue de 17 patients, dont cinq patients avec des échantillons séquentiels.
Résultats:
Nous avons identifié une dérégulation de la méthylation de l’ADN associée à une expression génique altérée dans T-LGLL. Le T-LGLL étant une maladie rare, la taille des échantillons est faible. Mais comme confirmé pour chaque échantillon, l’hyperméthylation des cellules T-LGLL sur divers sites CpG situés dans les régions amplificatrices est une caractéristique de cette maladie. L’interaction de BLC11B et C14orf64, comme suggéré par l’analyse des données in silico, pourrait fournir un nouveau mécanisme pathogénique qui nécessite une étude expérimentale plus approfondie.
Conclusion :
La méthylation de l’ADN est altérée dans les cellules T-LGLL par rapport aux cellules T bénignes. En particulier, BCL11B est fortement méthylé de manière différentielle dans les cellules T-LGLL. Bien que nos résultats doivent être validés sur une plus grande cohorte de patients, BCL11B pourrait être considéré comme un biomarqueur potentiel de cette leucémie. De plus, l’expression génique altérée et l’hyperméthylation des régions activatrices pourraient servir de mécanismes potentiels pour le traitement de cette maladie. Les interactions géniques des gènes dérégulés, comme BLC11B et C14orf64, peuvent jouer un rôle important dans les mécanismes pathogènes et doivent être analysées plus en détail.
Mots clés:
BCL11B ; méthylation de l’ADN ; Leucémie lymphocytaire à gros grains ; pyroséquençage ; T-LGLL.
