L’Inde devrait-elle étudier les eaux usées pour suivre le paludisme et la dengue ?

La surveillance des eaux usées est un excellent outil pour surveiller la présence d’agents pathogènes spécifiques bien avant qu’ils puissent être détectés par des tests en laboratoire. Il est couramment utilisé depuis des décennies pour suivre le virus de la polio dans presque tous les pays. Les virus d’origine hydrique peuvent être mieux étudiés en analysant des échantillons d’eaux usées. Si la surveillance des eaux usées fournit des informations précises sur la présence du virus de la polio excrété par l’homme, dans le cas d’autres agents pathogènes, par exemple le virus SARS-CoV-2, elle contribue à fournir des informations sur les nouvelles variantes et la charge virale, qui servent d’indicateur de l’étendue du virus. du virus se propageant dans la communauté. Le plus grand avantage de la surveillance des eaux usées est qu’elle est rentable et qu’elle peut confirmer de manière indépendante la présence d’agents pathogènes avant que les tests en laboratoire ne déclenchent un signal d’alarme.

Par exemple, la surveillance des eaux usées effectuée par l’Institut Tata pour la génétique et la société (TIGS) à Bangalore a permis de détecter une vague silencieuse de la variante XBB.1.16 Omicron dans la ville l’année dernière. La variante du virus a commencé à augmenter début mars de l’année dernière et a culminé le 1er avril.

L’utilité de la surveillance des eaux usées pendant la pandémie ayant été établie, les chercheurs des pays développés l’ont utilisée pour suivre d’autres maladies telles que la variole du singe, la grippe et le choléra. Dans un article publié en novembre de l’année dernière dans la revue Médecine translationnelle scientifiquedes chercheurs américains ont suggéré que la surveillance des eaux usées soit étendue pour suivre la dengue, le paludisme, le Zika et la typhoïde.

L’Inde devrait-elle également recourir à la surveillance des eaux usées pour suivre les maladies à transmission vectorielle, comme les pays développés ? « Les États-Unis et l’Europe n’ont pas beaucoup de dengue et il est peu probable qu’ils testent les fièvres pour détecter la dengue ou le paludisme à moins de savoir qu’ils existent (ce qui peut se produire grâce à la surveillance environnementale). En Inde, il s’agit de maladies endémiques, de sorte que les questions qui peuvent être résolues par la surveillance environnementale doivent être examinées attentivement, car les cas cliniques sont susceptibles d’être testés pour des causes connues », explique le Dr Gagandeep Kang, ancien professeur au CMC Vellore.

Dans un article publié dans la revue Tendances en parasitologiele Dr Farah Ishtiaq de l’Institut Tata pour la génétique et la société, basé à Bengaluru, qui utilise la surveillance des eaux usées pour étudier le fardeau du SRAS-CoV-2 à Bengaluru, affirme que le recours à la surveillance des eaux usées pour les agents pathogènes à transmission vectorielle devrait prendre en compte la situation géographique. contexte, la biologie des pathogènes et la disponibilité des réseaux d’assainissement.

Il y a eu récemment des épidémies de paludisme et de dengue aux États-Unis et au Portugal. Cependant, les États-Unis et les pays européens signalent rarement le paludisme et la dengue. Les pays développés disposent également d’excellents réseaux d’égouts, ce qui facilite la traque de ces agents pathogènes. Enfin, la transmission est saisonnière, voire inexistante.

Mais en Inde, le paludisme et la dengue sont endémiques et la transmission des agents pathogènes a lieu presque tout au long de l’année. « Il est important de noter qu’outre les personnes excrétant les agents pathogènes par les selles, plusieurs mammifères, notamment des primates non humains, servent d’hôtes réservoirs du paludisme et de la dengue. Ainsi, dans un pays tropical comme l’Inde, il est difficile de dire que tous les microbes du paludisme et de la dengue détectés dans les eaux usées sont excrétés uniquement par les humains », explique le Dr Ishtiaq.

Dans le cas de la dengue, l’excrétion du virus par l’homme est faible. Cela rend difficile la détection de l’ARN du virus de la dengue dans les eaux usées à des niveaux similaires à ceux de l’ARN du SRAS-CoV-2. « Utiliser la surveillance des eaux usées pour détecter les agents pathogènes du paludisme ou de la dengue et déterminer le fardeau réel de la maladie dans la communauté dans un contexte comme le nôtre constitue un défi », explique le Dr Ishtiaq.

« Pour les maladies à transmission vectorielle, la surveillance des eaux usées ne suffit pas. Là où nous essayons de résoudre le problème grâce à la surveillance des vecteurs, la surveillance des moustiques ne doit pas être laissée de côté et la surveillance des eaux usées doit être considérée comme une solution. Contrairement aux agents pathogènes d’origine hydrique tels que le rotavirus et l’hépatite qui se transmettent par les excréments humains, les maladies à transmission vectorielle qui ont d’autres hôtes réservoirs seront un défi à étudier grâce à la surveillance des eaux usées, ajoute-t-elle. Bien que les animaux servent d’hôtes au paludisme et à la dengue à travers le monde, la diversité des hôtes animaux dans les pays tropicaux n’est en aucun cas comparable à celle des pays tempérés.

« Il y a un énorme effort pour identifier les agents pathogènes prioritaires pour la surveillance des eaux usées, ce qui est bienvenu pour les maladies d’origine hydrique, la grippe, etc. Mais si on me demande de donner la priorité à la dengue et au paludisme, je réfléchirai sérieusement car je sais que le signal que je recevrai ne sera pas le cas. provenir exclusivement d’humains », souligne le Dr Ishtiaq. L’un des principaux critères de sélection des agents pathogènes prioritaires pour la surveillance des eaux usées est que les agents pathogènes soient stables dans les eaux usées et soient systématiquement excrétés dans les matières fécales ou l’urine.

En août 2022, outre le virus SRAS-CoV-2, le Bangladesh a lancé un programme de validation de principe de surveillance des eaux usées pour suivre et surveiller trois autres agents pathogènes évitables par la vaccination, notamment Salmonella typhi, Vibrio cholériqueet le rotavirus dans les communautés.

“Lors de la sélection des agents pathogènes prioritaires pour la surveillance des eaux usées, il est essentiel de prendre en compte les limites et les défis liés aux différents systèmes d’assainissement et à la géographie hôte-parasite avant de tirer des conclusions à partir des données de surveillance des eaux usées”, écrit-elle.