Depuis le début de la pandémie de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par l’apparition soudaine du syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus-2 (SRAS-CoV-2), une évolution génomique du virus s’est produite. Cela a conduit à l’émergence de plusieurs variantes du SRAS-CoV-2 qui ont été classées comme variantes préoccupantes (VOC) et variantes d’intérêt (VOI) en fonction de leurs taux de transmission, de leur virulence et de leur capacité à échapper aux réponses immunitaires induites par les infection ou vaccination.
Étude: L’activité effectrice Fc et la neutralisation contre SARS-CoV-2 BA.4 sont compromises dans les sérums convalescents, quelle que soit la variante infectante. Crédit d’image : CI Photos / Shutterstock.com
Arrière plan
À ce jour, tous les vaccins et traitements COVID-19 actuellement disponibles ont été développés sur la base de la protéine de pointe de la souche SARS-CoV-2 d’origine. Ainsi, la présence de mutations dans la région de la pointe a réduit l’efficacité des vaccins et des thérapeutiques actuels contre les variants du SRAS-CoV-2.
Le COV Omicron BA.1, qui contient plus de trente mutations dans sa protéine de pointe, a rapidement remplacé la souche Delta et, peu après son émergence, est devenu la souche circulante dominante du SRAS-CoV-2 dans la plupart des pays du monde. Bien que les vaccins COVID-19 n’aient pas réussi à protéger les individus contre la maladie, ils ont réussi à prévenir une infection grave en raison des fonctionnalités préservées des lymphocytes T et des cellules effectrices Fc, ainsi que de la cytotoxicité cellulaire dépendante des anticorps (ADCC).
Au fil du temps, la variante Omicron a évolué en plusieurs sous-lignées, notamment BA.2, BA.2.12.1, BA.4 et BA.5.
Les sous-lignées BA.4 et BA.5 partagent des mutations similaires dans la région des pointes, mais contiennent des gènes de protéine et de membrane (M) non structurels différents. Par rapport à BA.1 et BA.2, BA.4 présente une résistance à la neutralisation accrue contre les anticorps monoclonaux, les sérums de convalescence et les sérums de vaccinés.
Des études antérieures ont révélé que les variants du SRAS-CoV-2 induisent des profils variés d’anticorps neutralisants (nAbs) et de fonction effectrice Fc. La variante bêta, par exemple, stimule les réponses humorales avec une réactivité croisée accrue, tandis que la variante Omicron induit la production de nAbs spécifiques à la souche.
Une nouvelle étude sud-africaine publiée sur bioRxiv* Le serveur de préimpression évalue la sensibilité de BA.4 contre les nAb et l’ADCC chez les individus vaccinés et non vaccinés infectés par les souches SARS-CoV-2 D614G, Beta, Delta ou BA.1.
Résultats de l’étude
Il a été démontré que BA.4 échappe aux attrapes induits par une infection et une vaccination antérieures. Dans l’étude actuelle, la résistance à BA.4 a été observée contre les anticorps anti-Acn et ADCC induits par quatre COV, dont D614G, Beta, Delta et BA.1.
<img alt="L'évasion de la neutralisation de BA.4 varie selon la variante infectante chez les personnes convalescentes non vaccinées. Titre de neutralisation (ID50) dans le plasma convalescent de donneurs non vaccinés infectés par (A) D614G, (B) Beta, (C) Delta et (D) Omicron BA.1. Le plasma a été testé contre D614G, Beta, Delta, Omicron BA.1, BA.2 et BA.4. Les lignes indiquent le titre moyen géométrique (GMT) également représenté sous le graphique avec une diminution de pli et un knock-out (K/O) d'activité pour d'autres variants en pourcentage par rapport à la souche infectante. Les lignes pointillées indiquent la limite de détection du test. La signification statistique entre les variantes est indiquée par le test de Friedman avec la correction de Dunn. *p<0,05 ; **p<0,01 ; ***p<0,001 ; ****p
L’évasion de la neutralisation de BA.4 varie selon la variante infectante chez les personnes convalescentes non vaccinées. Titre de neutralisation (ID50) dans le plasma convalescent de donneurs non vaccinés infectés par (A) D614G, (B) Beta, (C) Delta et (D) Omicron BA.1. Le plasma a été testé contre D614G, Beta, Delta, Omicron BA.1, BA.2 et BA.4. Les lignes indiquent le titre moyen géométrique (GMT) également représenté sous le graphique avec une diminution de pli et un knock-out (K/O) d’activité pour d’autres variants en pourcentage par rapport à la souche infectante. Les lignes pointillées indiquent la limite de détection du test. La signification statistique entre les variantes est indiquée par le test de Friedman avec la correction de Dunn. *p<0,05 ; **p<0,01 ; ***p<0,001 ; ****p<0,0001 et ns = non significatif. Toutes les données sont représentatives de deux expériences indépendantes.
Quelle que soit la variante infectante, BA.4 s’est avéré très résistant à la neutralisation. En particulier, les anticorps induits par Delta et BA.1 ont montré une efficacité réduite par rapport à ceux produits après une infection par D614G et Beta.
Il a déjà été signalé que la fonction effectrice Fc était préservée contre d’autres COV du SRAS-CoV-2. Dans ce contexte, les chercheurs ont utilisé l’activation de FcγRIIIa comme proxy pour l’ADCC et ont rapporté que BA.4 peut échapper à l’ADCC avec une efficacité plus élevée que les autres variantes.
Une plus grande réduction de la neutralisation contre BA.4 s’est produite chez les personnes non vaccinées qui se sont rétablies du COVID-19 causé par Delta ou BA.1. À cette fin, les titres autologues à la protéine de pointe Delta étaient beaucoup plus élevés par rapport à ceux contre D614G et Beta. Les individus qui se sont remis d’une infection par BA.1 ont montré une efficacité de neutralisation réduite contre BA.2 et BA.4.
<img alt="Les infections percées montrent une activité de neutralisation réduite contre BA.4, malgré des titres élevés contre d'autres COV. Titre de neutralisation (ID50) dans le plasma convalescent de donneurs vaccinés infectés par la suite avec (A) Delta et (B) Omicron BA.1. Les plasmas ont été testés contre D614G, Beta, Delta, Omicron BA.1, BA.2 et BA.4. Les lignes indiquent le titre moyen géométrique (GMT) également représenté sous le graphique avec une diminution de pli et un knock-out (K/O) d'activité pour d'autres variantes en pourcentage par rapport à la variante infectante. Les lignes pointillées indiquent la limite de détection du test. Diminution du facteur de neutralisation pour chaque COV représenté sous la forme d'un rapport du titre à la variante infectante Delta (C) ou BA.1 (D), pour les infections chez les individus non vaccinés (vert pour Delta et orange pour BA.1) et BTI (noir ). La signification statistique entre les variantes est indiquée par le test de Friedman avec la correction de Dunn. *p<0,05 ; **p<0,01 ; ***p<0,001 ; ****p Les infections percées montrent une activité de neutralisation réduite contre BA.4, malgré des titres élevés contre d’autres COV. Titre de neutralisation (ID50) dans du plasma convalescent de donneurs vaccinés infectés ultérieurement par (A) Delta et (B) Omicron BA.1. Les plasmas ont été testés contre D614G, Beta, Delta, Omicron BA.1, BA.2 et BA.4. Les lignes indiquent le titre moyen géométrique (GMT) également représenté sous le graphique avec une diminution de pli et un knock-out (K/O) d’activité pour d’autres variantes en pourcentage par rapport à la variante infectante. Les lignes pointillées indiquent la limite de détection du test. Diminution du facteur de neutralisation pour chaque COV représenté sous la forme d’un rapport du titre à la variante infectante Delta (C) ou BA.1 (D), pour les infections chez les individus non vaccinés (vert pour Delta et orange pour BA.1) et BTI (noir ). La signification statistique entre les variantes est indiquée par le test de Friedman avec la correction de Dunn. *p<0,05 ; **p<0,01 ; ***p<0,001 ; ****p<0,0001 et ns = non significatif. Toutes les données sont représentatives de deux expériences indépendantes.
Les résultats de l’étude actuelle s’alignent sur les rapports précédents démontrant des titres d’anticorps plus élevés chez les personnes vaccinées contre le COVID-19 présentant des infections percées par rapport à celles qui n’étaient pas vaccinées avant l’infection. Il est important de noter que des titres d’anticorps élevés offrent généralement une meilleure protection contre les COV.
Bien qu’un pourcentage élevé d’individus séropositifs soient présents en Afrique du Sud, la cinquième vague de COVID-19 s’est produite en raison d’une sensibilité réduite de BA.4 contre les nAb par rapport aux autres COV. Ainsi, BA.4 semble posséder une plus grande capacité à échapper à l’ADCC que les autres COV.
Limites
Les auteurs ont souligné certaines des limites de l’étude, notamment une cohorte d’étude de petite taille. Une autre limitation est que tous les échantillons n’ont pas été soumis à la fois aux tests ADCC et de neutralisation.
De plus, les chercheurs n’ont pas inclus les réponses des lymphocytes T à BA.4, qui est un facteur contributif clé qui protège un individu contre une infection grave.
conclusion
Les auteurs ont confirmé que BA.4 présentait une résistance de haut niveau aux nAb, quelles que soient les variantes infectantes. Cependant, l’étude actuelle a rapporté que des titres neutralisants élevés qui surviennent en raison d’une infection percée avec des variants BA.2 ou Delta après la vaccination favorisent la neutralisation contre BA.4.
De plus, une plus grande réduction de l’activité ADCC a été observée contre BA.4 par rapport aux autres COV. La résistance accrue à la neutralisation de BA.4 est considérée comme responsable de la transmission accrue de cette souche en Afrique du Sud, malgré des taux de séroprévalence élevés.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
