2024-03-23 02:01:06
Quel rapport le microbiote a-t-il avec les hospitalisations ? Cela a certainement quelque chose à voir avec cela, et cela a été démontré par une étude néerlandaise qui a étudié deux grands groupes de patients en Europe, révélant que pour chaque augmentation de 10 % des bactéries qui produisent du buttyrate, le risque d’hospitalisation pour infections diminue de 14 et 25 pour cent. L’étude, qui sera présentée au congrès d’avril de l’Eccmid (Congrès européen de microbiologie clinique et de maladies infectieuses) à Barcelone, a été menée par Robert Kullberg et collègues du centre médical de l’université d’Amsterdam.
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Mais prenons du recul : les altérations du microbiote sont fréquentes chez les patients hospitalisés pour des infections graves et des modèles précliniques ont montré que les bactéries anaérobies productrices de butyrate protègent contre les infections systémiques. Ces bactéries ont été étudiées parce qu’elles sont pratiquement nulles chez les patients hospitalisés pour des infections graves et parce que le butyrate peut avoir des effets protecteurs dans d’autres maladies intestinales graves non infectieuses.
Deux belles études
Bien que la relation entre le déséquilibre du microbiote et l’augmentation des infections graves ne soit pas claire, dans cette étude, les auteurs ont plutôt étudié la relation entre le microbiote basal et le risque d’hospitalisations futures pour infections dans deux études à grande échelle, la danoise Helius et la finlandaise Finrisk 2002.
Le microbiote intestinal a été caractérisé par séquençage de l’ADN des bactéries afin d’identifier les différents types de bactéries présentes dans les selles des participants. Les auteurs ont ensuite mesuré la composition du microbiote, la diversité et la quantité de bactéries productrices de butyrate et ont utilisé des modèles statistiques pour prendre en compte d’autres variables comme le mode de vie, l’exposition aux antibiotiques et d’autres maladies.
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Les chercheurs ont dressé le profil du microbiote de 10 699 participants. Au total, 602 personnes ont été hospitalisées ou sont décédées des suites d’infections, principalement d’une pneumonie, au cours du suivi. Le microbiote intestinal des patients hospitalisés et décédés différait de tous les autres. Et en effet, chaque pourcentage supérieur de 10 % de bactéries produisant du butyrate était associé à un risque d’hospitalisation pour infections de tous types inférieur de 25 % dans le groupe danois et de 14 % dans le groupe finlandais (et qui sait pourquoi…). Ces associations sont restées les mêmes, même après les ajustements attendus.
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« Une bonne composition du microbiote intestinal – expliquent les auteurs – en particulier une colonisation spécifique par des bactéries productrices de butyrate, est associée à une protection contre l’hospitalisation pour maladies infectieuses dans la population générale, selon deux cohortes européennes indépendantes. Et maintenant, d’autres études évalueront si la modulation du microbiome peut réduire le risque d’infections graves. » Des analyses complémentaires seront nécessaires avant de démarrer des études sur des patients. L’un des défis est que les bactéries qui produisent le butyrate sont anaérobies, ce qui signifie qu’elles n’utilisent pas l’oxygène pour vivre et ne le tolèrent pas. Ce qui rend très difficile le transport de bactéries viables dans l’intestin. De nombreux groupes de recherche s’efforcent de relever ces défis.
Recherche italienne
Et un, celui italien de Cattolica, publié il y a quelques années sur Annales de médecine interne une étude qui va dans le même sens que celle néerlandaise. « Il y a environ cinq ans, nous avons manifesté – dit-il Gianluca Ianiro, chercheur en maladies du système digestif à l’Université catholique de Rome – qu’une greffe fécale dans laquelle on met une flore saine avec de nombreuses bactéries qui produisent du butyrate réduit le risque de septicémie et de décès chez les patients atteints de Clostridium difficile. En effet, le butyrate est un acide gras à chaîne courte qui est utile à la réparation cellulaire et protège la barrière intestinale. »
Les bactéries productrices de butyrate sont stimulées par l’inuline. « Mais cela n’aurait aucun sens de penser à donner de l’inuline à tout le monde. Le microbiome doit avoir une diversité bactérienne adéquate, au sens de variété, et il doit y avoir un équilibre entre les espèces de groupes microbiens, avec une bonne présence de bactéries anti-inflammatoires et une faible présence de bactéries pro-inflammatoires.
L’alimentation comme modulateur du microbiome
L’alimentation est un excellent modulateur du microbiome sur le long terme, même si d’autres éléments, comme l’allaitement, les antibiothérapies, les interventions sur le côlon, ont un impact. « Une alimentation adéquate contribue à la santé du microbiote – conclut Ianiro – donc les fibres prébiotiques comme le kéfir ou le yaourt, les légumes, notamment les asperges et la chicorée, les légumes riches en inuline, et éviter certains régimes comme le no fodmap, indiqué pour certains pathologies intestinales, mais qui ont un taux de fibres trop faible.
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