Une étude récente publiée dans la revue Génétique de la nature il a été rapporté que les facteurs de risque génétiques de la grippe et de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) sont distincts.
La grippe et la COVID-19 sont des maladies respiratoires causées par le virus de la grippe et le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) et partagent des facteurs de risque et des symptômes cliniques. Cependant, l’étendue de leur étiologie génétique commune reste incertaine car les facteurs de risque génétiques de l’hôte pour la COVID-19 sont bien caractérisés, mais pas pour la grippe. L’identification de facteurs de risque génétiques communs pourrait révéler des cibles pour traiter ou prévenir les deux infections.
Étude: Les facteurs de risque génétiques de la COVID-19 et de la grippe sont largement différents. PhotoRedHeart / Shutterstock
L’étude et les résultats
Dans la présente étude, les chercheurs ont cherché à savoir si la COVID-19 et la grippe avaient une étiologie génétique commune. Tout d’abord, une étude d’association génomique (GWAS) de la grippe a été réalisée sur les données de plus de 296 000 participants à l’étude COVID-19 d’AncestryDNA pour explorer comment les mêmes facteurs génétiques influencent le risque de grippe et de COVID-19.
Parmi ces personnes, 6,2 % ont déclaré avoir été infectées par la grippe et ont été classées comme cas. Le reste de la population a servi de témoin, dont environ 24 000 personnes ayant obtenu des résultats négatifs. Ensuite, l’équipe a évalué les associations entre 10 millions de variants courants et a signalé une infection grippale dans trois groupes ancestraux.
Une méta-analyse des résultats sur plusieurs ascendances a identifié deux loci associés à la grippe signalée à proximité de la β-1,3-galactosyltransférase 5 (B3GALT5) et ST6 β-galactoside α-2,6-sialyltransférase 1 (ST6GAL1) sur les chromosomes 3q27.3 et 21q22.2, respectivement. Les résultats de l’étude GWAS sur la grippe ont été utilisés pour évaluer si la grippe et les infections par le SRAS-CoV-2 partagent une étiologie génétique. À cette fin, ils se sont concentrés sur 24 variants associés à la COVID-19 signalés par la Host Genetics Initiative.
Une seule variante, rs505922 dans le système transférase ABO du groupe sanguin histopathologique (ILS), était associée à la grippe ; la variante réduisait le risque de COVID-19 mais augmentait le risque de grippe. L’absence d’associations directionnelles cohérentes et significatives entre les loci de la grippe et de la COVID-19 suggérait peu ou pas de facteurs de risque génétiques partagés entre les deux maladies. D’autres analyses ont été réalisées pour évaluer si les associations avec la grippe étaient reproductibles et robustes.
L’exclusion de plus de 253 800 personnes pour lesquelles il manquait des données sur les tests de grippe de la cohorte AncestryDNA n’a pas eu d’effet sur les estimations de la taille de l’effet pour l’un ou l’autre locus. En revanche, définir la grippe en fonction du fait que les participants ont signalé des symptômes pseudo-grippaux a atténué la taille de l’effet, même si ces derniers sont restés significatifs. En outre, pour évaluer la reproductibilité, des dossiers médicaux ont été consultés pour définir le statut grippal à vie de 1,15 million de participants provenant de sept biobanques de cinq ascendances.
Les chercheurs ont identifié que seulement 2 % étaient des cas, alors que 1,13 million de personnes (témoins) n’avaient pas de dossier médical de grippe à vie. Une méta-analyse a révélé des associations significatives et cohérentes à l’échelle du génome avec B3GALT5 et ST6GAL1. De plus, deux mesures de grippe récente ont corroboré ces associations. Des associations significatives ont été mises en évidence avec une culture positive de grippe A (indiquant une infection actuelle) dans une cohorte de plus de 82 000 personnes.
Quatre gènes, l’adiponectine (ADIPOQ), membre 5 de la superfamille des immunoglobulines (IGSF5), B3GALT5et ST6GAL1ont été priorisés en fonction du déséquilibre de liaison élevé entre chaque variante, des variantes chevauchantes d’amplificateurs et des loci de caractères quantitatifs d’expression sentinelle. L’analyse des variantes faux-sens et de perte de fonction (via le séquençage de l’exome) n’a révélé aucune association significative. Cependant, une variante faux-sens dans IGSF5 était associé à un risque accru de 9,2 fois de grippe dans le dossier médical.
Enfin, in vitro Des expériences ont été réalisées pour examiner les effets de la réduction de l’expression des gènes sur l’infectiosité du virus de la grippe H1N1 dans les lignées cellulaires Calu-3 et A549, en se concentrant sur deux gènes effecteurs probables : B3GALT5 et ST6GAL1. ST6GAL1 Le knockdown a réduit l’infectiosité de la grippe d’environ 50 %, tandis que B3GALT5 L’élimination n’a pas été associée à un effet cohérent sur l’infectiosité.
Conclusions
Dans l’ensemble, les résultats indiquent que les architectures génétiques de la grippe et de la COVID-19 sont largement distinctes. L’équipe a identifié des loci significatifs à l’échelle du génome pour la grippe et a montré que ST6GAL1 l’inhibition diminue l’infectiosité in vitroLes limites de l’étude comprennent une mauvaise classification du phénotype, l’utilisation du statut grippal autodéclaré, une souche grippale indéterminée et des effets de confusion dus à des facteurs de risque de grippe non mesurés.
2024-08-07 05:45:00
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