Des scientifiques participant à un voyage du Programme Antarctique Australien dans la région du glacier Denman, en Antarctique oriental, testent de nouvelles méthodes pour comprendre la biodiversité, sans perturber les créatures marines.
À bord du brise-glace australien, le RSV *Nuyina*, des scientifiques collectent de l’ADN environnemental (ADNe) à partir d’échantillons d’eau de mer pendant le voyage marin de Denman, afin d’établir une image de la biodiversité de la région.
L’ADNe est de l’ADN libéré par tous les organismes dans l’environnement,permettant aux scientifiques d’identifier quels organismes se trouvaient dans l’eau au moment où un échantillon a été prélevé [[1]], [[2]], [[3]].
« Si nous prélevons un petit échantillon d’eau de mer, nous pouvons le filtrer, puis séquencer l’ADN pour savoir ce qui vit là. »
C’est un moyen de réaliser une étude de la biodiversité à partir d’un simple échantillon d’eau,sans jamais avoir vu aucun des animaux. Il est possible de déduire ce qui vit là à partir des traces génétiques qui sont laissées derrière, et cela peut être fait à partir de l’eau de surface, mais aussi à travers toute la colonne d’eau jusqu’au fond marin.
Pendant ce voyage de deux mois, des échantillons d’eau de surface sont collectés, trois fois par jour, via la conduite d’eau de mer du navire. Des échantillons d’eau sont également prélevés à différentes profondeurs à l’aide de l’instrument de conductivité, de température et de profondeur (CTD) du RSV *Nuyina*.
« Les échantillons de surface et CTD nous donneront une image tridimensionnelle de la biodiversité. »
Si cet échantillonnage est effectué de manière répétée, dans le cadre d’un programme de surveillance à long terme, il sera possible d’observer si la biodiversité évolue au fil du temps, et quelles variables océaniques influencent les compositions des communautés.
La clé de ce programme de surveillance à long terme pourrait résider dans une nouvelle technologie actuellement testée, en collaboration avec un institut de recherche californien.
« Nous avons deux échantillonneurs d’ADNe automatisés qui se brancheront sur la conduite d’eau de mer et filtreront automatiquement l’eau à des moments prédéterminés tout au long du voyage. »
Les résultats des systèmes manuels et automatisés seront comparés ultérieurement pour déterminer si le système automatisé peut être utilisé lors de futurs voyages.
Des instruments peuvent collecter respectivement 60 et 144 échantillons d’eau.
« Les deux instruments filtrent l’eau et conservent ce qui se trouve sur le filtre d’une manière qui permet à l’échantillon de rester non réfrigéré pendant deux à quatre mois. Vous pouvez programmer les heures d’échantillonnage de l’instrument sur un téléphone ou un ordinateur et ils sont très simples à utiliser.»
L’un de ces instruments a été utilisé sur des navires,des « engins de surface autonomes » et ailleurs dans l’hémisphère nord. Cependant, c’est la première fois qu’un autre instrument est déployé sur le terrain, et la première fois pour les deux instruments dans l’hémisphère sud.
« Il s’agit d’un test d’ingénierie pour nous – ces appareils fonctionneront-ils de manière autonome pendant 10 semaines avec très peu d’interaction humaine ? Nous sommes vraiment ravis de voir comment ils fonctionnent. »
Il faut s’attendre à l’inattendu.
« Il y a beaucoup d’inconnues dans ce voyage,mais ces outils nous aideront à en apprendre davantage sur la diversité de référence et à décrire les environnements que nous rencontrons dans les différentes régions de l’océan Austral.»
L’ADN Environnemental (ADNe) : Une Révolution pour l’Étude de la Biodiversité en Antarctique
Table of Contents
Des scientifiques australiens, dans le cadre du Program Antarctique Australien, utilisent une méthode innovante pour étudier la biodiversité marine dans la région du glacier Denman en Antarctique oriental : l’ADN environnemental (ADNe). Cette technique permet d’identifier les organismes présents dans l’eau sans perturber leur environnement.
Qu’est-ce que l’ADN Environnemental (ADNe) ?
L’ADNe est l’ADN laissé par les organismes dans l’environnement. Il peut être extrait d’échantillons d’eau de mer pour identifier quelles espèces étaient présentes dans l’eau au moment du prélèvement [[1]],[[2]], [[3]].
Comment l’ADNe est-il utilisé dans cette étude ?
Les scientifiques à bord du brise-glace RSV Nuyina collectent des échantillons d’eau de mer pendant deux mois.Ils utilisent deux méthodes :
Échantillonnage manuel : Prélèvement d’échantillons d’eau de surface trois fois par jour via la conduite d’eau de mer du navire.
Échantillonnage avec l’instrument CTD : Prélèvement d’échantillons à différentes profondeurs à l’aide d’un instrument de conductivité, de température et de profondeur.
De plus, de nouveaux échantillonneurs automatisés d’ADNe sont testés, ce qui permettra de comparer les résultats obtenus grâce aux méthodes manuelles et automatisées. Ces instruments peuvent collecter respectivement 60 et 144 échantillons d’eau.
Pourquoi est-ce vital ?
L’ADNe offre une méthode non invasive pour étudier la biodiversité marine. En analysant l’ADNe,les scientifiques peuvent :
Identifier les espèces présentes dans une zone donnée sans les observer directement.
Créer une image tridimensionnelle de la biodiversité, en combinant les données de surface et de profondeur.
Surveiller l’évolution de la biodiversité au fil du temps, en réalisant des études répétées.
technologie et Innovation
Le voyage teste également de nouveaux échantillonneurs d’adne automatisés. Ces appareils permettront de filtrer et de préserver les échantillons d’eau pour l’analyze ultérieure.
FAQ : questions Fréquentes sur l’ADNe
Qu’est-ce que l’ADNe ? L’ADN libéré par les organismes dans leur environnement.
Comment est-il collecté ? Principalement à partir d’échantillons d’eau de mer.
Comment est-il utilisé ? Pour identifier les espèces présentes dans un environnement.
Quels sont les avantages de l’ADNe ? C’est une méthode non invasive pour étudier la biodiversité.
Où sont collectés les échantillons ? Dans la région du glacier Denman en Antarctique oriental.
Résumé des Méthodes d’Échantillonnage
| Méthode | Fréquence/Profondeur | Avantages/Objectifs |
| ———————– | ———————————– | ——————— |
| Prélèvement manuel | 3 fois par jour, surface | Suivi de la biodiversité de surface |
| Instrument CTD | Multiples profondeurs | Création d’un profil tridimensionnel de la biodiversité |
| Échantillonneurs automatisés | Programmé | Comparaison des méthodes et collecte continue |