Caractéristiques démographiques de l’étude
Pour étudier l’association entre le ReDoV et les maladies virales associées à l’homme, la prévalence du ReDoV parmi les personnes soumises à un test de diagnostic du SRAS-CoV-2 a été analysée. Les sujets étaient constitués de 486 (66,48 %) femmes (âge minimum de 4 ans et âge maximum de 83 ans) et de 245 (33,52 %) hommes (de 9 à 99 ans) avec un âge moyen de 37,97 ± 13,36 et 44,94 ± 17,06, respectivement. Pour identifier les schémas spécifiques à l’âge, les différences de sensibilité ou les tendances qui pourraient être présentes dans différents groupes d’âge et la facilité d’interprétation des résultats et de compréhension de la prévalence des ReDoV dans différents groupes d’âge, les sujets ont été divisés en sept catégories d’âge différentes. Selon les documents enregistrés des sujets, la répartition par âge de cette étude a illustré une représentation prédominante dans la tranche d’âge 30-39 ans (29,82 %), suivie des individus âgés de 40 à 49 ans (23,39 %) et de 20 à 29 ans (19,97 %) (voir tableau 1).
Tableau 1 Caractéristiques démographiques et cliniques. Les données ont été obtenues soit à partir des dossiers médicaux du centre, soit par des entretiens avec les personnes participantes
Prévalence du SRAS-CoV-2 parmi les participants
Les résultats de la RT-PCR du SARS-CoV-2 ont été obtenus à partir des dossiers des patients. Comme le montrent les tableaux 1 et 131/731 (17,92 %) étaient positifs pour le SARS-CoV-2. En ce qui concerne le statut vaccinal, une grande majorité (97,13 %) avait reçu le vaccin contre la COVID-19, la fréquence la plus courante étant de trois fois (45,69 %). Sinopharm était le type de vaccin le plus répandu (19,84 %) parmi les personnes interrogées. Français D’autres informations obtenues en interrogeant les participants comprenaient des problèmes de gencives ou dentaires lors de leur orientation vers les centres médicaux, des symptômes cliniques associés à la maladie COVID-19 (odorat ou sens du test, fièvre, maux de tête, douleurs osseuses, toux, douleurs thoraciques, essoufflement et autres symptômes pseudo-grippaux), ainsi que les maladies sous-jacentes et le type de médicament (les données ne sont pas présentées), et les données de vaccination contre la grippe/COVID-19. La présence de maladies sous-jacentes a été notée chez 14,77 % de la population, tandis que 14,23 % ont déclaré prendre des médicaments. Les maladies sous-jacentes comprenaient l’hypertension, le diabète, le syndrome néphrotique, l’anémie, les problèmes cardiaques, la polyarthrite rhumatoïde (AR), l’asthme, le réflexe gastrique, l’autisme, la graisse sanguine, la migraine, la bronchite, le cancer, le vétéran chimique, l’endocardite, la stéatose hépatique, les calculs biliaires, le VIH, les maladies auto-immunes, les maladies pulmonaires, les allergie, l’hyperlipidémie, l’hyperprolactinémie, le lupus, les convulsions, l’hyperthyroïdie, l’hypothyroïdie, les saignements intestinaux, l’ulcère intestinal, la maladie de Behçet Maladie virale, lymphome, sclérose en plaques (SEP), troubles nerveux et mentaux, ostéoporose, rhumatismes, cancer de la prostate, myopathie et psoriasis. Pour étudier plus en détail le génome de ReDoV, les échantillons nasopharyngés des sujets consentants ont été récupérés dans les réfrigérateurs à − 80 °C et une extraction du génome viral a été réalisée, comme décrit dans la section sur les matériaux et méthodes.
Les séquences ReDoV obtenues à partir des échantillons amplifiés ont été soumises à GenBank et seront disponibles sous les numéros d’accès PP319424 à PP319438. Une analyse phylogénétique a été réalisée pour mesurer davantage la distance génétique des données séquencées avec les ReDoV déjà connus, et les données sont présentées dans la Fig. 1.
Fig. 1
Phyllogramme radial réenraciné avec le virus SDBVL A du moustique VEM (NC_076121.1). Les données séquencées des ReDoV de la présente étude sont colorées. PP319426 et PP319425 sont phylogénétiquement apparentés aux Brisavirus associés aux voies respiratoires humaines. PP319427 et PP319428 sont génétiquement proches des Vientovirus associés à la voie orale, et PP319424 est apparenté aux Vientovirus associés aux poumons. Les cercles bleus représentent les bootstraps allant de 4 (le plus petit) à 100 (le plus grand)
Prévalence des ReDoV dans les échantillons nasopharyngés
Un ensemble d’amorces a été conçu pour englober une région conservée des nucléotides 1709 à 1895 (taille d’amplicon de 187nt), couvrant l’extrémité 54 nt de la région C-terminale de la région codante de la capside et l’espace avant le début de la séquence codante Rep. La figure 2 présente les résultats de l’amplification PCR et de l’électrophorèse sur gel, montrant des bandes spécifiques correspondant à l’ADN ReDoV amplifié. De plus, l’efficacité de la PCR était de 99,3 % (Fig. 3).
Fig. 2
Amplification par PCR et électrophorèse sur gel du génome de ReDoV. L’électrophorèse sur gel démontre la présence d’ADN de ReDoV dans les échantillons positifs (flèches noires) avec une taille de 187 nt de long. L100 représente le marqueur ADN (échelle) pour la référence de taille, tandis que les numéros de voie indiquent les produits PCR des échantillons individuels
Fig. 3
Efficacité PCR calculée avec une pente arrondie de 3,34. 350 ng d’ADN viral ont également été détectés par cette méthode PCR
La positivité du ReDoV a été détectée dans 190/731 (25,99 %) cas, dont 29/190 (15,26 %) présentaient une co-infection avec le SARS-CoV-2. L’analyse du tableau de contingence a été utilisée pour examiner la relation entre la présence de ReDoV et l’infection par le SARS-CoV-2. Le test du chi carré d’indépendance n’a révélé aucune association entre les ReDoV et les infections par le SARS-CoV-2 (p > 0,05). De même, le test exact de Fisher n’a montré aucune association significative entre les ReDoV et le SARS-CoV-2 (p > 0,05). Ces résultats n’indiquent aucun lien statistique entre les ReDoV et l’infection par le SARS-CoV-2 parmi les individus étudiés.
De plus, la relation entre l’infection par le ReDoV et le sexe des individus a été étudiée (Fig. 4). Les résultats positifs pour le ReDoV chez les femmes et les hommes étaient respectivement de 135/731 (18,47 %) et 55/731 (7,52 %). Aucune association significative n’a été observée (p = 0,12), ce qui suggère l’indépendance des variables. De plus, le test exact de Fisher pour la signification par cellule n’a également montré aucune association significative entre les résultats du ReDoV et le sexe (p > 0,05).
Fig. 4
Association de la prévalence du génome de ReDoV dans différentes catégories d’âge, sexe, résultats du SARS-CoV-2 et résultats des complications gingivales ou dentaires. Les flèches rouges mettent en évidence les groupes dans lesquels les résultats négatifs ou positifs de ReDoV sont significatifs selon le test exact de Fisher
Français De plus, la relation entre les ReDoV et les catégories d’âge a été évaluée. En conséquence, les résultats ont montré que parmi les personnes âgées de 1 à 9 ans, de 10 à 19 ans, de 20 à 29 ans, de 30 à 39 ans, de 40 à 49 ans, de 50 à 65 ans et de plus de 65 ans, il y avait 0, 6, 40, 59, 42, 26 et 17 individus positifs pour les ReDoV dans les catégories d’âge correspondantes. Le test du chi carré d’indépendance (p > 0,05) a indiqué que l’infection et les catégories d’âge aux ReDoV sont indépendantes. Une analyse plus approfondie utilisant le test exact de Fisher pour la signification par cellule n’a révélé aucune association significative entre la présence du génome des ReDoV et les catégories d’âge. Cependant, le test exact de Fisher a montré une association non aléatoire en l’absence du génome des ReDoV chez les enfants âgés de 1 à 9 ans. Néanmoins, en raison du nombre limité de patients dans cette catégorie, la prévalence du virus dans ce groupe d’âge doit être étudiée plus en détail. Aucune association significative n’a également été trouvée entre d’autres variables cliniques.
L’association des ReDoV avec les problèmes de gencives
Les participants ont été interrogés sur les inflammations ou problèmes dentaires ou gingivaux qu’ils avaient rencontrés lors de leur orientation vers le centre médical. Étonnamment, les résultats ont révélé une relation très significative entre l’infection par les ReDoV et les complications dentaires/gingivales. Les fréquences de ReDoV négatifs et positifs en l’absence ou en présence de problèmes de gencives ont montré que 126 personnes souffrant de problèmes de gencives ont été testées positives pour les ReDoV (p p 2.
Tableau 2 Coefficients d’association des ReDoV et des problèmes de gencives/dentaires
2024-07-05 12:38:38
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