Perturbations du microbiome signalées comme signature du syndrome de fatigue chronique/encéphalomyélite myalgique

Perturbations du microbiome signalées comme signature du syndrome de fatigue chronique/encéphalomyélite myalgique

Newswise – De nouvelles recherches révèlent des différences dans les microbiomes intestinaux des personnes atteintes d’encéphalomyélite myalgique/syndrome de fatigue chronique (EM/SFC) par rapport à ceux de témoins sains.

L’EM/SFC se caractérise par une fatigue débilitante inexpliquée, un dysfonctionnement cognitif, des troubles gastro-intestinaux, entre autres symptômes.

L’étude a été menée par des scientifiques du Centre d’infection et d’immunité (CII) à la Columbia University Mailman School of Public Health, dans le cadre du Centre de solutions pour l’encéphalomyélite myalgique/syndrome de fatigue chronique, un groupe de recherche interdisciplinaire et interinstitutionnel dédié à la compréhension de la biologie de la maladie afin de développer des moyens efficaces pour la diagnostiquer, la traiter et la prévenir. Les résultats paraissent dans le journal Hôte cellulaire et microbe.

Les chercheurs ont effectué des analyses métagénomiques et métabolomiques d’échantillons fécaux prélevés dans une cohorte géographiquement diversifiée de 106 cas et 91 témoins sains. Les résultats ont révélé des différences dans la diversité, l’abondance, les voies biologiques fonctionnelles et les interactions entre les bactéries du microbiome intestinal. Les cas et les témoins ont été appariés selon l’âge, le sexe, la géographie et le statut socio-économique.

Bactéries intestinales Faecalibacterium prausnitzii et Eubactérie rectale, qui sont à la fois normalement abondants et bénéfiques pour la santé, ont été réduits chez les participants à l’EM/SFC. Pour les deux bactéries, les chercheurs ont également découvert une capacité microbienne déficiente pour synthétiser le butyrate, le principal carburant des cellules du côlon, avec l’EM/SFC. L’abondance de Faecalibacterium prausnitzii était inversement associée à la sévérité de la fatigue.

La seule autre espèce identifiée avec une abondance relative réduite dans ME/CFS était C. secondes, un producteur d’acétate, qui pourrait contribuer à la carence nette en acétate que les chercheurs ont découverte chez les sujets atteints d’EM/SFC. L’acétate est utilisé par les bactéries productrices de butyrate pour produire du butyrate.

Neuf espèces supplémentaires avaient une abondance relative accrue dans ME/CFS par rapport aux témoins sains, y compris C. bolteae qui, dans d’autres recherches, a été corrélé à la fatigue dans la sclérose en plaques. Un autre, R. gnavus, a été associée à une maladie intestinale inflammatoire.

« Le microbiome intestinal est une communauté écologique complexe regorgeant d’interactions inter-espèces diverses qui peuvent être bénéfiques ou nuisibles. Notre recherche révèle que chez les personnes atteintes d’EM/SFC, il peut y avoir un recâblage important des réseaux de bactéries dans ce système », déclare l’auteur principal de l’étude. Brent WilliamsPhD, professeur adjoint d’épidémiologie en CII à la Columbia Mailman School of Public Health.

“Comprendre le lien entre l’EM/SFC et les perturbations du microbiome intestinal peut conduire à des moyens de classer la maladie et les cibles d’essais thérapeutiques”, ajoute le co-auteur. W.Ian LipkinMD, directeur du CII et professeur John Snow d’épidémiologie à la Columbia Mailman School.

Le premier auteur de l’étude est Cheng Guo, PhD, analyste programmeur senior au CII. D’autres co-auteurs sont listés dans la publication.

La recherche a été financée par la subvention des National Institutes of Health au Center for Solutions for ME/CFS de l’Université Columbia (numéro de subvention 1U54AI138370), la subvention NIH R56AI120724 et des donateurs anonymes via le Crowdfunding Microbe Discovery Project.

Les auteurs ne déclarent aucun intérêt concurrent.

À propos du ME/SFC

Les experts estiment qu’il y a entre 800 000 et 2 millions d’Américains atteints d’EM/SFC, un trouble complexe et débilitant caractérisé par une fatigue extrême après l’effort et d’autres symptômes, notamment des douleurs musculaires et articulaires, un dysfonctionnement cognitif, des troubles du sommeil et une intolérance orthostatique. Actuellement, il n’existe aucun test de diagnostic pour la maladie; au lieu de cela, les patients sont diagnostiqués sur la base d’un examen clinique et des antécédents et de l’exclusion d’autres troubles.

Recherches antérieures sur l’EM/SFC

Dans un étude 2017, les scientifiques du CII ont rapporté avoir découvert des niveaux anormaux de bactéries intestinales spécifiques liées à l’EM/SFC chez des patients avec et sans syndrome du côlon irritable concomitant, IBS. Un an plus tard, une autre étude identifié une constellation de métabolites liés à l’EM/SFC, permettant de prédire si une personne souffre ou non du trouble avec une confiance de 84 %.

Dans un étude 2015, les chercheurs du CII ont identifié des changements immunitaires distincts chez les patients diagnostiqués avec l’EM/SFC. Ces signatures immunitaires représentaient la première preuve physique solide que l’EM/SFC est une maladie biologique par opposition à un trouble psychologique, et la première preuve que la maladie a des stades distincts. Dans un étude 2012les chercheurs ont exclu un lien présumé entre un rétrovirus de souris appelé XMRV et ME/CFS.

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