Fini le simple début de la pandémie de COVID de 2020, du moins en termes d’évolution virale.
Auparavant, le transfert de puissance était relativement simple d’une variante à l’autre, de la souche d’origine à Alpha, à Delta, à Omicron – l’un balayant le monde avant qu’un autre ne prenne le relais.
Maintenant, c’est une bataille royale entre d’éminentes “familles” virales qui se font la guerre pour garder le pouvoir au sein de la lignée. Aucune famille – BA.5, XBB ou BQ – n’a connu de succès mondial cet automne. Pas encore, du moins.
Alors que le virus derrière COVID, à savoir la variété Omicron, mute à un rythme sans précédent, l’attention des scientifiques s’est déplacée des souches uniques vers des groupes apparentés.
Exemple : XBB, une combinaison de deux spawns différents d’Omicron qui ont commencé à déferler à Singapour et au Bangladesh ces dernières semaines. Il n’est pas encore arrivé aux États-Unis, du moins officiellement. Mais ses petits-enfants, XBB.1.1 et XBB.1.3, ont, selon données du GISAIDune organisation de recherche internationale qui suit l’évolution du COVID et du virus de la grippe.
De nos jours, il est risqué de regarder un pays et de supposer que parce qu’il connaît une certaine vague, un autre pays connaîtra bientôt la même chose, a déclaré Ryan Gregory, professeur de biologie évolutive à l’Université de Guelph en Ontario, au Canada. Fortune.
“Le XBB [surge] Singapour voit peut-être pas celui que nous voyons aux États-Unis », a-t-il déclaré.
L’été qui a tout changé
En ce qui concerne l’évolution virale, tout était relativement simple grâce à la poussée “furtive d’Omicron” plus tôt cette année, selon les experts. Une nouvelle variante se matérialiserait et le nombre de cas augmenterait, vacillerait un peu, puis chuterait, comme sur des roulettes.
Mais le calcul a changé cet été avec BA.5. Le spawn Omicron de nouvelle génération a bondi à l’échelle mondiale, puis a bondi encore dans certains endroits comme l’Allemagne et la France. Pendant ce temps, dans d’autres pays, les autres souches Omicron XBB ou BQ – ou leurs descendants – ont commencé à gonfler.
Aujourd’hui, il existe des centaines de souches d’Omicron, toutes avec des mutations qui offrent une transmissibilité accrue, la capacité d’échapper à l’immunité, le potentiel de provoquer une maladie plus grave, ou une combinaison de ceux-ci.
La scène diffère selon l’endroit où vous vous trouvez. Les variantes BA.5 sont toujours dominantes aux Etats-Unisselon les données du GISAID, tandis que les infections impliquant des variantes de BQ augmentent également.
La plus grande proportion de cas en France sont également membres de la famille BA.5. Mais les souches qui y dominent diffèrent légèrement de celles qui sont les plus courantes aux États-Unis.
Au Chili“l’Omicron furtif” est toujours aussi fort, représentant près de 44 % des cas, avec des descendants de lui-même et de l’Omicron d’origine sur ses talons. Et la Chine souvent confinée est un monde complètement différent, avec l’une des souches COVID originales représentant 31% des cas, suivie de Delta à près de 19%.
L’histoire de COVID n’est plus “une variante qui monte, fait son travail, nous atténuons à nouveau, elle redescend, nous nous préparons pour la suivante”, a déclaré Gregory. « Les choses coexistent en même temps, bougent. Plus ils circulent longtemps, plus vous obtenez des combinaisons.
Non seulement plusieurs familles virales se battent, avec différents niveaux de succès dans différentes régions, mais des batailles se déroulent au sein des familles. En effet, les proches se battent entre eux pour diriger les lignages, dit Gregory.
Victoires à tour de rôle ?
La famille BQ extrêmement évasive et immunisée deviendra presque certainement dominante aux États-Unis dans les semaines à venir, selon plusieurs experts. Mais cela ne signifie pas que les États-Unis – ou tout autre pays avec des niveaux croissants de BQ – ont esquivé les autres variantes.
XBB alimentera probablement la vague américaine suivante, puis peut-être XBC, un hybride Delta-Omicron, racontent Gregory et Raj Rajnarayanan, doyen adjoint de la recherche et professeur associé au campus de l’Institut de technologie de New York à Jonesboro, Ark. Fortune.
Cela pourrait signifier que les États-Unis – et d’autres pays – sont dans un hiver au cours duquel plusieurs familles virales sont brièvement dominantes avant de reculer. Il n’y aura peut-être pas de pic de COVID à la fin de 2022, mais des surtensions qui se chevauchent alimentées par différentes variantes qui créent un large “pic laid” avec un sommet dentelé, dit Rajnarayanan.
Avant la poussée de BA.5 de cet été, COVID était dans un «cycle prédateur-proie» constant, selon Gregory.
Ces jours sont révolus.
“C’est une écologie maintenant”, a déclaré Gregory. « C’était : ‘Combien de lapins et combien de loups ?’ Maintenant, c’est tout un écosystème.
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