Libération précoce – Anévrisme infecté causé par une infection à Desulfovibrio desulfuricans – Volume 29, Numéro 8—Août 2023 – Revue des maladies infectieuses émergentes

Désulfovibrio les espèces sont des bactéries gram-négatives, sulfato-réductrices, non fermentantes et anaérobies présentes dans l’environnement, y compris dans le sol, l’eau et les eaux usées, ainsi que dans les voies digestives des humains et des animaux (1). Ils causent rarement des infections humaines, et leur prévalence clinique et leurs caractéristiques ne sont pas claires (2,3) Nous décrivons un cas d’anévrisme infecté causé par Desulfovibrio désulfuricans MB qui a été traité avec succès par remplacement de vaisseau artificiel et thérapie antimicrobienne après identification de l’agent pathogène responsable.

Un homme de 84 ans qui avait subi une réparation endovasculaire de l’aorte (EVAR) 9 ans plus tôt a été adressé pour suspicion d’anévrisme mycotique de l’aorte thoracoabdominale. Ses antécédents médicaux comprenaient une hypertension, un diabète sucré de type 2 et une maladie rénale chronique. Six semaines avant la saisine, il avait mangé du poisson grillé ; 2 semaines plus tard, il avait eu de la fièvre avec des frissons transitoires, suivis de douleurs abdominales persistantes pendant 2 semaines. La tomodensitométrie a révélé une arête de poisson logée dans le tractus iléo-colique, avec une zone hyper-absorbante dans la paroi artérielle ; l’anévrisme de l’aorte abdominale post-EVAR était plus gros qu’il ne l’était 4 mois auparavant. Il avait reçu un traitement antimicrobien 5 jours avant la référence. Les hémocultures après traitement étaient négatives.

A l’admission, le patient ne paraissait pas en détresse. La tension artérielle était de 112/80 mm Hg, le pouls de 60 battements/min, la température corporelle de 36,4 °C, la fréquence respiratoire de 18 respirations/min et le score de l’échelle de coma de Glasgow de 15. À l’examen physique, les signes thoraciques et cardiovasculaires étaient sans particularité ; une sensibilité abdominale a été notée à la palpation. Les tests de laboratoire ont indiqué que le nombre de leucocytes était de 11,05 × 10³ cellules/L, protéine C-réactive 12,12 mg/dL, créatinine sérique 1,39 mg/dL et taux d’hémoglobine A1c 9,9. Les résultats de l’hémoculture complémentaire réalisée sous traitement ampicilline/sulbactam (3 g/6 h) étaient également négatifs.

Au jour 5 de l’admission, un débridement chirurgical a été effectué, suivi d’une ablation partielle de la greffe EVAR et de la pose in situ d’une greffe en Y avec revascularisation, y compris les artères rénales bilatérales et mésentériques supérieures. Les résultats peropératoires ont montré la formation d’un abcès partiel dans la paroi de l’artère abdominale. La coloration de Gram du pus de l’abcès a montré des bâtonnets gram-négatifs (figure, panneau A), et des cultures de pus peropératoires anaérobies ultérieures ont été observées (figure, panneau B). Spectrométrie de masse à temps de vol de désorption/ionisation laser assistée par matrice (MALDI-TOF) utilisant la version 9 de la bibliothèque MALDI Biotyper (Bruker Daltonics, https://www.bruker.com) n’a pas identifié de manière fiable les agents pathogènes (Annexe). Nous avons donc effectué le séquençage de l’ARN ribosomique 16S (ARNr 16S) des isolats en utilisant le programme de recherche d’homologie de séquence BLAST (EzBioCloud, https://www.ezbiocloud.net) pour analyse. Le séquençage a montré une homologie de 99,86 % avec D. désulfuriques MB ATCC27774 (numéro d’accès GenBank CP001358.1) et correspondances de nucléotides de 1 470/1 472 pb. Le test de désulfoviridine était positif et les propriétés biochimiques des isolats correspondaient à celles de D. désulfuriques Mo. Au jour 6, nous avons effectué une réparation endovasculaire de l’aorte thoracique, une embolisation par bobine de l’artère cœliaque et mésentérique inférieure et une résection coloscopique en arête de poisson.

L’évolution postopératoire et le traitement antibiotique se sont déroulés sans incident. Le patient a reçu 4 semaines de traitement ampicilline/sulbactam (3 g/6 h) après débridement chirurgical. Il est sorti avec une administration orale continue d’amoxicilline/acide clavulanique. Le greffon EVAR infecté étant conservé, un traitement antibiotique continu a été recommandé.

D. désulfuriquesqui possède 2 génotypes (Essex et MB), est le plus pathogène parmi Désulfovibrio spp., et la bactériémie survient lorsqu’il y a translocation bactérienne du tractus intestinal (3–5). Désulfovibrio spp. peut également causer une appendicite, des abcès abdominaux et une arthrite septique; cependant, un anévrisme infecté est extrêmement rare et seuls 2 cas, dont 1 cas suspect, ont été signalés auparavant (3,6). Une des raisons de la rareté est que Désulfovibrio spp. nécessitent une longue période d’incubation (3 à 7 jours) pour être détectés en hémoculture, et ils ne peuvent pas être identifiés à l’aide de tests de réaction biochimique (3,7). Sauf dans 2 cas, les cas précédents ont également nécessité une identification à l’aide d’ARNr 16S. Désulfovibrio spp. n’étaient pas inclus dans de nombreuses bases de données système jusqu’à récemment, ce qui a peut-être contribué à l’incapacité de les identifier à l’aide de la spectrométrie de masse MALDI-TOF (2). Cependant, même si Désulfovibrio spp. sont inclus dans la bibliothèque de spectrométrie de masse MALDI-TOF que nous avons utilisée, nous n’avons pas pu identifier l’agent pathogène. Des facteurs tels que le nombre absolu de souches enregistrées dans le Désulfovibrio spp. bibliothèque peut rendre l’identification difficile, et l’exactitude de l’identification peut toujours être problématique. La difficulté d’identification peut donc entraîner un sous-diagnostic.

Chez notre patient, l’arête de poisson a perforé la région iléo-colique, permettant à la bactériémie hématogène d’entrer et de provoquer l’infection. Le diabète de type 2 non contrôlé peut également avoir joué un rôle. Aucun agent pathogène n’a été détecté dans les hémocultures, peut-être en raison de l’administration antérieure d’un traitement antimicrobien. Cependant, après consultation avec l’infectiologue et le microbiologiste, nous avons effectué un séquençage de l’ARNr 16S, ce qui a conduit à la détection de D. désulfuriques MB et administration antimicrobienne appropriée. Lorsque des bacilles à Gram négatif sont détectés dans des cultures anaérobies d’anévrismes infectés, Désulfovibrio spp. une infection doit être suspectée, en particulier en cas de maladie gastro-intestinale.

En général, Désulfovibrio spp. sont sensibles au chloramphénicol et au métronidazole; la plupart sont sensibles à l’imipénème et à la clindamycine, mais le traitement optimal pour Désulfovibrio spp. l’infection n’a pas été établie (3,7). Notre rapport suggère que l’ampicilline/sulbactam et l’amoxicilline/clavulanate peuvent également être des options thérapeutiques efficaces pour Désulfovibrio spp. infections.

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