Une étude montre que le virus COVID-19 peut être détecté

Des recherches menées par des scientifiques de l’Université de São Paulo (USP) au Brésil ont révélé que le coronavirus qui cause le COVID-19 peut être détecté dans les larmes recueillies par écouvillonnage. Un écouvillon est un tampon de coton absorbant sur une tige flexible utilisé pour nettoyer les plaies, appliquer des médicaments et prélever des échantillons.

Les chercheurs ont analysé des échantillons de patients diagnostiqués avec la maladie par des méthodes conventionnelles et admis à l’hôpital de réadaptation des anomalies craniofaciales (HRAC) géré par l’école dentaire de Bauru (FOB-USP). Le SRAS-CoV-2 a été détecté dans 18,2 % des échantillons, ce qui suggère que cette méthode pourrait être une alternative à l’écouvillonnage nasopharyngé, qui est désagréable, et que les agents de santé devraient prendre des mesures pour se protéger contre l’infection via les larmes des patients, bien que le risque soit certes faible.

De plus, une combinaison de deux facteurs – plus de comorbidités et un taux de mortalité plus élevé – chez les patients dont les échantillons de larmes ont été testés positifs suggère que cette méthode de détection du virus pourrait être un prédicteur du pronostic.

L’étude est rapportée dans un article publié dans le numéro de novembre 2022 du Journal de médecine clinique.

« Initialement, nous avons entrepris de développer un test de diagnostic basé sur une collecte plus facile du matériel sans causer d’inconfort au patient. L’écouvillonnage nasal et nasopharyngé est non seulement désagréable, mais aussi souvent effectué de manière incorrecte. Pour les personnes ayant une déviation de la cloison nasale, cela peut être un problème. Nous avons estimé que l’échantillonnage des déchirures serait facile à exécuter et plus tolérable. Nous avons réussi à montrer que cela était faisable. L’une des limites de l’étude était de ne pas savoir si la quantité de liquide prélevée pour le test influençait son résultat », Luiz Fernando Manzoni Lourençoneprofesseur de médecine au HRAC et dernier auteur de l’article, a déclaré à l’Agência FAPESP.

Les résultats suggèrent que la probabilité de détecter le virus dans les larmes est plus grande lorsque le patient a une charge virale élevée, ce qui peut entraîner une virémie dans les fluides corporels, a-t-il ajouté.

L’étude a été soutenue par la FAPESP via un bourse d’initiation scientifique attribué à Luis Expedito Sabageétudiant en licence encadré par Lourençone.

Technique

La cohorte de l’étude comprenait 61 patients hospitalisés, avec 28 tests négatifs et 33 positifs pour COVID-19 par RT-qPCR via un écouvillon nasopharyngé. Les larmes ont été analysées sur les 33 positifs et sur 14 des 28 négatifs. Les larmes ont été recueillies au cours du premier semestre 2021 lorsque les principales variantes virales circulant dans l’État de São Paulo étaient gamma et delta.

En plus de la collecte par écouvillonnage conjonctival, les scientifiques ont également utilisé une technique connue sous le nom de test de bandelette de Schirmer, dans laquelle une bandelette de papier filtre est placée pendant cinq minutes à l’intérieur de la paupière inférieure (normalement utilisée pour déterminer si l’œil produit suffisamment de larmes). Les échantillons ont été analysés entre juillet et novembre 2021.

Le SRAS-CoV-2 a été détecté dans 18,2 % des échantillons prélevés par écouvillonnage conjonctival et 12,1 % de ceux prélevés par bandelette de Schirmer. Comme prévu, aucun des patients qui ont été testés négatifs pour le virus via un prélèvement nasopharyngé n’a eu de larmes qui ont été testées positives.

L’indice de comorbidité de Charlson (CCI) a été utilisé pour prédire le risque de décès dans l’année suivant l’hospitalisation des patients atteints de 20 conditions spécifiques. Les patients avec des particules de SRAS-CoV-2 dans des échantillons de larmes avaient presque sept fois plus de chances de mourir que les patients avec un résultat négatif. Ces patients présentaient également d’autres facteurs susceptibles de contribuer au décès, tels qu’un faible taux de survie à dix ans basé sur l’ICC.

La plupart des patients avaient une faible production de larmes et une gêne oculaire quel que soit leur diagnostic de COVID-19, ce qui pourrait indiquer la nécessité d’utiliser des larmes artificielles pendant l’hospitalisation, selon les auteurs.

L’étude comprenait également des données démographiques, cliniques et sur les symptômes oculaires. Le principal test de diagnostic utilisé était la PCR quantitative en temps réel (réaction en chaîne par polymérase), qui peut détecter une seule copie d’ARN viral dans un échantillon et est considérée comme l’étalon-or pour diagnostiquer le COVID-19 par les laboratoires d’analyses cliniques du monde entier.

Innovante par rapport aux recherches précédentes, dans cette étude la positivité de l’ARN viral a été déterminée beaucoup plus précisément en analysant la nucléocapside (N), l’enveloppe (E) et l’ARN polymérase dépendante de l’ARN (RdRp).

Un article publié en juillet 2021 dans Biologie expérimentale et médecine par un groupe de chercheurs de l’École des sciences médicales de l’Université d’État de Campinas (FCM-UNICAMP), également dans l’État de São Paulo, a rapporté les résultats d’une étude menée dans son hôpital universitaire où le SRAS-CoV-2 a été détecté dans des échantillons de larmes de 8,43% des 83 patients inscrits à l’étude.

«Lorsque nous avons commencé, au début de 2021, nous n’avions pas la technologie pour croiser certains types de données comme une voie hors de la science fondamentale et vers la pratique clinique. Depuis lors, Sabage a travaillé comme stagiaire de recherche au Byers Eye Institute de l’Université de Stanford. [in the United States], un centre de premier plan pour les études avancées des fluides oculaires. Leur technologie nous a permis de détecter plusieurs corrélations et de confirmer la présence du SARS-CoV-2 dans nos échantillons de larmes. Le partenariat avec une autre équipe a apporté des résultats pour notre campus et a ouvert une nouvelle ligne de recherche », a déclaré Lourençone.

Le stage à Stanford était soutenu par la FAPESP.

Possibilités

Le groupe de recherche a maintenant commencé à travailler sur une nouvelle ligne qui se concentre sur la détection d’autres maladies virales au moyen de tests et d’analyses liés aux yeux. « De nombreux virus n’ont pas été suffisamment étudiés au Brésil. Nous voulons développer des solutions qui améliorent la qualité de vie des patients. Nous prévoyons d’analyser d’autres conditions virales qui deviennent systémiques », a-t-il déclaré.

À propos de la Fondation de recherche de São Paulo (FAPESP)

La Fondation de recherche de São Paulo (FAPESP) est une institution publique qui a pour mission de soutenir la recherche scientifique dans tous les domaines de la connaissance en accordant des bourses, des bourses et des subventions à des chercheurs liés à des établissements d’enseignement supérieur et de recherche de l’État de São Paulo, au Brésil. La FAPESP est consciente que la meilleure recherche ne peut se faire qu’en travaillant avec les meilleurs chercheurs au niveau international. Par conséquent, il a établi des partenariats avec des agences de financement, des établissements d’enseignement supérieur, des entreprises privées et des organismes de recherche d’autres pays connus pour la qualité de leurs recherches et a encouragé les scientifiques financés par ses subventions à développer davantage leur collaboration internationale. Vous pouvez en savoir plus sur la FAPESP sur www.fapesp.br/fr et visitez l’agence de presse FAPESP au www.agencia.fapesp.br/en pour se tenir au courant des dernières avancées scientifiques que la FAPESP contribue à réaliser grâce à ses nombreux programmes, prix et centres de recherche. Vous pouvez également vous abonner à l’agence de presse FAPESP sur http://agencia.fapesp.br/subscribe.

Clause de non-responsabilité: AAAS et EurekAlert ! ne sont pas responsables de l’exactitude des communiqués de presse publiés sur EurekAlert! par les institutions contributrices ou pour l’utilisation de toute information via le système EurekAlert.