Lettre pour l’article Détection des gènes de résistance aux antibiotiques chez les Pse

Monsieur le rédacteur

Nous apprécions les auteurs qui ont rapporté leurs résultats de recherche dans « Détection des gènes de résistance aux antibiotiques dans Pseudomonas aeruginosa par séquençage du génome entier » publié dans Infection and Drug Resistance 2022:15 6703–6709. Il s’agit d’informations très importantes sur le séquençage du génome entier et les tests de sensibilité anti-agneau pour la résistance aux antibiotiques en utilisant des méthodes de PCR encore conventionnelles. Le but de cette étude elle-même était d’évaluer les gènes qui étaient résistants à Pseudomonas aeruginosa où les résultats des gènes de résistance étaient sul1, aac(3)-Ic, blaPAO, blaGES-1, blaGES-5 aph(3′)-XV, blaOXA-50, aacA4, catB7, aph (3′)-IIb, aadA6, fosA, tet(G), cmlA1, aac(6′)Ib-cr et rmtF.¹

Dans cette étude, il a également été rapporté que Pseudomonas aeruginosa est résistant à plusieurs antibiotiques et peut constituer une menace dans une société qui utilise les antibiotiques de manière irrationnelle. Cela est dû à l’acquisition d’enzymes dans Pseudomonas aeruginosa telles que les lactamases à spectre étendu, les carbapénèmases et les enzymes de conversion des aminoglycosides. Cette étude a également examiné la prévalence de l’ARG dans trois P. aeruginosa souches utilisant le séquençage du génome entier où la technique PCR utilisée a montré Pseudomonas aeruginosa résistance à différents antibiotiques, tels que la ceftazidime, la céfotaxime, la céfépime, la pipéracilline/tazobactam et l’imipénem.²

Malheureusement, cette étude n’a pas été en mesure de rapporter en détail les séquences du génome qui sont résistantes à Pseudomonas aeruginosa. Douze dilutions différentes de chaque antibiotique devaient être testées par la méthode de double dilution (les concentrations testées variaient de 1024 μg/mL à 0,5 μg/mL), par exemple l’un des antibiotiques quinolones représentant quatre générations de quinolones, testé, dont l’acide nalidixique ( NAL), qui représente la première génération ; la ciprofloxacine (CIP), la norfloxacine (NOR) et l’ofloxacine (OFL), représentant la deuxième génération ; la lévofloxacine (LEV), représentant la troisième génération, et la gémifloxacine (GEM) et la moxifloxacine (MOX), représentant la quatrième génération (toutes de Sigma-Aldrich, États-Unis) utilisant le code ATCC27853 pour P. aeruginosa pour tester leur qualité.³

En outre, il existe également une méthode qui peut être utilisée comme comparaison pour tester la sensibilité de Pseudomonas qui peut identifier jusqu’au niveau de l’espèce (ID) et tester la sensibilité aux antimicrobiens (AST), à l’aide du système automatisé Becton Dickinson (BD) Phoenix. Cette méthode analyse les isolats produits par les enzymes carbapénèmases à l’aide de la méthode modifiée d’inactivation des carbapénèmes (mCIM). Les résultats de cette étude ont rapporté que 110 personnes présumées Pseudomonas isolats de la biobanque ont été ré-analysés, dont 100 se sont avérés Pseudomonas et parmi eux P. aeruginosa avait un taux de résistance de 98% et P. putida de 2%. Le taux de résistance le plus élevé a été observé à la ceftazidime (35 %) et le taux de résistance le plus faible a été observé à l’amikacine (2 %). Vingt-sept isolats ont été identifiés comme candidats à l’essai pour la production d’enzymes carbapénémases, où seulement 3/27 (11 %) isolats ont été détectés comme producteurs d’enzymes carbapénémases.⁴

Divulgation

Les auteurs ne signalent aucun conflit d’intérêts dans cette communication.

Références

1. Ahmed OB. Détection des gènes de résistance aux antibiotiques chez Pseudomonas aeruginosa par séquençage du génome entier. Infecter la résistance aux médicaments. 2022;15:6703–6709. doi:10.2147/IDR.S389959

2. Qin J, Zou C, Tao J, et al. Infections à Pseudomonas aeruginosa résistantes aux carbapénèmes chez les patients âgés : profils de résistance aux antimicrobiens, facteurs de risque et impact sur les résultats cliniques. Infecter la résistance aux médicaments. 2022;15:2301–2314. doi:10.2147/IDR.S358778

3. Molinaro M, Morelli P, De Gregori M, et al. Efficacité du traitement à l’amikacine intraventriculaire dans la méningite post-chirurgicale à Pseudomonas aeruginosa pan-résistante. Infecter la résistance aux médicaments. 2018;11:1369–1372. doi:10.2147/IDR.S169271

4. Addis T, Araya S, Desta K. Présence de Pseudomonas aeruginosa et de production de carbapénèmase multiples, étendus et panrésistants aux médicaments à partir d’isolats présumés stockés dans une biobanque de l’institut éthiopien de santé publique. Infecter la résistance aux médicaments. 2021;14:3609–3618. doi:10.2147/IDR.S327652