Projet pilote « eDNA » : des stations de mesure de l’air collectent l’ADN environnemental

Il s’agit d’un immense trésor de données qui peuvent fournir aux scientifiques des informations importantes : l’ADN environnemental. Il s’agit de traces génétiques que les organismes laissent dans l’environnement via des cellules cutanées ou des spores. Un projet pilote est actuellement en cours au Bureau d’État de Hesse pour la conservation de la nature, l’environnement et la géologie (HLNUG) pour étudier ces minuscules porteurs génétiques.

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Les experts du HLNUG issus de diverses disciplines ont examiné si l’ADN environnemental (ADNe), que les stations de mesure de l’air enregistrent depuis les airs, était adapté à l’identification des êtres vivants dans l’environnement. Les stations de mesure de l’air ont été conçues à l’origine uniquement pour collecter les fines poussières de l’air afin de mesurer la qualité de l’air.

Le coordinateur du projet, Simon Thorn, tire une première conclusion positive. Il a été démontré que la méthode choisie est fondamentalement adaptée à la collecte et à l’analyse de l’ADN de l’environnement. Par exemple, l’ADNe collecté reste intact avec la méthode de stockage par filtre choisie.

ADN séché à l’air

“Normalement, l’ADN ou les substrats à partir desquels l’ADN doit être extrait sont stockés dans de l’alcool pur ou à des températures glaciales”, explique Thorn. Ceci est nécessaire pour contenir la décomposition des longues chaînes moléculaires. Cependant, les filtres des stations de mesure de l’air “Et cela a quand même fonctionné.” Cela signifie que l’analyse ultérieure de l’ADNe a donné des résultats utilisables ; les longs brins de matériel génétique n’étaient pas trop émiettés pour pouvoir lire de quelles créatures les filtres avaient capté l’ADNe. .

Bien que les scientifiques aient principalement testé la méthode, ils peuvent également faire des premières déclarations sur le contenu. «On peut dire en gros qu’environ un tiers de l’ADN environnemental collecté sont des spores fongiques», explique Thorn. Cela n’est pas surprenant car les spores ont une excellente durée de conservation. Cependant, un quart provient des arthropodes, majoritairement du groupe des insectes. De plus, un autre quart provient des vertébrés. Le reste est un mélange coloré d’autres créatures.

L’ADNe est attribué via des bases de données de référence dans lesquelles est stocké le matériel génétique de nombreuses plantes et animaux. «Il existe des groupes bien enregistrés et bien étudiés, par exemple les oiseaux», explique Thorn. Cela s’applique également aux papillons et aux coléoptères.

Fouets de boue recherchés et trouvés

Le HLNUG avait collecté 112 échantillons de filtres avec des matériaux différents, ils étaient d’âges différents et provenaient de lieux différents. “C’est une méthode absolument géniale car elle peut être facilement standardisée”, confirme Thorn. En outre, la technologie d’analyse s’améliore rapidement et les stations de mesure de l’air sont déjà disponibles comme collecteurs de matériaux.

Le scientifique espère que l’étude de l’ADNe fournira, entre autres, « des indices sur des espèces ou des connexions que nous aurions peut-être négligées auparavant ». À titre d’exemple, il a cité une étude dans laquelle l’ADNe a été filtré de l’eau et recherché le rare fouet de boue, un poisson démersal de 20 à 30 centimètres de long. Après le dépistage de masse, les eaux ayant donné des résultats positifs ont été spécifiquement contrôlées pour les espèces de poissons. “Et de nouveaux gisements ont effectivement été découverts.”

(dz)