Les tests de biopsie liquide multiomiques pourraient avoir un potentiel clinique lorsqu’ils sont utilisés comme méthode non invasive pour la détection de la maladie à un stade précoce cancer colorectal (CRC), selon une étude publiée dans Cancer moléculaire.1 La biopsie liquide pourrait servir de méthode de dépistage de première intention pour les patients avant qu’ils ne subissent une coloscopie.
Le cancer colorectal est le troisième cancer le plus fréquent dans le monde et la deuxième cause de décès par cancer.2 Il a été démontré que la détection précoce est le moyen le plus efficace d’améliorer les résultats pour les patients, mais l’observance des coloscopies est faible dans la population cible. L’ADN acellulaire (cfDNA) a été utilisé dans des biopsies liquides qui peuvent potentiellement détecter un cancer à un stade précoce. Cette étude visait à utiliser la technologie Mutation Capsule Plus (MCP) pour profiler plusieurs caractéristiques génomiques et développer un test multiomique pour détecter le cancer colorectal à ses débuts.1
Une biopsie liquide pourrait permettre de détecter le cancer colorectal à un stade précoce | Crédit photo : angellodeco – stock.adobe.com
Les chercheurs ont utilisé un groupe témoin sain (96 patients) et un groupe diagnostiqué avec un CCR (93 patients) pour la cohorte de formation et 89 patients atteints de CCR et 95 individus sains pour la cohorte de validation. Les patients étaient atteints de CCR de stades I à IV, le stade IV représentant 2,2 % de la population, le stade I à 17,2 %, le stade II à 39,8 % et le stade III à 38,7 %. Les participants ont été exclus s’ils avaient des antécédents de traitement néoadjuvant ou de cancer.
La mutation, la méthylation et les caractéristiques à l’échelle du génome ont été profilées pour chaque échantillon de cfDNA à l’aide de la technologie MCP. Des marqueurs de méthylation potentiels ont été sélectionnés pour être utilisés dans la détermination du panel de séquençage ciblé pour le cfDNA. Les problèmes colorectaux normaux des patients sains et des patients atteints de CCR ont été comparés aux sites hyperméthylés dans les tissus tumoraux et sélectionnés pour le panel. À l’aide de ces informations provenant de la cohorte de formation, les caractéristiques moléculaires ont été profilées et les biomarqueurs les plus informatifs utilisés pour distinguer le CCR ont été sélectionnés.
Le test de mutation a pu détecter au moins 1 mutation éligible chez 41,9 % des patients atteints de CCR, contre 9,4 % chez les participants sains lors du test de la cohorte de formation. APC mutation a été détectée chez 19,4 %, la TP53 mutation a été trouvée dans 23,7% des cas, et la KRAS La mutation a été trouvée chez 17,2 % des patients atteints de CCR.
Lorsqu’un modèle de régression logistique a été construit sur la base de ces marqueurs pour distinguer les patients atteints de CCR des témoins sains, l’aire sous la courbe (ASC) était comprise entre 0,857 (IC à 95 %, 0,804-0,910) pour la CNV et 0,904 (IC à 95 %, 0,862-0,945) pour la méthylation de l’ADN. Un modèle intégré a été construit et a atteint une ASC de 0,993 (IC à 95 %, 0,985-1,000) dans la cohorte de formation avec une spécificité de 94,8 % et une sensibilité de 97,8 %.
Le modèle intégré a été testé dans la cohorte de validation et a atteint une AUC de 0,981 (IC à 95 %, 0,965-0,998), avec une spécificité de 94,7 % et une sensibilité de 92,1 %. La sensibilité était la plus faible dans le CCR de stade 1 (80 %) et la plus élevée dans les stades III et IV (100 % dans les deux cas) ; la méthylation de l’ADN avait la meilleure performance avec une AUC de 0,926 (IC à 95 %, 0,883-0,968).
Cette étude comportait certaines limites. La taille de l’échantillon était limitée et aurait pu affecter l’évaluation du modèle. De plus, l’étude n’incluait pas de patients présentant des lésions précancéreuses, ce qui est un indicateur de cancer colorectal. Les études futures devront inclure des groupes de patients plus diversifiés pour confirmer l’efficacité du modèle.
« Nous avons développé une méthode basée sur le sang pour la détection précoce du cancer colorectal et démontré le potentiel de dépistage des biomarqueurs multiomiques basés sur l’ADNlc », concluent les auteurs. « Avec une validation plus poussée, cette stratégie multiomique devrait être mise en œuvre dans les milieux cliniques comme modalité de dépistage de première intention avant la coloscopie. »
Références
- Gao Y, Cao D, Li M, et al. Intégration de caractéristiques multiomiques pour la détection précoce du cancer colorectal à partir du sang. Cancer moléculaire. 2024;23:173. est ce que je:10.1186/s12943-024-01959-3
- Cancer colorectal : faits essentiels. Organisation mondiale de la Santé. 11 juillet 2023. Consulté le 27 août 2024.
2024-08-28 18:09:48
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