Le lynx ibérique a augmenté sa diversité génétique grâce au mélange avec le lynx boréal

Le séquençage du génome complet du lynx ibérique (Panthère Lynx), publié en 2016, a fourni un outil précieux aux chercheurs travaillant sur la conservation de cet animal emblématique de la faune péninsulaire. Parallèlement aux efforts visant à augmenter la population du fluide, les experts soulignent qu’il est essentiel d’assurer une variété génétique pour que l’espèce puisse s’adapter aux changements de l’environnement, consolider sa capacité de reproduction ou augmenter ses chances de survivre aux maladies.

Ce lundi, un nouvelle étude mené par des chercheurs de la Station Biologique de Doana apporte de nouvelles informations sur le passé génétique de l’espèce. Les travaux indiquent que la diversité génétique des lynx ibériques actuels est supérieure à celle que possédait l’espèce il y a des milliers d’années. Les chercheurs pensent que le mélange génétique avec son plus proche parent, le lynx commun (lynx lynxégalement appelé boréal ou eurasien), a contribué à la plus grande variation génétique du lynx ibérique moderne, malgré la réduction de la population au cours des derniers siècles.

Il est estimé que Il y a des milliers d’années, l’aire de répartition du lynx ibérique s’étendait au sud de la France et à l’Italie.. Le lynx boréal, quant à lui, est venu habiter jusqu’à récemment le nord de la péninsule, créant ainsi des opportunités d’échanges génétiques entre les deux espèces. Ce flux se serait étendu au fil des années aux populations modernes.

“Des analyses ont révélé que les lynx modernes partagent plus de matériel génétique avec leur espèce sœur, le lynx eurasien, que les lynx plus âgés. Cela suggère que “Il y aurait eu un échange génétique entre les deux espèces au cours des deux derniers millénaires.”résume la chercheuse Mara Lucena, première auteure de l’étude publiée dans la revue Écologie et évolution de la nature, qui a développé ce travail lors de sa thèse de doctorat à Doana.

L’analyse est basée sur séquençage des génomes de trois anciens lynx ibériques à partir d’échantillons d’os fossiles (datés d’il y a environ 2 000 à 4 000 ans) : un d’Andjar d’il y a environ 4 300 ans, un autre d’Alcanar à Tarragone d’il y a 2 500 ans et un autre de l’Algarve au Portugal, daté d’il y a environ 2 100 ans. Après, Ils ont comparé ces génomes avec les données disponibles sur 30 spécimens actuelsavec un lynx boréal qui vivait il y a environ 2 500 ans, originaire du nord de la péninsule, et avec 12 lynx boréals modernes provenant de six populations différentes.

“Les échantillons ont été fournis par des paléontologues qui travaillent dans chacun de ces sites”, explique José Antonio Godoy, chercheur à la Station biologique de Doana. “Ils font partie d’un ensemble de 58 échantillons déjà analysés dans un travail précédent, dans lequel les données ont été obtenues à partir de centaines d’échantillons historiques et de dix échantillons anciens, mais uniquement du génome mitochondrial, qui est plus abondant et relativement plus facile à obtenir. ce nouveau travail, nous avons réessayé avec 20 des échantillons disponibles les plus prometteurs et avons réussi à récupérer les données du génome nucléaire de trois. Ils ne sont pas nombreux, mais ils fournissent le premier et très précieux aperçu de la variation génétique nucléaire chez le lynx ibérique dans une région éloignée. passé, il y a environ 2 000 à 4 000 ans.

Les « goulots d’étranglement » démographiques

Le lynx ibérique s’est séparé de son proche parent, le lynx boréal, il y a environ un million d’années., bien que leurs génomes révèlent un transfert ultérieur d’ADN entre les deux espèces. Depuis qu’elle s’est séparée de la lignée, l’espèce a traversé quatre « goulets d’étranglement » de population qui ont laissé son nombre à une centaine de spécimens répartis en deux noyaux au début de ce siècle. Le premier est venu avec son isolement sur la Péninsule et avec des causes liées aux variations climatiques ; la seconde, il y a 300 ans, lorsque leur nombre a chuté jusqu’à ne plus rester qu’environ 1 5000 individus ; la dernière déjà au XXe siècle en raison d’épidémies de lapins, de chasse et de destruction de leur habitat naturel.

Malgré les succès de son rétablissement au cours des dernières décennies, le lynx ibérique n’a pas encore atteint une population garantissant sa viabilité génétique pour l’avenir. Les experts estiment que il faut au moins 1 100 femelles reproductrices, alors que 326 ont été dénombrées lors du recensement de 2022. C’est pourquoi il reste essentiel d’augmenter le nombre de sous-populations et de favoriser la connectivité entre elles pour les échanges génétiques. Objectif poursuivi par le projet LIFE-Lynxconnect, financé par la Commission européenne.

Dans ce contexte, Les conclusions du document pourraient avoir des implications pour les futures stratégies de conservation. Notamment l’hypothèse d’un croisement génétique avec une population différente, stratégie visant à restaurer la diversité génétique et à réduire la consanguinité. Dans des conditions normales, cela n’est pas recommandé, car la progéniture aurait une probabilité plus faible de survie et de reproduction et donc la viabilité de la population diminuerait. Cependant, les auteurs estiment que dans le cas du lynx, cela pourrait être applicable en cas de crise démographique.

“La possibilité d’une gestion génétique basée sur l’hybridation avec une espèce étroitement apparentée pourrait être considérée comme une option de dernier recours. restaurer la diversité perdue, surtout dans un cas comme celui du lynx où l’on sait que l’hybridation s’est déjà produite dans le passé et qu’elle se produira peut-être dans le futur si les répartitions se chevauchent à nouveau”, explique José Antonio Godoy. “Il s’agit de ce n’est pas quelque chose que nous proposons et qui doit être fait maintenant. Heureusement, l’espèce se rétablit de façon spectaculaire et l’objectif est d’avoir des populations suffisamment grandes pour assurer sa viabilité génétique et démographique à long terme. »