Le taux de mortalité dû à l’infection au COVID-19 dans différentes variantes du SRAS-CoV-2 était lié aux polymorphismes du gène de la protéine C-réactive

Les résultats de cette étude approfondie démontrent de manière considérable qu’il existe des associations entre deux polymorphismes du CRP gène (rs1205 et rs1800947) avec mortalité due au COVID-19.

Les niveaux de CRP étaient statistiquement significativement plus élevés chez les patients décédés que chez les patients guéris, comme le montre cette étude. Plusieurs études ont montré que la CRP peut être utilisée comme biomarqueur de la gravité et de la mortalité de l’infection au COVID-19.^8,19. L’enzyme de conversion de l’angiotensine II (ACE2) peut produire de la CRP lorsqu’elle interagit avec le SRAS-CoV-2²⁰. La production de CRP par les hépatocytes est stimulée par des cytokines comme l’interleukine-6 ​​(IL-6) et le facteur de nécrose tumorale α (TNF-α) pendant le développement du COVID-19²¹. Dans un sens, la CRP est responsable de l’activation du système du complément, qui contribue à l’inflammation. En revanche, les patients atteints d’une forme grave du COVID-19 endommageront considérablement leurs barrières épithéliales et endothéliales alvéolaires. Les macrophages alvéolaires et les cellules épithéliales sont capables de produire diverses cytokines et chimiokines lors d’une infection par le SRAS-CoV-2. Dans cette phase, l’immunité adaptative est mise à l’épreuve par la diminution significative du nombre de lymphocytes et par l’immunosuppression médiée par les lymphocytes T. Par conséquent, dans le contexte de la COVID-19, une infection incontrôlée par le SRAS-CoV-2 pourrait entraîner une infiltration considérable de macrophages, exacerbant les lésions pulmonaires aiguës.^22,23.

Un certain nombre de SNP sont associés aux taux plasmatiques de CRP sur le CRP gène. En plus de rs1205 et rs1800947 dans les régions flanquantes 3′ et 5′, rs1417938 est présent dans l’intron et rs1800947 apparaît dans l’exon 2.^24,25.

Il s’agit actuellement de la première étude évaluant la relation entre CRP rs1205 et rs1800947 et mortalité due au COVID-19. Les taux de mortalité dus au COVID-19 étaient significativement plus élevés chez les patients porteurs de l’allèle CRP rs1205 T. Chez tous les patients, le MAF (allèle T) était de 0,42, ce qui était plus faible chez les patients guéris (0,30) que chez les patients décédés (0,55). Dans d’autres régions, l’allèle T a été trouvé chez 0,597 Asiatiques, 0,609 Asiatiques de l’Est, 0,342 Asiatiques du Sud, 0,545 autres Asiatiques, 0,332 Européens, 0,333 Latino-Américains et 0,201 Africains, comme indiqué dans la base de données NCBI dbSNP (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs1205).

Plusieurs études ont démontré que les niveaux de CRP sont fonctionnellement influencés par le SNP rs1205. La CRP est un composant majeur du système immunitaire inné, ce SNP pourrait donc avoir un impact sur la pathogenèse du SRAS-Co-2. Une méta-analyse d’association à l’échelle du génome a révélé qu’une variante d’intron (rs67579710) était associée aux hospitalisations liées au COVID-19 dans 24 741 cas et 2 835 201 témoins. En raison de sa localisation dans le gène de la thrombospondine-3, cette variante pourrait affecter la thrombose liée au COVID-19 plutôt que les voies inflammatoires.^26,27.

Selon l’étude actuelle, les trois variantes de CRP L’allèle rs1205 T était corrélé à la mortalité due au COVID-19. Plusieurs études ont montré que CRP Le rs1205 affecte à la fois les résultats cliniques et les résultats de la vaccination. Il a été suggéré que la fréquence de l’allèle T rs1205 était significativement plus élevée chez les patients atteints de pneumonie communautaire que chez les témoins sains, et que l’allèle T était associé à un risque accru d’infection. De plus, les génotypes rs1205 CT et TT étaient nettement plus fréquents chez les patients atteints de pneumonie communautaire sévère que chez ceux atteints de pneumonie communautaire non sévère.¹⁸.

Comme le montre notre étude, de nombreuses études portant sur différentes maladies ont montré que l’allèle rs1205 T est associé à des taux sériques plus faibles de CRP.^{18, Polymorphisme T (rs1205) chez des patients atteints du syndrome coronarien aigu de l’ouest du Mexique. Genet. Test. Mol. Biomarque. 21, 334-340 (2017).” href=” id=”ref-link-section-d248908930e3559″>28}. Étant donné que le génotype rs1205 TT entraîne des taux sériques de CRP plus faibles et est associé à des métastases ganglionnaires dans cette forme de cancer, le rs1205 peut être associé au cancer épidermoïde de l’œsophage thoracique, à l’infarctus du myocarde, au lupus érythémateux disséminé et à la néphrite lupique.^29,30. Dans les études avec des taux de CRP de base plus élevés, le risque de pré-éclampsie est positivement corrélé à CRP génotypes. En revanche, comme dans la présente étude, les génotypes de CRP (y compris l’allèle rs1205 T) sont associés à des taux de CRP plus faibles et ont été corrélés à une charge infectieuse plus élevée. Il peut y avoir eu une sélection équilibrée sur les polymorphismes de la CRP au cours de l’évolution en raison de ces effets disparates^18,31,32.

Dans cette étude, les patients porteurs de l’allèle CRP rs1800947 G présentaient un taux de mortalité significativement plus élevé dû au COVID-19. Chez tous les patients, le MAF (allèle G) était de 0,47, les patients en convalescence ayant une valeur inférieure (0,40) que les patients mourants ayant une valeur plus élevée (0,54). Une étude menée en Iran a révélé que la fréquence de l’allèle G était de 0,45, ce qui est similaire à ce que nous avons trouvé dans notre étude. ^{C) avec diabète sucré de type 2 dans la population du nord-ouest de l’Iran. L’Iran. Croissant Rouge Med. J. 20 (2018).” href=” id=”ref-link-section-d248908930e3586″>33}. Selon la base de données NCBI dbSNP (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs1800947), les Asiatiques et les Asiatiques de l’Est étaient les plus susceptibles d’avoir l’allèle G 0,036, les Asiatiques du Sud 0,000, les autres Asiatiques 0,040, les Européens 0,056, les Latino-Américains 0,024 et les Africains 0,010, respectivement.

Selon nos résultats, le taux de mortalité du COVID-19 était corrélé à CRP génotype rs1800947 GG dans les trois variantes, ainsi qu’avec le génotype CRP rs1800947 CG dans les variantes Alpha et Delta du gène.

Il existe une forte association entre le CRP rs1800947 et CRP expression et il a été démontré qu’il est associé aux maladies cardiaques, au diabète et au cancer ^{C) avec diabète sucré de type 2 dans la population du nord-ouest de l’Iran. L’Iran. Croissant Rouge Med. J. 20 (2018).” href=”#ref-CR33″ id=”ref-link-section-d248908930e3612″>33,34,35}. Contrairement aux résultats de cette étude, des rapports antérieurs ont démontré que les porteurs de l’allèle C avaient des taux plasmatiques de CRP inférieurs à ceux du génotype GG. Le diagnostic clinique et l’évaluation de la gravité de la pneumonie communautaire et du COVID-19 sont basés sur les taux sériques de CRP.^19,36,37. Le taux de mortalité élevé chez les personnes décédées infectées par le COVID-19 de génotype GG pourrait être dû à leurs taux sériques de CRP plus élevés.

Il n’existe aucune corrélation entre la majorité des SNP et des maladies ou problèmes fonctionnels. En revanche, si les SNP sont situés sur des gènes ou des régions régulatrices telles que des promoteurs ou des activateurs, ils peuvent influencer la fonction de gènes impliqués dans les mécanismes de la maladie.³⁶. CRP rs1800947 peut avoir des effets différents. Puisque le SNP rs1800947 est silencieux, le mécanisme sous-jacent exprimé CRP Ces niveaux pourraient être un déséquilibre de liaison entre le polymorphisme rs1800947 et d’autres SNP fonctionnels à l’intérieur et à l’extérieur du gène CRP. Il est également possible que ce polymorphisme modifie la cinétique de traduction de la CRP, provoquant des niveaux variables de CRP dans tout le corps.³⁸.

Dans cette étude, plusieurs limites ont été observées et devraient être prises en compte dans les études futures. Puisqu’il n’y avait aucun contrôle sain dans cette étude, les résultats n’ont pas été comparés à des contrôles sains. Cette étude devrait être confirmée par des recherches plus approfondies sur d’autres groupes ethniques en Iran, car ce pays compte une variété d’ethnies.

En conclusion, cette étude a montré que le taux de mortalité du COVID-19 était corrélé aux génotypes CRP rs1205 TT et CRP Génotypes rs1800947 GG dans les trois variantes. De plus, des taux de CRP plus élevés ont été observés chez les individus présentant le CRP génotype rs1205 CC et le CRP Génotype rs1800947 GG. Pour vérifier ces résultats, des recherches supplémentaires devraient être menées dans d’autres régions.