Les approches génomiques avancées sont prometteuses pour la conservation marine

Les approches génomiques avancées sont prometteuses pour la conservation marine

Caricature illustrant les actions et interventions de conservation abordées dans cet essai et montrant les principales infrastructures requises pour chacune. Les chiffres se rapportent aux actions/interventions suivantes : 1. Sauvetage génétique (translocation) ; 2. Conception et aménagement du territoire des aires marines protégées ; 3. Identification et délimitation des espèces ; 4. Flux génétique assisté (translocation) et restauration (provenance); 5. Biobanques ; 6. Évolution assistée (via l’élevage géré ; 7. Surveillance de la biodiversité ; 8. Biomarqueurs d’alerte précoce des espèces envahissantes et des ravageurs ; 9. Lutte contre la pêche illégale et l’étiquetage erroné ; 10. Gestion de la pêche ; 11. Manipulation du microbiome ; 12. Bioremédiation microbienne ; 13. Atténuation facteurs de stress marins ex situ ; 14. Fourniture de services de vie marine ex situ ; 15. Sauvetage évolutif via l’édition du génome ; 16. Lutte antiparasitaire ; 17. Désextinction ; 18. Analyses de vulnérabilité génomique. Crédit : van Oppen MJH et Coleman MA, 2022 , Biologie PLOS, CC-BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

Les technologies génétiques et génomiques ont un énorme potentiel pour protéger la vie marine, mais sont actuellement sous-utilisées, affirment Madeleine van Oppen de l’Institut australien des sciences marines et de l’Université de Melbourne et Melinda Coleman du Département des industries primaires de la Nouvelle-Galles du Sud, en Australie, dans un essai publié le 17 octobre dans la revue en libre accès PLOS Biologie.

Aucune partie de nos océans n’est épargnée par l’homme, avec des écosystèmes vitaux tels que les récifs coralliens, herbiers marins et les forêts de varech sont toutes en déclin en raison du changement climatique et d’autres perturbations humaines. Dans leur essai, van Oppen et Coleman proposent que l’utilisation d’approches génétiques et génomiques est très prometteuse pour faire progresser conservation marine et la restauration, par le biais de stratégies traditionnelles et de développements plus récents, tels que l’évolution assistée.

Par exemple, le séquençage de l’ADN peut désormais identifier les produits de la mer récoltés illégalement afin de protéger les espèces menacées. ADN dans échantillons d’eau de mer, appelé ADN environnemental, est en train de devenir une alternative ou un complément plus réalisable aux enquêtes traditionnelles de biodiversité marine basées sur la plongée sous-marine, et peut également être utilisé pour surveiller les épidémies et la propagation des espèces envahissantes. De plus, il existe des techniques génomiques qui pourraient aider les pêcheries à garder un œil sur les stocks de poissons et à surveiller la façon dont les poissons s’adaptent aux facteurs de stress dans leur environnement.

En regardant vers l’avenir, van Oppen et Coleman pointent vers de multiples technologies en développement qui pourraient profiter à la vie océanique. Tout comme les humains prennent des probiotiques pour la santé intestinale, des espèces bactériennes et fongiques spécifiques pourraient être identifiées ou modifiées pour bénéficier à la santé de la faune, comme les coraux. La biologie synthétique pourrait permettre la fabrication de produits en laboratoire qui étaient auparavant récoltés dans les écosystèmes marins, comme le sang de crabe en fer à cheval, et l’édition du génome pourrait être utilisée pour aider les organismes à s’adapter plus rapidement à leur environnement changeant. Bien que toujours controversée, il existe également la possibilité d’utiliser des forçages génétiques, qui provoquent la propagation de gènes nuisibles dans une population, pour éradiquer les espèces envahissantes.

L’utilisation efficace de ces approches nécessitera le développement de plateformes en ligne adaptées et une collaboration renforcée entre les différents acteurs de écosystèmes marins, et les auteurs appellent les agences de financement à soutenir ces efforts. Ils concluent que les technologies génomiques pourraient considérablement améliorer les efforts de conservation et de restauration, mais seulement si le fossé peut être comblé entre les experts en génomique et les gestionnaires de la biodiversité marine.

van Oppen déclare : « Les approches génétiques/génomiques peuvent transformer la manière dont nous protégeons, gérons et conservons La vie marine et peut aider à renforcer la résilience des espèces marines face au changement climatique.”


Les changements dans les écosystèmes marins ne sont pas détectés


Plus d’information:
Faire progresser la protection de la vie marine grâce à la génomique, PLoS Biologie (2022). DOI : 10.1371/journal.pbio.3001801

Citation: Les approches génomiques avancées sont prometteuses pour la conservation marine (17 octobre 2022) récupéré le 17 octobre 2022 sur https://phys.org/news/2022-10-advanced-genomic-approaches-marine.html

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