Joan O’Brien, MD
Crédit : Penn Medicine
Une étude complète d’association multicohorte à l’échelle du génome (GWAS) auprès d’individus d’ascendance africaine a fourni de nouvelles informations sur les variantes génétiques ayant une signification physiopathologique pour le glaucome primitif à angle ouvert (GPAO), la forme la plus courante de la maladie héréditaire.1
Une équipe d’enquête composée d’ophtalmologistes et de chercheurs en génétique à l’origine du GWAS a détecté 46 loci à risque à l’échelle du génome significativement associés au glaucome. Les analyses de réplication et post-GWAS ont identifié deux variantes non décrites précédemment et une variante précédemment associée comme potentiellement causales pour le glaucome.
Cause majeure de cécité irréversible à l’échelle mondiale, le glaucome touche près de 44 millions de personnes, avec une prévalence projetée de 80 millions d’ici 2040.2 Les individus d’ascendance africaine sont souvent fréquemment et gravement touchés par la maladie héréditaire, mais la structure génétique de cette population a rarement été étudié.
“Les individus d’ascendance africaine sont cinq fois plus susceptibles d’être touchés par le glaucome et jusqu’à 15 fois plus susceptibles de subir une perte de vision ou de cécité due à la maladie par rapport aux individus d’ascendance européenne”, auteur correspondant Joan O’Brien, MD, directeur de le Penn Medicine Center for Genetics of Complex Disease, a expliqué dans un communiqué.3 « Nos traitements actuels pour cette maladie cécitante sont inadéquats, et la médecine de précision pourrait être appliquée si nous comprenions plus clairement la physiopathologie complète de cette neurodégénérescence héréditaire. »
Le GPAO peut survenir lorsque le drainage normal du liquide oculaire est bloqué et qu’une accumulation de pression intraoculaire (PIO) dans l’œil endommage le nerf optique et entraîne une perte de vision permanente.2 La perte de vision commence généralement dans la périphérie, suivie d’une perte dans le centre. champ de vision. Comme la maladie ne présente pas de symptômes précoces, des dommages permanents sont généralement déjà survenus au moment où la perte de vision est ressentie.
L’étude GWAS portait sur des données et des échantillons génétiques concernant 11 725 individus d’ascendance africaine, dont 6 003 cas de glaucome et 5 272 témoins, provenant de 3 ensembles de données sur la population africaine.1 Dans l’étude, les enquêteurs ont travaillé avec les dirigeants de la communauté noire et les stations de radio pour promouvoir l’importance du dépistage du glaucome. pour les personnes d’ascendance africaine. Les personnes inscrites au GWAS ont eu la possibilité de s’inscrire ou de se retirer de futures études.
Après le GWAS et d’autres analyses génétiques, les enquêteurs ont identifié deux nouvelles variantes génétiques impliquées dans la formation du glaucome. Les analyses de réplication et post-GWAS, y compris la cartographie fine fonctionnellement informée, la colocalisation de plusieurs traits et la validation in silico, ont impliqué les variantes rs1666698 (cartographie à DBF4P2) et rs34957764 (mappage vers ROCK1P1), comme cause probable.
L’analyse a également indiqué une troisième variante, rs11824032 (cartographie avec ARHGEF12), comme cause probable. Auparavant, la variante était associée au rapport cupule/disque dans une analyse de colocalisation génétique. Pour les individus d’ascendance africaine, le score de risque polygénique pour le GPAO issu de la méga-analyse s’est avéré supérieur à un GWAS beaucoup plus important dérivé d’individus d’ascendance européenne, ce qui suggère l’importance de la diversité dans la recherche génétique.
“Sans notre concentration sur ce groupe d’ascendance spécifique, ces informations uniques et critiques auraient pu rester perdues, et nous n’aurions pas été en mesure d’améliorer considérablement notre compréhension de la génétique derrière le GPAO dans cette population suraffectée”, Shefali Verma, PhD, assistante. professeur de pathologie et de médecine de laboratoire à l’Université de Pennsylvanie, a déclaré dans un communiqué.2
Sur la base de ces données, O’Brien et ses collègues visent à développer de meilleures méthodes de diagnostic précoce du glaucome pour un traitement précoce. L’amélioration du score de risque issue de cette analyse pourrait bénéficier à la fois aux décisions de dépistage et de traitement du glaucome avant qu’il n’entraîne une perte de vision.
« Nous travaillons maintenant avec les dirigeants communautaires pour nous aider à déterminer quelles autres maladies touchent de manière excessive cette population peu étudiée et sont de la plus grande importance pour un dépistage et une recherche plus approfondis », a déclaré O’Brien.2 « Nous partageons également notre base de données génétiques avec d’autres des chercheurs de départements et d’écoles qui étudient les maladies qui touchent de manière excessive les populations d’ascendance africaine.
Les références
2024-01-19 02:06:00
1705620818
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