Le rôle possible du microbiome intestinal dans le développement des lésions colorectales et du cancer

Copenhague – Les personnes ayant des lésions coliques précancéreuses présentent des différences significatives dans leur microbiome intestinal par rapport à la population générale jusqu’à 5 ans avant le développement des lésions, selon une vaste analyse effectuée sur 22 ans de l’étude de cohorte Dutch Microbiome Project. Ces résultats suggèrent un rôle possible du microbiote intestinal dans le développement des lésions colorectales et du cancer, a déclaré le responsable de l’étude, le Pr Ranko Gasesadu département de gastroentérologie de l’université de Groningue, aux Pays-Bas, qui a présenté les résultats lors de la Semaine européenne unie de gastroentérologie (UEG) 2023. « Cela [suggère également] que les bactéries intestinales pourraient améliorer les tests immunologiques fécaux non invasifs actuellement utilisés pour la détection des polypes colorectaux, et même que les thérapies de modulation du microbiome pourraient jouer un rôle dans la prévention du cancer colorectal », a déclaré le Pr Gacesa, qui a remporté le prix du meilleur résumé lors de la session. On sait que le microbiote intestinal est lié au cancer colorectal (CCR) ; en particulier les bactéries Bacteroides fragilis et Alistipes finegoldi qui se sont révélées être à l’origine du CCR dans des modèles de souris, a expliqué le Pr Gacesa. En termes de mécanisme, Bacteroides fragilis, par exemple, est connue pour produire une toxine qui peut entraîner une inflammation chronique de faible intensité dans l’intestin. Or, « l’inflammation prolongée est considérée comme potentiellement génotoxique et cancérigène, ce qui signifie qu’elle peut causer des dommages génétiques et favoriser le cancer », a précisé le Pr Gacesa. Analyse longitudinale à l’aide de grandes bases de données néerlandaises Pour déterminer le sens de la relation entre le CCR et le microbiome intestinal, les chercheurs néerlandais ont mené une analyse longitudinale de 2000 à 2022, en cherchant à savoir si le CCR modifie le microbiome intestinal et si les changements dans le microbiome contribuent au développement de lésions précancéreuses et du CCR. Ils se sont appuyés sur les données du programme néerlandais de dépistage du cancer colorectal, comprenant les résultats du test FIT chez les personnes âgées de 55 ans et plus, et la coloscopie en cas d’orientation. Ils ont enregistré les cas de biopsies coliques dans la vaste base de données nationale néerlandaise sur les biopsies médicales (PALGA). Ces données ont ensuite été mises en relation avec les données du projet néerlandais sur le microbiome provenant d’échantillons fécaux de 8208 personnes prélevés entre 2012 et 2015. « Cela nous a permis d’associer les compositions et les fonctions du microbiome intestinal à des informations histologiques détaillées sur les lésions précancéreuses et le cancer colorectal, y compris le moment où les lésions ont été détectées par rapport à l’échantillonnage fécal [et à la lecture du microbiome intestinal] », a expliqué Ranko Gacesa. L’analyse a déterminé la composition, la fonction et les profils génomiques du microbiote intestinal chez les participants qui ont développé des lésions colorectales précancéreuses avant le prélèvement de selles entre 2000 et 2015, et chez les participants qui ont développé des lésions après le prélèvement de selles, entre 2015 et 2022. Les phénotypes cliniques, comprenant le type et la taille des lésions, ont été notés. Le groupe de contrôle comprenait 2123 personnes de la population générale dont les résultats de la coloscopie étaient normaux. Diversité du microbiome réduite en cas de lésions précancéreuses Avant le prélèvement de selles, 219 participants présentaient des lésions coliques, notamment des dysplasies de bas grade, des dysplasies de haut grade et des polypes dentelés, ainsi que 26 cas de CCR. Au total, 315 participants ont développé des lésions coliques diverses après le prélèvement de selles, avec un total de 29 cas de CCR. Lorsque les chercheurs ont examiné la diversité du microbiome chez les personnes ayant présenté des lésions précancéreuses du côlon 1 à 5 ans avant le prélèvement de selles, ils ont constaté que la diversité était plus faible que chez les témoins. La diversité du microbiome était également réduite chez les participants ayant développé des lésions coliques après le prélèvement. La composition et la fonction du microbiome étaient différentes entre les patients présentant des lésions préexistantes et futurs, et variaient en fonction des types de lésions. « Nous avons constaté une baisse de certaines bactéries commensales, notamment Faecalibacterium, tant chez les patients présentant des pathologies récentes que chez ceux qui en développeront à l’avenir. Nous avons également observé un pic massif d’Alistipes finegoldi chez les personnes atteintes de CCR, ce qui suggère fortement que cette bactérie est étroitement liée au CCR chez l’homme », a déclaré le Pr Gacesa. Parmi les espèces bactériennes liées au développement futur de lésions précancéreuses, on été observées celles de la famille des Lachnospiraceae, ainsi que les genres Roseburie et Eubactérie. La composition du microbiome avait un pouvoir prédictif modéré pour les lésions futures et le cancer du col de l’utérus. « Les lésions précancéreuses sont liées au microbiome intestinal », a déclaré le Pr Gacesa. « Les adénomes, qu’ils soient préexistants (avant l’échantillonnage des selles) ou apparus après l’échantillonnage des selles, sont significativement liés à la composition du microbiome ». Combiner l’analyse du microbiome au test immunologique ? Dans l’étude actuelle, le Pr Gacesa et ses collègues ont examiné le potentiel du microbiome intestinal humain à jouer un rôle dans la détection des lésions précancéreuses du côlon. Le test immunochimique fécal (TIF) non invasif, plébiscité par les patients, produit un nombre élevé de résultats faussement positifs, ce qui entraîne de nombreuses coloscopies inutiles. « Il a été calculé que l’utilisation d’une analyse du microbiote fécal combinée au test immunochimique fécal dans la prédiction des stades précoces du cancer colorectal pourrait aboutir à un taux élevé de vrais positifs et à un faible taux de faux positifs », a indiqué le Pr Gacesa. « De cette manière, nous pourrions réduire le taux de faux positifs d’environ 50 % ». “Idéalement, nous ne voulons pas détecter le cancer lorsqu’il est déjà là et difficile à traiter. Nous voulons le détecter le plus tôt possible dans son développement”, a-t-il ajouté. Plus de temps nécessaire Loris Lopetusomédecin gastro-entérologue à la Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli, Rome, Italie, qui a co-modéré la session, a fait remarquer que les données étaient intrigantes et importantes. « Nous devons vraiment trouver de nouveaux marqueurs prédictifs de la tumorigenèse », a-t-il déclaré. « Nous disposons déjà de quelques-uns, principalement la FIT, mais ils ne sont pas suffisants. Ces microbiotes intestinaux semblent prometteurs ». Il a ajouté que l’étude de l’équipe du Pr Gacesa était l’une des plus vastes qu’il ait vues. « Mais je voudrais souligner que, d’un point de vue méthodologique, il ne faut pas oublier que le délai entre un échantillon de selles et le développement de polypes peut être très long », a souligné le Pr Lopetuso. « Cette étude n’a porté que sur une période d’environ 5 ans. De plus, le microbiote peut changer d’un jour à l’autre en réponse au stress, à l’alimentation et à bien d’autres facteurs ». Toutefois, « il pourrait s’agir du début d’une étude longitudinale entre les cas et les témoins, car de nombreuses années sont nécessaires », a-t-il ajouté. Le Pr Gacesa a reçu un financement de Janssen Pharmaceuticals pour un projet de recherche non lié. Il est consultant rémunéré en R&D pour Esox Biologics Ltd sur des sujets sans rapport avec ce projet. Le Pr Lopetuso ne fait état d’aucune relation financière pertinente.
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2023-12-07 11:17:41