Les personnes immunodéprimées abritent des variants de la COVID-19 résistants aux médicaments

2024-09-19 11:59:50

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Les personnes dont l’immunité est compromise et qui souffrent d’infections persistantes au COVID-19 peuvent être porteuses de variantes résistantes aux médicaments du virus SARS-CoV-2, qui ont le potentiel de se propager à la population générale, ont découvert des chercheurs de Weill Cornell Medicine, du College of Veterinary Medicine de l’Université Cornell et du National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) des National Institutes of Health (NIH).

Dans le étudepubliée le 18 septembre dans Nature Communications, les chercheurs ont isolé des souches résistantes aux médicaments du SRAS-CoV-2 chez des personnes qui n’avaient pas éliminé le virus après deux à trois mois d’infection et de traitements avec des médicaments antiviraux.

Une variante a montré une résistance aux antiviraux Paxlovid et remdesivir tandis qu’une autre souche présentait des mutations associées à une sensibilité réduite au remdesivir et à un troisième médicament antiviral, l’anticorps monoclonal sotrovimab.

« Le risque lié aux mutations émergentes est la possibilité de transmettre ces nouvelles variantes résistantes à la population générale avec moins d’options de traitement viables disponibles », a déclaré le co-auteur principal de l’étude, Dr Mirella Salvatoreprofesseur associé de médecine à Weill Cornell Medicine et médecin spécialiste des maladies infectieuses au NewYork-Presbyterian/Weill Cornell Medical Center. « Nous devons trouver de meilleurs traitements pour les patients immunodéprimés et envisager d’étudier des combinaisons de thérapies. »

Dr. Elodie Ghedinchercheur principal et chef de la section de génomique des systèmes au NIAID, est co-auteur principal. Dr Mohammed Nooruzzamanchercheur associé au Laboratoire de pièces au Collège de médecine vétérinaire de l’Université Cornell, et Katherine Johnson, bioanalyste principale contractante au NIAID, sont co-premiers auteurs.

Défis uniques dans le traitement des infections persistantes à la COVID

Alors que les personnes dont le système immunitaire fonctionne bien peuvent généralement éliminer le SARS-CoV-2 en quelques jours, celles qui sont immunodéprimées peuvent continuer à héberger et à excréter le virus plus longtemps, même sans symptômes. Elles reçoivent également souvent plusieurs traitements antiviraux au fil du temps, ce qui peut conduire à l’émergence de variants résistants aux médicaments.

Pour comprendre la montée de la résistance aux antiviraux, les chercheurs se sont concentrés sur 15 personnes au système immunitaire affaibli qui ont reçu du remdesivir et, dans certains cas, du nirmarelvir-ritonavir (Paxlovid). Ils ont découvert que neuf patients avaient développé des variants du virus avec des mutations de la protéine nsp12, cible du remdesivir, et quatre avaient des virus avec des mutations de la protéine nsp5, cible du Paxlovid. Ces mutations ont contribué à la persistance du virus malgré les traitements antiviraux courants.

Une personne avait un virus résistant aux deux médicaments. « Pour la première fois, nous avons isolé dans le nez d’un patient, 77 jours après le début de la maladie, un virus résistant au Paxlovid et également au remdesivir », a déclaré le Dr Salvatore. « Il est inquiétant que certains de ces patients puissent avoir un virus viable dans leurs sécrétions nasales à un stade aussi avancé de la maladie. »

Les thérapies combinées pourraient être la solution

Les chercheurs ont découvert que lorsqu’ils cultivaient le virus isolé dans des cultures cellulaires en laboratoire, deux médicaments étaient simultanément efficaces pour éliminer la souche résistante aux médicaments. « Ces résultats indiquent que la thérapie combinée pourrait être une meilleure option pour traiter la COVID-19 chez les patients immunodéprimés très vulnérables », a déclaré le co-auteur principal Dr. Diego Dielprofesseur agrégé de médecine de la population et de sciences diagnostiques à l’ Collège de médecine vétérinaire à l’Université Cornell.

Les chercheurs ont également constaté que la souche résistante se répliquait aussi bien que le virus SARS-CoV-2 original en culture cellulaire. Ensuite, à l’aide d’un modèle préclinique, ils ont testé si le virus pouvait se propager par contact. Ils ont découvert que cette variante était aussi transmissible que le virus de type sauvage sans les mutations.

On suppose généralement que lorsqu’un virus acquiert des mutations résistantes aux médicaments, il perd une partie de sa capacité à se répliquer ou à se transmettre d’une personne à une autre. Cette étude montre que ce n’est pas le cas. Les auteurs étudieront plus en détail l’impact des mutations associées aux thérapies sur la capacité du virus à se développer et à se propager.

Cette étude souligne l’importance d’inclure des cohortes de patients immunodéprimés atteints de la COVID-19 lors de l’évaluation de l’efficacité des antiviraux. « Lorsque le virus aura plus de temps pour évoluer chez un hôte qui n’élimine pas l’infection précocement, les stratégies thérapeutiques devront être réévaluées », ont déclaré les auteurs.

Référence: Nooruzzaman M, Johnson KEE, Rani R, et al. Émergence de variants transmissibles du SARS-CoV-2 avec une sensibilité diminuée aux antiviraux chez les patients immunodéprimés atteints d’infections persistantes. Nat Commun. 2024;15(1):7999. doi: 10.1038/s41467-024-51924-3



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