2024-08-09 09:42:02
Réviseur n°1 (révision publique) :
Dans ce manuscrit, les auteurs utilisent une approche protéomique et génétique combinée pour identifier le facteur QC de la glycoprotéine malectine comme une protéine importante impliquée dans la promotion de l’infection par le coronavirus. En utilisant des approches protéomiques, ils montrent que la protéine non structurale NSP2 et la malectine interagissent en l’absence d’infection virale, mais pas en présence d’une infection virale. Cependant, la NSP2 et la malectine engagent toutes deux le complexe OST pendant l’infection virale, la malectine montrant également des interactions réduites avec d’autres protéines QC de la glycoprotéine. La malectine KD réduit la réplication des coronavirus, y compris le SARS-COV2. Collectivement, ces résultats identifient la malectine comme une protéine QC de la glycoprotéine impliquée dans la régulation de la réplication du coronavirus qui pourrait potentiellement être ciblée pour atténuer la réplication du coronavirus.
Dans l’ensemble, les expériences décrites semblent bien réalisées et les interprétations reflètent généralement les résultats. De plus, ce travail identifie la Malectine comme une protéine provirale importante dont l’activité pourrait potentiellement être ciblée thérapeutiquement pour le traitement général de l’infection à coronavirus. Cependant, le travail présente certaines faiblesses qui, si elles étaient corrigées, amélioreraient l’impact du manuscrit.
Notamment, le mécanisme par lequel la malectine régule la réplication virale n’est pas bien décrit. Il ressort clairement des travaux présentés que la malectine est une protéine provirale, mais la base mécaniste de cette activité n’est pas abordée. Certains mécanismes potentiels sont proposés dans la discussion, mais le manuscrit serait renforcé si des informations supplémentaires étaient incluses. Par exemple, l’UPR est-il activé à des niveaux plus élevés dans les cellules infectées dépourvues de malectine ? Les profils de glycosylation des protéines virales (ou non virales) changent-ils dans les cellules dépourvues de malectine ? Des informations supplémentaires sur cette question spécifique amélioreraient considérablement le manuscrit.
De plus, les preuves d’une augmentation des interactions entre l’OST et la malectine au cours d’une infection virale sont assez faibles, bien qu’elles constituent un point de discussion majeur tout au long du manuscrit. Les interactions réduites entre la malectine et d’autres facteurs de contrôle de la qualité de la glycoprotéostasie sont évidentes, mais les interactions accrues avec l’OST ne sont pas bien étayées. Je recommanderais de prendre du recul sur ce point tout au long du texte, en continuant plutôt à souligner les interactions réduites.
J’étais également curieux de savoir pourquoi les protéines non structurelles, nsp2 et nsp4, montraient des interactions robustes avec les protéines de l’hôte localisées à la fois dans le RE et dans les mitochondries ? Ces protéines se localisent-elles dans des organites différents ou ces interactions reflètent-elles un autre type de dysrégulation ? Il serait utile de fournir quelques spéculations sur ce point.
Encore une fois, l’identification globale de la malectine comme une protéine provirale impliquée dans la réplication de plusieurs coronavirus différents est intéressante et importante, mais des informations supplémentaires sur le mécanisme de cette activité renforceraient l’impact global de ce travail.
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