Deux sous-variantes de la variante omikron du coronavirus, BQ.1.1 et XBB, peuvent échapper à notre immunité contre le virus. Les deux variantes peuvent se généraliser.
Bien que l’hiver approche, le nombre de cas de corona diminue dans le monde. Dans la semaine du 17 octobre au 23 octobre, aux Pays-Bas le nombre de tests positifs de 22 %. Le nombre de patients covid dans les hôpitaux a légèrement augmenté, de 6 %.
Les chiffres semblent donc plutôt bons. Pourtant, nous courons le risque que nouvelles sous-variantes bientôt provoquer une vague d’infection en Europe et aux États-Unis. C’est ce que dit Christina Pagel de l’University College London, une mathématicienne spécialisée dans la modélisation des problèmes de santé. Dans de nombreuses autres parties du monde, ces vagues ont déjà commencé.
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Éviter l’immunité
Jusqu’à récemment, la pandémie passait d’une variante du covid-19 à l’autre, par exemple du delta à micron, déclare le bioinformaticien Moritz Gerstung de l’Université de Heidelberg en Allemagne. « Il y avait toujours une nouvelle variante qui supplantait très rapidement la totalité ou la plupart des variantes précédentes. Maintenant, nous voyons vraiment un mélange de sous-variantes.
Les sous-variantes ne diffèrent les unes des autres que de manière mineure. Ces petits changements “sont le résultat de nombreuses mutations dans tout le génome viral”, explique Gerstung.
Étant donné que de nombreuses personnes ont été vaccinées ou ont été malades et ont ainsi développé une immunité, il existe une «pression de sélection» qui permet au virus d’évoluer vers des variantes évitant l’immunité. Plus tôt dans la pandémie, nous sommes passés d’une variante de virus à une autre à mesure que le virus infectait mieux les cellules, explique Gerstung. Maintenant que cette fonction a été “optimisée”, le virus continue d’évoluer avec des mutations plus petites qui échappent à l’immunité, dit-il.
BQ.1.1 en Europe et en Afrique
Une sous-variante inquiétante est BQ.1.1. C’est un descendant de la sous-variante omikron BA.5 BQ.1. Du 3 au 9 octobre, BQ.1 et ses descendants étaient responsables de 6% des cas de corona enregistrés auprès du monde virusdatabank GISAID. BQ.1 et ses suiveurs ont été détectés dans 65 pays.
En France, BQ.1.1 représente déjà environ la moitié des cas corona dans lesquels la variante est diagnostiquée. La France sera probablement à l’avant-garde de ce développement, mais le reste de l’Europe devrait suivre bientôt, selon Gerstung. Les cas de BQ.1.1 doublent environ chaque semaine, de sorte que la variante se propage rapidement dans le monde entier.
BQ.1.1 peut également être responsable de la plupart des infections au covid-19 en Afrique. Cette sous-variante a déjà été découverte au Nigeria en juillet. Parce que les pays africains ne testent que dans une mesure limitée quelle variante prévaut, il est difficile de savoir quelle est la situation actuelle, dit Gerstung.
La propagation rapide de la sous-variante est probablement due à six mutations dans le picprotéine, que le virus utilise pour pénétrer dans les cellules. Les vaccins utilisent cette protéine pour déclencher une réponse immunitaire.
Les premières études indiquent que les mutations de BQ.1.1 échappent à l’effet des vaccins et des infections antérieures. “Nous voyons une corrélation décente entre le nombre de mutations et leur taux de propagation”, explique Gerstung. “BQ.1.1 a l’un des plus grands nombres de mutations qui contournent le système immunitaire.” Ainsi, selon Pagel et Gerstung, le succès de BQ.1.1 est dû à sa capacité à échapper à l’immunité existante, plutôt qu’à sa supériorité pour infecter les cellules.
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XBB en Asie
Une autre sous-variante d’omikron, XBB, est active en Inde. XBB y a été identifié pour la première fois et est désormais responsable d’un tiers des infections signalées. ‘De tous les courants [sub]variantes, BQ.1.1 et XBB semblent être celles qui peuvent battre le reste », déclare Pagel.
XBB s’est rapidement propagé de l’Inde à Singapour, où – avec son descendant XBB.1 – il a déclenché une vague de contamination qui a culminé à la mi-octobre. La sous-variante se répand maintenant dans le reste de l’Asie. Du 3 au 9 octobre, XBB représentait 1,3 % des cas enregistrés auprès du GISAID. La sous-variante a maintenant été établie dans 35 pays.
XBB est issu d’une soi-disant recombinaison, dans laquelle deux descendants de BA.2 ont infecté la même cellule et ont échangé du matériel génétique. Cela a abouti à une sous-variante hybride avec sept mutations visant à échapper à l’immunité. C’est plus que toute autre sous-variante.
Selon l’Organisation mondiale de la santé (OMS), il existe des preuves que les personnes qui avaient le covid-19 avant que l’omikron ne devienne dominant courent un risque plus élevé de développer une infection par XBB. nouvelle infection qu’avec d’autres sous-variantes.
Mélange
À ce jour, rien ne prouve que XBB ou BQ.1.1 soit un maladie plus grave que la variante originale d’omikron, selon l’OMS. Mais si vous êtes infecté par deux sous-variantes ou plus en même temps, le risque de maladie grave peut augmenter. La plus grande préoccupation, cependant, est que la recombinaison crée de nouvelles mutations qui peuvent déclencher de violentes vagues de Covid-19.
Il n’est pas clair si une infection XBB protège contre BQ.1.1, ou vice versa. Les deux sous-variantes ont des mutations très différentes, dit Gerstung. «Mon opinion personnelle est que l’infection par BQ.1.1 devrait fournir une bonne immunité contre les formes ancestrales du virus (BA.2 et BA.5, éd.) qui sont étroitement liées à BQ.1.1. Mais XBB est très différent de BQ.1.1, il est donc difficile de dire s’il protège également contre d’autres sous-variantes.”
Bien que BQ.1.1 soit actuellement plus répandu que XBB, cela ne signifie pas que le premier effacera le second de la carte. “Il y a un scénario possible où ils se généralisent tous les deux”, dit Gerstung.
