Utiliser des bactéries pour lutter contre les champignons qui endommagent les cultures d’avocats et de fruits de la passion

En plus d’être riches et nutritifs, le « fruit de la passion » (fruit de la passion) et « l’or vert » (avocat) représentent un facteur important de développement économique et social dans certaines zones géographiques, comme l’Arauca en Colombie, et sont une source des revenus importants pour les petits et moyens agriculteurs qui diversifient la production agricole de la région, traditionnellement dominée par l’élevage et les cultures extensives comme le riz et le maïs.

Cependant, les champignons Colletotrichum sp. et Fusarium sp., ennemis silencieux de ces cultures, représentent une menace sérieuse pour l’avenir de la production. Alors que le premier provoque l’anthracnose, attaquant les feuilles, les tiges et les racines, générant des taches et des pourritures qui affaiblissent la plante et affectent la qualité du fruit, le second génère le redoutable flétrissement vasculaire, une sorte de barrière qui empêche l’écoulement de l’eau et des nutriments vers les feuilles, provoquant leur flétrissement et, dans les cas graves, la mort de la plante.

Dans ce scénario, la science apparaît comme une alliée à la fois pour comprendre ce que sont ces phytopathogènes et comment ils agissent et pour rechercher des alternatives qui apportent une solution efficace et durable à ce problème inquiétant. Une équipe multidisciplinaire de chercheurs des campus Orinoquia et Bogotá de l’Université nationale de Colombie (UNAL), en alliance avec l’entreprise Aitia Biotech, s’est chargée de rechercher quels sont les principaux ennemis fongiques du fruit de la passion et de l’avocat, protagonistes de la chaîne du fruit. production de la région.

« Les champignons Colletotrichum sp. et Fusarium sp. “Ils atteignent un stade maximum de sporulation, ce qui signifie qu’ils sont au sommet de leur maturation et peuvent provoquer la mort de la plante”, explique le professeur Carolina Chegwin Angarita, de la Faculté des sciences de l’UNAL, l’une des chercheuses de l’alliance BioAguaMara. , et précise que “c’est pourquoi il est important de rechercher des stratégies de contrôle, étant donné qu’elles ont une grande capacité de reproduction”.

Dans la première étape de l’étude, une caractérisation exhaustive des fruits sains et malades a été réalisée. Pour ce faire, des extractions ont été réalisées avec différents solvants, suivies d’un profilage chimique, avec lequel différents composants ont été identifiés et comparés pour découvrir comment le profil est affecté par la présence du micro-organisme.

Une autre partie du travail a consisté à évaluer l’activité antioxydante du fruit de la passion et de l’avocat. Il s’agit de composés synthétisés par les plantes dans leurs différentes parties (fruits, feuilles, branches, racines, etc.) qui leur confèrent des caractéristiques naturelles, les préservent et qui, lorsqu’ils sont ingérés, protègent largement et efficacement la santé du consommateur, en empêchant le développement de des maladies telles que le cancer et les processus neurodégénératifs.

Les résultats ont montré qu’ils possèdent un grand potentiel antioxydant, ce qui en fait une source naturelle de grande valeur pour la santé et le développement futur de produits cosmétiques, par exemple.

Une phase de la recherche a consisté à isoler 20 champignons d’avocat et 9 champignons de fruit de la passion. « Les micro-organismes ont été placés dans des boîtes de Pétri dans un milieu de culture PDS et conservés à l’obscurité dans un incubateur à 25 degrés Celsius. Nous avons constaté qu’au bout de 7 à 10 jours ils avaient déjà envahi la boîte», raconte l’enseignante. Ainsi, ils ont été isolés et identifiés à l’aide de techniques de microbiologie moléculaire, adaptées à la détermination de celles présentes dans les cultures, qui comprenaient l’extraction et le séquençage de l’ADN.

Stratégies pour les combattre

Además de encontrar los principales responsables de los daños en maracuyá y aguacate, los investigadores determinaron alternativas naturales que ayuden a controlar los hongos, para lo cual hoy se emplean diferentes fungicidas compuestos por productos químicos que, aunque son eficientes, son tóxicos y tienen implicaciones para la santé.

Une stratégie est le biocontrôle, ou contrôle biologique, qui repose sur l’utilisation de micro-organismes bénéfiques tels que les bactéries marines, les champignons endophytes (ils vivent à l’intérieur des tissus végétaux sans causer de dommages) et les champignons macromycètes (champignons), ennemis naturels des phytopathogènes, car ils contrôler leur croissance et leur développement sans affecter les cultures.

Les champignons nuisibles qui affectent les cultures affrontent les micro-organismes pour déterminer lequel attaque le mieux le ravageur. (Photo : Alliance BioAguaMara)

Dans l’étude, les gentils ont été mélangés aux méchants dans une boîte de Pétri avec un milieu de culture PDA, un scénario de confrontation idéal. « Nous avons observé que dans certains cas, le champignon phytopathogène se développe même sur l’autre micro-organisme. “Dans d’autres échantillons, nous avons vu que lorsque le micro-organisme bénéfique ne peut pas se défendre, il produit différents composés lors de la confrontation.”

« Ce qui est intéressant dans ces expériences, c’est que nous voyons comment, au cours du processus, les micro-organismes bénéfiques créent une sorte de barrière qui permet aux micro-organismes nuisibles de continuer à se développer, ce que l’on appelle le « processus d’antibiose », explique le chercheur.

Enfin, il mentionne que « nous travaillons toujours à identifier la bactérie qui déclenche l’effet le plus intéressant sur Colletotrichum sp. et Fusarium sp. Le résultat servira à avancer vers une deuxième phase de recherche, au cours de laquelle des prototypes de produits antifongiques se matérialiseront.

« Cela implique d’ajuster les conditions de culture pour optimiser la production de composés bioactifs et de concevoir des formulations appropriées pour les appliquer sur le terrain et dans des produits commerciaux. (Source : Agence de presse UNAL)